-
PacBio-Rêzkirina Amplîkonên 16S/18S/ITS yên bi dirêjahiya tevahî
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) bi salan ezmûna di analîza projeyên cihêrengiya mîkrobî de hatiye pêşxistin, ku analîza bingehîn a standardkirî û analîza kesane dihewîne: analîza bingehîn naveroka analîza sereke ya lêkolîna mîkrobî ya heyî vedihewîne, naveroka analîzê dewlemend û berfireh e, û encamên analîzê bi şiklê raporên projeyê têne pêşkêş kirin; Naveroka analîza kesane cihêreng e. Nimûne dikarin li gorî rapora analîza bingehîn û armanca lêkolînê bi nermî werin hilbijartin û parametre dikarin werin danîn, da ku hewcedariyên kesane pêk werin. Pergala xebitandinê ya Windows, hêsan û bilez.
-
PacBio-Transkriptoma Tevahî-dirêj (Ne-Referans)
Ev Sepan, bi wergirtina daneyên rêzkirina Isoformê yên Pacific Biosciences (PacBio) wekî têketinê, dikare rêzikên transkriptê yên tevahî-dirêj (bêyî komkirinê) nas bike. Bi nexşekirina rêzikên tevahî-dirêj li hember genoma referansê, transkript dikarin ji hêla genên naskirî, transkript, herêmên kodkirinê û hwd. ve werin çêtir kirin. Di vê rewşê de, naskirina rasttir a avahiyên mRNA, wekî splicing alternatîf û hwd., dikare were bidestxistin. Analîza hevbeş bi daneyên rêzkirina transkriptomê yên NGS re rê dide şîrovekirinek berfirehtir û hejmartina rasttir di îfadeyê de di asta transkriptê de, ku bi giranî sûdê dide îfadeya cûda ya jêrîn û analîza fonksiyonel.
-
Amûrên Bikaranînê
BMKCloud platformek biyoenformatîkî ya pêşeng e ku çareseriyek yek-rawestî ji bo bernameyên genomîk peyda dike, ku ji hêla lêkolînerên di warên cûrbecûr de, di nav de bijîşkî, çandinî, jîngeh û hwd. de, pir tê bawer kirin. BMKCloud pabend e ku karûbarên yekgirtî, pêbawer û bibandor peyda bike, di nav de platform û amûrên analîza biyoenformatîkî, çavkaniyên hesabkirinê, databasa giştî, qursên serhêl ên biyoenformatîkî û hwd. BMKCloud gelek amûrên biyoenformatîkî yên ku pir caran têne bikar anîn hene, di nav de şîrovekirina genan, amûrên genetîkî yên evolusyonî, ncRNA, kontrola kalîteya daneyan, civandin, hevrêzkirin, derxistina daneyan, mutasyon, îstatîstîk, jeneratorê hejmaran, analîza rêzê û hwd.
-
RNAya biçûk
RNAyên biçûk cureyekî RNAyên kurt û nekodker in ku bi dirêjahiya navînî 18-30 nt in, di nav wan de miRNA, siRNA û piRNA hene. Bi awayekî girseyî hatiye ragihandin ku ev RNAyên biçûk di gelek pêvajoyên biyolojîkî de wekî hilweşîna mRNA, astengkirina wergerandinê, çêbûna heterokromatînê, û hwd. beşdar in. Analîza rêzkirina RNAyên biçûk bi berfirehî di lêkolînên li ser pêşkeftina ajal/nebatan, nexweşî, vîrus, û hwd. de hatiye sepandin. Platforma analîza rêzkirina RNAyên biçûk ji analîza standard û derxistina daneyên pêşkeftî pêk tê. Li ser bingeha daneyên RNA-rêzik, analîza standard dikare naskirin û pêşbîniya miRNA, pêşbîniya gena hedef a miRNA, analîza şîrovekirin û îfadeyê bi dest bixe. Analîza pêşkeftî lêgerîn û derxistina miRNA ya xwerû, çêkirina diyagrama Venn, avakirina tora miRNA û gena hedef gengaz dike.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS platformek analîza ji nû ve rêzkirina tevahiya genomê ye, ku li ser bingeha ezmûna dewlemend di Teknolojiyên Biomarker de hatiye pêşxistin. Ev platforma hêsan-bikaranîn dihêle ku bi tenê çend parametreyên bingehîn, ku ji bo daneyên rêzkirina DNA-yê yên ku ji hem platforma Illumina û hem jî platforma rêzkirina BGI-yê têne çêkirin, bi lez û bez werin şandin, herikîna xebatê ya analîzek yekgirtî were şandin. Ev platform li ser serverek hesabkirina performansa bilind tê bicîh kirin, ku analîza daneyên pir bi bandor di demek pir sînorkirî de hêzdar dike. Kolandina daneyên kesane li ser bingeha analîza standard heye, di nav de lêpirsîna gena mutasyonkirî, sêwirana primera PCR, û hwd.
