Rêzkirina Bisulfîtê ya Nûneratiya Kêmkirî (RRBS)
Rêzkirina bisulfîtê ya bi temsîla kêmkirî (RRBS) xwe dispêre dewlemendkirina herêmên dewlemend ên giravên CpG bi rêya parçekirina MspI û dûv re hilbijartina mezinahiya perçeyên 200-500/600 bps. Di encamê de, tenê herêmên nêzîkî giravên CpG têne rêzkirin, lê yên ku giravên CpG yên dûr hene ji analîzê têne derxistin. Ev pêvajo, digel rêzkirina bisulfîtê, dihêle ku metîlasyona DNA-yê bi çareseriya bilind were tespîtkirin, û rêbaza rêzkirinê, PE150, bi taybetî li ser dawiya pêvekan disekine ne li ser navîn, ku bandora profîlkirina metîlasyonê zêde dike.
Ev teknîk di lêkolîna metîlasyona DNAyê de wekî alternatîfek bi arzanî û bi bandor ji bo Rêzkirina Bisulfîtê ya Tevahiya Genomê (WGBS) derketiye holê. Her çend WGBS bi lêkolîna tevahiya genomê bi çareseriya yekane têgihiştinên berfireh peyda dike jî, lêçûna wê ya bilind dikare bibe faktorek sînordar, ku RRBS bi analîzkirina bijartî ya beşek nûner a genomê vê dijwarîyê bi stratejîkî kêm dike. Ev rêbaz amûrek bêqîmet e ku lêkolîna metîlasyona DNAyê ya bi arzanî gengaz dike û zanîna mekanîzmayên epigenetîk pêş dixe.
Taybetmendiyên Xizmetê
● Rêzkirin li ser Illumina NovaSeq.
● Pêwîstî bi genomek referansê heye.
● DNAya Lambda ji bo şopandina karîgeriya veguherîna bisulfîtê tê bikar anîn.
● Karîgeriya helandina MspI jî tê şopandin.
● Ji bo nimûneyên nebatan du caran bi enzîmê dihele.
Avantajên Xizmetê
●Alternatîfek bi arzanî û bibandor ji bo WGBSEw dihêle ku analîz bi lêçûnek kêmtir û bi hewcedariyên nimûneyê yên kêmtir were kirin.
●Platforma Temam:Em ji pêvajoya nimûneyan bigire heya avakirina pirtûkxaneyê û rêzkirina rêzan bigire heya analîza biyoenformatîkê xizmetek yek-rawestî ya hêja peyda dikin.
●Pisporiya BerfirehEm di cûrbecûr cureyan de serkeftî ne. BMKGENE zêdetirî deh sal ezmûn, tîmek analîzê ya pir jêhatî, naveroka berfireh û piştgiriya piştî firotanê ya hêja tîne.
Taybetmendiyên Xizmetê
| Pirtûkxane | Stratejiya Rêzkirinê | Derana daneyên pêşniyarkirî | Kontrola kalîteyê |
| Pirtûkxaneya ku bi MspI hatiye helandin û bi Bisulfîtê hatiye dermankirin | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Veguherîna bisulfîtê > 99% Karîgeriya birrîna MspI > 95% |
Pêdiviyên Nimûneyê
| Têkelbûn (ng/µL) | Tevahî mîqdar (µg) |
| |
| DNAya genomîk | ≥ 30 | ≥ 1 | Hilweşîn an gemarbûna bi sînor |
Herikîna Karê Xizmetê
Radestkirina nimûneyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Analîza BI-yê ev tiştan dihewîne:
● Kontrolkirina kalîteya rêzkirina xav;
● Nexşerêkirin bo genoma referansê;
● Tesbîtkirina bingehên metîlkirî yên 5mC û destnîşankirina motîfan;
● Analîza belavbûna metîlasyonê û berawirdkirina nimûneyan;
● Analîza Herêmên Cûda yên Metîlkirî (DMR);
● Têbînîkirina fonksiyonel a genên ku bi DMR-an ve girêdayî ne.
Kontrola kalîteyê: karîgeriya helandinê (di nexşeya genomê de)
Kontrola kalîteyê: veguherîna bisulfîtê (di derxistina agahdariya metîlasyonê de)
Nexşeya metîlasyonê: Belavbûna metîlasyona 5mC li seranserê genomê
Berawirdkirina Nimûneyê: Analîza Pêkhateya Sereke
Analîza Herêmên Cûda yên Metîlkirî (DMR): nexşeya germê
Bi rêya berhevokeke weşanên bijartî, pêşketinên lêkolînê yên ku ji hêla karûbarên rêzkirina bîsulfîtê ya tevahiya genomê ya BMKGene ve têne hêsankirin, vekolin.
Li, Z. û yên din (2022) 'Ji nû ve bernamekirina rastbûna bilind bo şaneyên mîna Leydig bi rêya çalakkirina CRISPR û faktorên paracrine',Nexusê PNAS, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. û yên din (2023) 'Analîza metîlasyona DNA-yê ya li seranserê genomê li ser pêkhateya laş di cêwîyên monozîgot ên Çînî de',Kovara Ewropî ya Lêkolînên Klînîkî, 53(11), r. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. û yên din (2022) 'Metîlasyona DNA û rêjeya kemer-ran: lêkolînek têkiliyê ya li seranserê epigenomê li cêwîyên monozîgot ên Çînî',Kovara Lêkolînên Endokrinolojîk, 45 (12), rûpel 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
