Rêzkirina Tevahiya Transkrîptomê - Illumina
Taybetmendî
● Çêkirina pirtûkxaneya dualî ji bo rêzkirina transkrîptoma tevahî: pirtûkxaneya kêmkirina rRNA û amadekirina pirtûkxaneya RNA ya piçûk.
● Analîza biyoenformatîk a temam a mRNA, lncRNA, circRNA û miRNA di raporên biyoenformatîk ên cuda de, û her weha analîzek hevbeş bi hemî îfadeyên RNA-yê re, tevî analîza torên ceRNA.
Avantajên Xizmetê
●Pisporiya BerfirehMe zêdetirî 2100 projeyên transkrîptomê yên tevahî pêvajo kirine, ku celebên nimûneyên cihêreng vedihewîne. Em dewlemendiya pisporiyê tînin her projeyekê.
●Kontrola Kalîteyê ya Bi HişkîEm xalên kontrolê yên bingehîn li seranserê hemî qonaxan bicîh dikin, ji amadekirina nimûneyê bigire heya amadekirina pirtûkxaneyê, rêzkirin û biyoenformatîkê. Çavdêriya me ya baldar radestkirina encamên bi kalîteya bilind a domdar misoger dike.
●Têbînîyeke BerfirehEm ji bo şîrovekirina fonksiyonel a Genên Cûda yên Derbirandî (DEG) û pêkanîna analîzên dewlemendkirinê yên têkildar, gelek databasan bikar tînin. Ev rêbaza berfireh têgihîştinê li ser pêvajoyên şaneyî û molekulî yên di bin bersiva transkrîptomê de peyda dike, û piştrast dike ku hûn hemî agahdariya gengaz li ser daneyên ceribandina xwe bistînin.
●Analîzek Kûr a Torên RêziknameyîAnalîza tora ceRNA bi rêzkirina hevbeş a mRNA, lncRNA, circRNA, û miRNA û bi rêbazeke xebatê ya biyoenformatîk a berfireh ve tê gengaz kirin.
●Piştgiriya Piştî FirotanêEm fêm dikin ku amadebûn çiqas girîng e, ji ber vê yekê pabendbûna me ji temamkirina projeyê bi heyamek xizmeta piştî firotanê ya 3 mehan dirêj dibe. Di vê demê de, em şopandina projeyê, alîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û rûniştinên Pirs û Bersîvê pêşkêş dikin da ku pirsên têkildarî encaman çareser bikin.
Pêdiviyên Nimûneyan û Radestkirin
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzkirinê | Daneyên pêşniyarkirî | Kontrola Kalîteyê |
| rRNA kêm bûye | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Mezinahî hat hilbijartin | Illumina SE50 | 10-20 milyon xwendin |
Pêdiviyên Nimûneyê:
Nukleotîd:
| Têkelkirin (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijî | Linavketinî |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Gemarîbûna proteîn an DNAyê li ser jelê bi sînor an jî tune ye. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindahiya bingehîn sînorkirî an tune |
Radestkirina Nimûneya Pêşniyarkirî
Qutî: Lûleya santrifûjê ya 2 ml (Foliya teneke nayê pêşniyarkirin)
Nimûneya nîşankirinê: Komkirin+dubarekirin mînak A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Şandin:
1. Qeşaya hişk: Pêdivî ye ku nimûne di nav kîsan de werin pak kirin û di nav qeşaya hişk de werin veşartin.
2. Lûleyên RNA-yê yên stabîl: Nimûneyên RNA-yê dikarin di lûleya stabîlkirina RNA-yê de (mînak RNAstable®) werin hişk kirin û di germahiya odeyê de werin şandin.
Herikîna Karê Xizmetê
Sêwirana ceribandinê
Radestkirina nimûneyê
Derxistina RNAyê
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîza daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Bîyoenformatîk
Li ser hemû analîzên li ser her yekê cuda, 4 celebên RNA-yê di analîza me ya hevbeş de têne hev kirin:
- Analîza hev-îfadekirinê di navbera hemî celebên cûda yên daneyên RNA-yê de
- Pêşgotina derbirîna RNAyê
- Pêşgotinek li ser îfadeyên cuda
- Tora CeRNA
- Genên sereke di rê de hatine entegrekirin
- Analîza parastinê
- Armanckirina têkiliyan
Pêşgotina derbirîna RNAyê
Genên bi awayekî cuda hatine îfadekirin
analîza ceRNA
miRNA-yên bi awayên cuda hatine îfadekirin û RNA-yên têkildar
Pêşketinên lêkolînê yên ku ji hêla karûbarên rêzkirina tevahiya transkrîptomê ya BMKGene ve bi rêya berhevokek weşanên bijartî têne hêsankirin, vekolin.
Dai, Y. û yên din. (2022) 'Profîlên berfireh ên îfadeya mRNA, lncRNA û miRNA di nexweşiya Kashin-Beck de ku bi rêzkirina RNA-yê ve hatine destnîşankirin',Omîkên Molekulî, 18(2), rûpel 154–166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan û yên din. (2022) 'Analîza transkrîptomên dirêjahiya tevahî ya berxwedana sermayê ya Apis cerana li Çiyayê Changbai di dema zivistanê de.'Gen, 830, r. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ û yên din. (2022) 'Pêşînîkirina Torên Rêkxistina RNA ya Endojen a Reqabetê li ser bingeha Entegrasyona Pir-Omîkan di Kansera Pişikê ya Hucreya Biçûk de: Taybetmendiyên Molekulî û Namzetên Dermanan',Sînorên di Onkolojiyê de, 12, rûp. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. û yên din (2022) 'Analîza yekgirtî ya profîlên îfadeya lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA têgihiştinên nû li ser mekanîzmayên potansiyel ên di bersiva nematodên girêka reh de di fistiqan de eşkere dike',BMC Genomics, 23(1), r. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/WÊNE/7.
Yan, Z. û yên din (2022) 'Rêzkirina RNA ya transkrîptoma tevahî mekanîzmayên molekulî yên têkildarî parastina kalîteya piştî çinînê di brokolî de bi tîrêjên LED yên sor ronî dike',Biyolojî û Teknolojiya Piştî Çinînê, 188, r. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