-
mRNA (Referans)
Transkrîptom girêdana di navbera agahdariya genetîkî ya genomîk û proteoma fonksiyona biyolojîk de ye. Rêkxistina asta transkrîpsiyonê awayê rêkxistina organîzmayan ê herî girîng û herî berfireh lêkolînkirî ye. Rêkxistina transkrîptomê dikare transkrîptomê di her kêliyê de an di bin her şert û mercî de, bi çareseriyek rast a yek nukleotîdê, rêz bike. Ew dikare asta transkrîpsiyona genê bi awayekî dînamîk nîşan bide, di heman demê de transkrîptên kêm û normal nas bike û bipîve, û agahdariya avahîsaziyê ya transkrîptên taybetî yên nimûneyê peyda bike.
Niha, teknolojiya rêzkirina transkrîptoman bi berfirehî di agronomî, bijîşkî û warên din ên lêkolînê de tê bikar anîn, di nav de rêziknameya pêşkeftina ajalan û nebatan, adaptasyona jîngehê, têkiliya îmmûn, cihgirtina genan, pêşveçûna genetîkî ya cureyan û tespîtkirina nexweşiyên tumor û genetîkî.
-
Metagenomîk (NGS)
Ev platforma analîzê ji bo analîza daneyên metagenomîk ên bi çekên otomatîk li ser bingeha ezmûna bi salan hatiye sêwirandin. Ew ji herikîna xebatê ya yekgirtî pêk tê ku cûrbecûr analîzên metagenomîk ên ku bi gelemperî hewce ne dihewîne, di nav de pêvajoya daneyan, lêkolînên asta cureyan, lêkolînên asta fonksiyona genan, komkirina metagenomê, û hwd. Wekî din, amûrên kolandina daneyên xwerû li ser herikîna xebatê ya analîza standard hene, di nav de lêpirsîna gen û cureyan, danîna parametreyan, çêkirina fîgurên kesane, û hwd.
-
LncRNA
RNAyên dirêj ên ne-kodker (lncRNA) cureyek transkrîptên bi dirêjahiya ji 200 nt dirêjtir in, ku nikarin proteînan kod bikin. Delîlên berhevkirî nîşan didin ku piraniya lncRNAyan pir îhtîmal e ku fonksiyonel bin. Teknolojiyên rêzkirina bi rêjeya bilind û amûrên analîzkirina biyoenformatîkî me hêzdar dikin ku em rêzikên lncRNA û agahdariya pozîsyonê bi bandortir eşkere bikin û me ber bi kifşkirina lncRNAyên bi fonksiyonên rêziknameyê yên girîng ve dibin. BMKCloud bi serbilindî platforma analîzkirina rêzkirina lncRNA ji xerîdarên xwe re peyda dike da ku analîza lncRNA ya bilez, pêbawer û nerm bi dest bixe.
-
GWAS
Lêkolîna komeleya seranserê genomê (GWAS) armanc dike ku guhertoyên genetîkî (genotîp) yên ku bi taybetmendiyên taybetî (fenotîp) ve girêdayî ne nas bike. Lêkolînên GWA nîşankerên genetîkî li seranserê genomê hejmareke mezin ji kesan vedikolin û bi analîza îstatîstîkî li ser asta nifûsê têkiliyên genotîp-fenotîp pêşbînî dikin. Ji nû ve rêzkirina tevahiya genomê dikare bi potansiyelî hemî guhertoyên genetîkî kifş bike. Bi hevgirtina daneyên fenotipîk, GWAS dikare were pêvajo kirin da ku SNP, QTL û genên namzed ên têkildarî fenotipê nas bike, ku bi tundî piştgirî dide çandina heywan/nebatan a nûjen. SLAF stratejiyek rêzkirina genomê ya hêsankirî ya xwe-pêşkeftî ye, ku nîşankerên belavbûyî yên seranserê genomê, SNP, kifş dike. Ev SNP, wekî nîşankerên genetîkî yên molekulî, dikarin ji bo lêkolînên komeleyê bi taybetmendiyên hedefgirtî re werin pêvajo kirin. Ew stratejiyek lêçûn-bandor e di destnîşankirina taybetmendiyên tevlihev ên têkildarî guhertoyên genetîkî.
