-
Analyza Komeleya Genome-wide
Lêkolîna komeleya berfireh a genomê (GWAS) armanc dike ku celebên genetîkî (jenotip) yên ku bi taybetmendiyên taybetî (fenotip) re têkildar in nas bike.Lêkolîna GWAS li ser nîşankerên genetîkî li seranserê genomê ya hejmareke mezin a kesan lêkolîn dike û ji hêla analîzên statîstîkî ve di asta nifûsê de têkiliyên genotype-fenotip pêşbîn dike.Ew bi berfirehî di lêkolînên li ser nexweşiyên mirovî û genên fonksiyonel ên li ser taybetmendiyên tevlihev ên heywanan an nebatan de hatî bikar anîn.
-
Plant / Animal Tevahiya Genom Sequencing
Ji nû ve rêzgirtina tevaya genomê, ku wekî WGS jî tê zanîn, hem mutasyonên hevpar û hem jî yên nadir li ser tevahiya genomê di nav wan de Polîmorfîzma Yekane Nukleotide (SNP), Jêbirina Tevgerê (InDel), Guhertoya Strukturê (SV), û Guherîna Hejmara Kopî (CNV) dide xuyakirin. ).SV ji SNP-an beşek mezin a bingeha guherînê pêk tînin û bandorek mezin li ser genomê dikin, ku bandorek girîng li ser organîzmayên zindî dike.Veguhastina dirêj-xwendin rê dide naskirina rasttir a perçeyên mezin û guheztinên tevlihev ji ber ku xwendina dirêj derbaskirina kromozomî li ser deverên tevlihev ên wekî dûbarekirina hevdemî, herêmên dewlemend-GC/AT, û herêmên hîper-guhêrbar pir hêsantir dike.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Genetics Evolutionary
Genetîka Pêşveçûyî karûbarek rêzgirtinê ya pakkirî ye ku ji bo peydakirina şîroveyek berfereh li ser agahdariya pêşkeftinê ya materyalên hatî dayîn li ser bingeha guheztinên genetîkî, di nav de SNP, InDels, SVs û CNV, hatî çêkirin.Ew hemî analîzên bingehîn ên ku ji bo danasîna guheztinên evolusyonê û taybetmendiyên genetîkî yên nifûsê hewce dike peyda dike, wek strukturên nifûsê, cihêrengiya genetîkî, têkiliyên fîlogenyiyê, hwd. Di heman demê de lêkolînên li ser herikîna genê jî dihewîne, ku texmîna mezinahiya nifûsa bi bandor, dema cihêbûnê hêz dike.
-
Genomîka Berawirdî
Genomîka berawirdî bi rastî tê wateya berawirdkirina rêzikên genom û strukturên celebên cihêreng.Ev dîsîplîn bi destnîşankirina strukturên rêzikan û hêmanên ku di nav cûreyên cûda de parastin an cihêreng kirin armanc dike ku peşveçûna celebê, fonksiyona genê, mekanîzmaya birêkûpêkkirina genê di asta genomê de eşkere bike.Lêkolîna genomîkî ya berawirdî ya tîpîk analîzên di malbata genê de, pêşkeftina peşveçûn, dubarekirina tevahî genomê, zexta bijartî, hwd.
-
Civîna Genome ya li ser bingeha Hi-C
Hi-C rêbazek e ku ji bo girtina veavakirina kromozomê hatiye çêkirin bi berhevkirina danûstendinên li ser bingeha nêzikbûnê û rêzgirtina berbi bilind.Tê bawer kirin ku tundiya van têkiliyan bi dûrbûna laşî ya li ser kromozoman re bi neyînî ve girêdayî ye.Ji ber vê yekê, daneyên Hi-C dikare kombûn, rêzkirin û rêgezkirina rêzikên berhevkirî di pêşnumayek genomê de rêve bike û wan li ser hejmareke diyarkirî ya kromozoman bihejîne.Di nebûna nexşeya genetîkî ya li ser nifûsê de, ev teknolojiyê kombûnek genom a asta kromozomê hêz dike.Her genomek yekane pêdivî bi Hi-C heye.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Plant / Animal De Novo Genome Rêzkirin
De Novorêzkirin bi nebûna genomeke referansê ve avakirina tevaya genomê cureyekê bi bikaranîna teknolojiyên rêzgirtinê, wek mînak PacBio, Nanopore, NGS, hwd.Pêşkeftina berbiçav di dirêjahiya xwendinê ya teknolojiyên rêzgirtinê yên nifşê sêyem de di berhevkirina genomên tevlihev de firsendên nû bi xwe re aniye, wekî yên bi heterozîgosîteya bilind, rêjeya zêde ya herêmên dubarekirî, polîploîd, hwd. Çareserkirina hêmanên dubare, herêmên bi naveroka GC-ya anormal û deverên din ên pir tevlihev.
Platform: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Platforma Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina Tevahiya Exome ya Mirovan
Rêzkirina tevahiyê exome (WES) ji bo tespîtkirina mutasyonên sedema nexweşiyê wekî stratejiyek rêzgirtina lêçûn-bandor tê hesibandin.Her çend exon tenê bi qasî 1.7% ji tevahiya genomê digire, ew rasterast profîla fonksiyonên proteîn ên tevahî temsîl dike.Di genoma mirovan de, hate ragihandin ku ji% 85 zêdetir mutasyonên têkildarî nexweşiyê li herêma kodkirina proteînê pêk tê.
BMKGENE bi stratejiyên cihêreng ên girtina eksonê re karûbarên rêzgirtina tevahiya exome ya mirovî ya berfireh û maqûl pêşkêşî dike da ku bigihîje armancên lêkolînê yên cihêreng.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
-
Rêzkirina Fragmenta Pêvekirî ya Taybet-Locus (SLAF-Seq)
Genotîpkirina bilind-berbiçav, nemaze li ser nifûsa mezin, di lêkolînên komeleya genetîkî de gavek bingehîn e, ku bingehek genetîkî ji bo vedîtina genê fonksiyonel, analîza pêşveçûnê, hwd peyda dike. Li şûna ji nû ve rêzgirtina genomê ya kûr, rêzgirtina genomê ya temsîlê kêm dike (RRGS ) ji bo kêmkirina lêçûna rêzkirinê ya her nimûneyê tête destnîşan kirin, di heman demê de ku karbidestiya maqûl li ser vedîtina nîşankera genetîkî biparêze.Ev bi gelemperî bi derxistina perçeya sînorkirinê di nav rêza mezinahiya diyarkirî de, ku jê re pirtûkxaneya nûneriya kêmkirî (RRL) tê binav kirin, tê bidestxistin.Rêzkirina perçeyên pêvekirî yên taybetî-locus (SLAF-Seq) stratejiyek xwe-pêşkeftî ye ji bo genotipkirina SNP bi an bê genomek referansê.
Platform: Platforma Illumina NovaSeq
