Rêzkirina RNA ya Prokaryotîk
Taybetmendî
● Pêvajoya nimûneya RNAyê kêmbûna rRNAyê û dû re amadekirina pirtûkxaneya RNAyê ya arasteyî pêk anî.
● Analîza biyoenformatîkî li ser bingeha hevrêzkirina bi genomek referansê re
● Analîz îfadeya genan û DEG-an dihewîne, lê di heman demê de avahiya transkriptê û analîza sRNA-yê jî dihewîne
Avantajên Xizmetê
●Kontrola Kalîteyê ya Bi HişkîEm xalên kontrolê yên bingehîn li hemû qonaxan bicîh tînin, ji amadekirina nimûne û pirtûkxaneyê bigire heya rêzkirin û biyoenformatîkê. Ev çavdêriya baldar radestkirina encamên bi kalîteya bilind a domdar misoger dike.
●Daneyên Rêzkirina Taybetî ya Zincîrê: ji ber ku amadekariya pirtûkxaneya RNA-yê arasteyî ye, ku naskirina transkrîptên dij-sens gengaz dike.
●Analîzek Temam Li Gorî Transkrîptomên Prokaryotîk Hatiye Çêkirin: lûleya biyoenformatîkî ne tenê analîza îfadeya genê, lê di heman demê de analîza avahiya transkrîptê jî vedihewîne, di nav de destnîşankirina operon, UTR û promoteran. Ew her weha analîza sRNA-yan jî vedihewîne, ango şîrovekirin û pêşbîniya avahiya duyemîn û hedefan.
●Piştgiriya Piştî FirotanêPabendbûna me ji temamkirina projeyê û pê ve jî bi heyameke xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan berdewam dike. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.
Pêdiviyên Nimûneyan û Radestkirin
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzkirinê | Daneyên pêşniyarkirî | Kontrola Kalîteyê |
| Pirtûkxaneya rêwerzîşî ya kêmkirî ya rRNA | Illumina PE150 | 1-2 Gb | Q30≥85% |
Pêdiviyên Nimûneyê:
| Têkelkirin (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijî | Linavketinî |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280=1.8-2.0 OD260/230=1.0-2.5 Gemarîbûna proteîn an DNAyê li ser jelê bi sînor an jî tune ye. | RIN≥6.5 |
Radestkirina Nimûneya Pêşniyarkirî
Qutî: Lûleya santrifûjê ya 2 ml (Foliya teneke nayê pêşniyarkirin)
Nimûneya nîşankirinê: Komkirin+dubarekirin mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Şandin:
1. Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne di nav kîsan de werin pak kirin û di nav qeşaya hişk de werin veşartin.
2. Lûleyên RNA-yê yên stabîl: Nimûneyên RNA-yê dikarin di lûleya stabîlkirina RNA-yê de (mînak RNAstable®) werin hişk kirin û di germahiya odeyê de werin şandin.
Herikîna Karê Xizmetê
Radestkirina nimûneyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Herikîna Karê Analîza Biyoenformatîkî
Analîza jêrîn vedihewîne:
● Kontrolkirina kalîteya daneyên xav
● Lihevhatina bi genomê referansê re
● Nirxandina Kalîteya Pirtûkxaneyê: Tesadufîbûna parçebûna RNA, mezinahiya têxe û têrbûna rêzkirinê
● Têbînîkirina fonksiyonel a genên kodkirinê yên pêşbînîkirî
● Analîza Derbirînê: Analîza Têkeliyê û Pêkhateya Sereke (PCA)
● Derbirîna Genê ya Cûda (DEG)
● Têbînîkirin û dewlemendkirina fonksiyonel a DEG-an
● Analîza sRNA: pêşbînîkirin, şîrovekirin, hedef, û pêşbînîkirina avahiya duyemîn
● Analîza Avahiya Transkrîptê: operon, pozîsyonên destpêkê û dawiyê, herêma Newergerandî (UTS), promoter, û analîza SNP/InDel
Têrkirina rêzkirinê
Têbînîkirina fonksiyonel a genên kodkirinê
Têkiliya di navbera nimûneyan de
Analîza Genên Derbirî yên Cûda (DEG)
Analîza dewlemendkirina fonksiyonel
şîrovekirina sRNA
Di vê weşana taybetî de pêşketinên ku ji hêla karûbarên rêzkirina mRNA ya tevahî ya Nanopore ya BMKGene ve têne hêsankirin vekolin.
Guan, CP û yên din. (2018) 'Guhertinên Transkrîptomê yên Gerdûnî yên Staphylococcus epidermidis-a Biyofîlm-Çêker Bersiva Alkaloidên Tevahî yên Sophorea alopecuroides',Kovara Mîkrobiyolojiyê ya Polonî, 67(2), r. 223. doi: 10.21307 / PJM-2018-024.
