Rêzkirina Fragmenta Pêvekirî ya Taybet-Locus (SLAF-Seq)
Details Service
Scheme Teknîkî
Herikîna xebatê
Avantajên Service
Karbidestiya vedîtina nîşankera bilind- Teknolojiya rêzgirtinê ya berbilind arîkariya SLAF-Seq dike ku bi sed hezaran etîketan di nav tevahiya genomê de kifş bike.
Kêm girêdayîbûna bi genomê- Ew dikare li ser cureyên bi genomek referansê an jî bêyî wê were sepandin.
Sêwirana nexşeya nerm- Yek-enzîm, du-enzîm, vejandina pir-enzîm û cûrbecûr enzîman, hemî dikarin bêne hilbijartin ku armanc an celebên lêkolînê yên cihêreng peyda bikin.Pêş-nirxandina di silico de ji bo misogerkirina sêwirana enzîmê ya çêtirîn tê bikar anîn.
Digestiya enzîmatîk bi bandor- Pêş-ceribandin ji bo xweşkirina şert û mercan hate kirin, ku ezmûna fermî aram û pêbawer dike.Karbidestiya berhevkirina perçeyan dikare ji% 95 bigihîje.
Etîketên SLAF bi rengek wekhev têne belav kirin- Etîketên SLAF di hemî kromozoman de heta radeya herî mezin bi rengek wekhev têne belav kirin, ku di her 4 kb de navînî 1 SLAF digihîje.
Dûrketina bi bandor ji dubareyan- Di daneyên SLAF-Seq de rêza dubarekirî ji% 5 kêmtir dibe, nemaze di celebên ku di asta bilind de dubare dibin, wek genim, misir, hwd.
Tecrubeya berfireh-Zêdetirî 2000 projeyên SLAF-Seq ên girtî yên li ser bi sedan cureyên ku nebat, memik, çûk, kêzik, zindewerên avî, hwd.
Pêvajoya xebata biyoinformatîk ya bixwe-pêşveçû- Karûbarek biyoinformatîk a yekbûyî ya ji bo SLAF-Seq ji hêla BMKGENE ve hate pêşve xistin da ku pêbawerî û rastbûna hilberîna paşîn piştrast bike.
Specifications Service
| Rawesta axaftevan | Pevçûn (ng/gl) | Bi tevahî (ug) | OD260/280 |
| Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Cild>15μl) | 1,6-2,5 |
Stratejiya Rêzkirina Pêşniyar kirin
Kûrahiya rêzgirtinê: 10X / Tag
| Mezinahiya Genome | Tags SLAF Pêşniyar kirin |
| < 500 Mb | 100K an WGS |
| 500 Mb- 1 Gb | 100 K |
| 1 Gb -2 Gb | 200 K |
| Genomên giant an tevlihev | 300 - 400 hezar |
| Applications
| Pêşniyar kirin Pîvana Nifûsê
| Stratejiya rêzgirtinê û kûrahî
| |
| Kûrî
| Hejmara Tag
| ||
| GWAS
| Hejmara nimûneyê ≥ 200
| 10X
|
Ligor mezinahiya genom
|
| Pêşkeftina Genetîkî
| Kesên her yek binkoma ≥ 10; tevahî nimûne ≥ 30
| 10X
| |
Pêşniyara Sample Delivery
Konteynir: 2 ml lûleya santrîfujê
Ji bo piraniya nimûneyan, em pêşniyar dikin ku di etanolê de neyê parastin.
Etîketkirina Nimûneyê: Pêdivî ye ku nimûne bi rengek zelal û bi forma agahdariya nimûneya pêşkêşkirî re bi rengek zelal bêne nîşankirin.
Barkirin: Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne pêşî di torbeyan de bêne pakij kirin û di qeşa hişk de bêne veşartin.
Xebata Xizmetê
Nimûne QC
Ezmûna pîlot
SLAF-ceribandin
Amadekirina Pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analysis Data
Xizmetên piştî firotanê
1. Statîstîkên encama nexşeyê
2. Pêşveçûna nîşankerê SLAF
3. Annotation Variation
| Sal | Rojname | IF | Nav | Applications |
| 2022 | Têkiliyên xwezayê | 17.694 | Bingeha genomî ya giga-kromozom û giga-jenoma peoniya darê Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
| 2015 | Fîtologê Nû | 7.433 | Şopên xwemalîbûnê herêmên genomîk ên girîngiya çandiniyê li xwe digire soya | SLAF-GWAS |
| 2022 | Kovara Lêkolînên Pêşkeftî | 12.822 | Têketinên çêkirî yên li seranserê genomê yên Gossypium barbadense li G. hirsutum ji bo başkirina hevdemî kalîte û berberiya fîbera pembû cihê bilindtir eşkere dike taybetiyên | SLAF-Evolutionary genetîk |
| 2019 | Plant Molecular | 10.81 | Analîza Genomîk a Nifûsê û Meclîsa De Novo Origin of Weedy eşkere dike Rice wekî Lîstikek Evolutionary | SLAF-Evolutionary genetîk |
| 2019 | Genetics Nature | 31.616 | Rêzeya genom û cihêrengiya genetîkî ya kerbeya hevpar, Cyprinus carpio | Nexşeya SLAF-Linkage |
| 2014 | Genetics Nature | 25.455 | Genoma fistiqê çandiniyê li ser karyotîpên leguman, polîploîd, têgihiştinê peyda dike pêşveçûn û xwedankirina çandiniyê. | Nexşeya SLAF-Linkage |
| 2022 | Kovara Biyoteknolojiya Nebatê | 9.803 | Nasnameya ST1 hilbijarkek bi otostopê ya morfolojiya tovê vedibêje û naveroka rûnê di dema kedîkirina soya de | pêşveçûna SLAF-Marker |
| 2022 | Kovara Navneteweyî ya Zanistên Molecular | 6.208 | Nasname û Pêşkeftina Nîşana DNA ji bo Genim-Leymus mollis 2Ns (2D) Cîgirkirina Kromozomên Disomîk | pêşveçûna SLAF-Marker |