-
Transkriptomîkên Nanopore yên Tamdirêj
Îzoformên alternatîf ên tevlihev û guhêrbar di organîzmayan de mekanîzmayên genetîkî yên girîng in ji bo rêkxistina îfadeya genan û cihêrengiya proteînan. Nasîna rast a avahiyên transkriptê bingeha lêkolînek kûr a qalibên rêkxistina îfadeya genan e. Platforma rêzkirina Nanopore lêkolîna transkriptomîk bi serkeftî gihandiye asta îzoformê. Ev platforma analîzê ji bo analîzkirina daneyên RNA-Seq ên ku li ser platforma Nanopore li ser bingeha genoma referansê hatine çêkirin hatiye sêwirandin, ku analîzên kalîteyî û hejmarî hem di asta genan de û hem jî di asta transkriptan de pêk tîne.
-
RNAya dorhêl
RNAya dorhêlî (circRNA) cureyekî RNAya ne-kodker e, ku vê dawiyê hatiye dîtin ku di torên rêkûpêk ên ku di pêşveçûn, berxwedana jîngehê û hwd de beşdar in de roleke girîng dilîzin. Ji molekulên RNAya xêzik cuda, mînak mRNA, lncRNA, dawiya 3′ û 5′ ya circRNA bi hev re têne girêdan da ku avahiyek dorhêlî çêbikin, ku wan ji helandina eksonukleazê diparêze û ji piraniya RNAya xêzikî stabîltir in. Hatiye dîtin ku CircRNA di rêkxistina îfadeya genê de fonksiyonên cihêreng hene. CircRNA dikare wekî ceRNA tevbigere, ku bi awayekî reqabetê bi miRNA ve girêdide, ku wekî sifinca miRNA tê zanîn. Platforma analîza rêzkirina CircRNA analîza avahî û îfadeya circRNA, pêşbîniya armancê û analîza hevbeş bi celebên din ên molekulên RNA re hêzdar dike.
-
BSA
Platforma Analîza Veqetandina Komkirî ji analîza standard a yek-gavî û analîza pêşkeftî bi mîhengkirina parametreyên xwerû pêk tê. BSA teknîkek e ku ji bo destnîşankirina bilez a nîşankerên genetîkî yên bi fenotipê ve girêdayî tê bikar anîn. Herikîna karê sereke ya BSA ev in: 1. hilbijartina du komên kesan bi fenotipên pir dijber; 2. komkirina DNA, RNA an SLAF-seq (ji hêla Biomarker ve hatî pêşve xistin) ya hemî kesan ji bo avakirina du komên DNA; 3. destnîşankirina rêzikên cûda li hember genoma referansê an di navberê de, 4. pêşbînîkirina herêmên girêdayî namzet bi algorîtmaya ED û SNP-index; 5. Analîz û dewlemendkirina fonksiyonel li ser genan li herêmên namzet, hwd. Kolandina daneyan a pêşkeftîtir, di nav de ceribandina nîşankerên genetîkî û sêwirana primer jî hene.
-
Amplîkon (16S/18S/ITS)
Platforma Amplicon (16S/18S/ITS) bi salan ezmûna di analîza projeyên cihêrengiya mîkrobî de hatiye pêşxistin, ku analîza bingehîn a standardkirî û analîza kesane dihewîne: analîza bingehîn naveroka analîza sereke ya lêkolîna mîkrobî ya heyî vedihewîne, naveroka analîzê dewlemend û berfireh e, û encamên analîzê bi şiklê raporên projeyê têne pêşkêş kirin; Naveroka analîza kesane cihêreng e. Nimûne dikarin li gorî rapora analîza bingehîn û armanca lêkolînê bi nermî werin hilbijartin û parametre dikarin werin danîn, da ku hewcedariyên kesane pêk werin. Pergala xebitandinê ya Windows, hêsan û bilez.
