Rêzkirina tevaya transkrîptomê - Illumina
Features
● Pirtûkxaneya dualî ji bo rêzkirina transkriptoma tevahî: kêmbûna rRNA li dû amadekirina pirtûkxaneya PE150 û hilbijartina mezinahiyê li dûv amadekirina pirtûkxaneya SE50
● Di raporên cihêreng ên biyoinformatics ên mRNA, lncRNA, circRNA û miRNA de analîza biyoinformatics
● Analîzek hevbeş a hemî îfadeya RNA di raporta hevgirtî de, tevî analîza torên ceRNA.
Avantajên Service
●Analîzek kûr a torên birêkûpêk: Analîzkirina torê ya ceRNA bi rêzgirtina hevbeş a mRNA, lncRNA, circRNA û miRNA û ji hêla xebatek biyoinformatîk a berfireh ve tê çalak kirin.
●Annotation Berfireh: Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel Genên Bi Ciyawazî Derbirkirî (DEG) şîrove bikin û analîza dewlemendkirina têkildar pêk bînin, li ser pêvajoyên hucreyî û molekulî yên ku di binê bersiva transkrîptomê de ne agahdarî peyda dikin.
●Pisporê Berfireh: digel tomarek serketî ya girtina zêdetirî 2000 projeyên tevahî transkriptome di warên cihêreng ên lêkolînê de, tîmê me ji her projeyê re ezmûnek dewlemendî tîne.
●Kontrola Kalîteyê ya hişk: Em xalên kontrolê yên bingehîn di hemî qonaxan de bicîh dikin, ji amadekirina nimûne û pirtûkxaneyê bigire heya rêzkirin û biyoinformatics.Vê çavdêriya berbiçav peydakirina encamên domdar ên bi kalîte misoger dike.
● Annotation Berfireh: Em gelek databasan bikar tînin da ku bi fonksiyonel Genên Bi Ciyawazî Derbirkirî (DEG) şîrove bikin û analîza dewlemendkirina têkildar pêk bînin, li ser pêvajoyên hucreyî û molekulî yên ku di binê bersiva transkrîptomê de ne agahdarî peyda dikin.
●Piştgiriya Post-Firotinê: Peymana me ji temamkirina projeyê bi heyama karûbarê piştî firotanê ya 3-mehî re dirêj dibe.Di vê demê de, em şopandina projeyê, arîkariya çareserkirina pirsgirêkan, û danişînên Q&A pêşkêşî dikin da ku her pirsek bi encaman ve girêdayî be.
Sample Requirements û Delivery
| Pirtûkxane | Stratejiya rêzgirtinê | Daneyên pêşniyar kirin | Kontrola Kalîteyê |
| rRNA kêm bûye | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Mezinahî hilbijartî | Illumina SE50 | 10-20 M dixwîne |
Pêdiviyên Nimûne:
Nukleotîd:
| Pevçûn (ng/μl) | Mîqdar (μg) | Paqijiyê | Linavketinî |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Li ser gêlê bi proteîn an ADN-ê bi sînorkirî an tune. | Nebat: RIN≥6.5 Heywan: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; bilindbûna bingehîn ya sînorkirî an tune |
Pêşniyara Sample Delivery
Têrr:
2 ml lûleya santrîfujê (Peldanka tin nayê pêşniyar kirin)
Etîketkirina nimûneyê: Kom + dubarekirin, mînak A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Barkirin:
1.Berşa hişk: Pêdivî ye ku nimûne di torbeyan de bêne pak kirin û di qeşa hişk de bêne veşartin.
2.Bûkên RNAstable: Nimûneyên RNA dikarin di lûleya stabilîzasyona RNA de bêne hişk kirin (mînak RNAstable®) û di germahiya odeyê de bêne şandin.
Xizmeta Kar Herikîna
Design Experiment
Sample delivery
Derxistina RNA
Avakirina pirtûkxaneyê
Rêzkirin
Analîzkirina daneyan
Xizmetên piştî firotanê
Bioinformatics
Pêşniyara îfadeya RNA
Genên bi Ciyawazî têne diyar kirin
analîzkirina ceRNA
MiRNA-yên cûda û RNA-yên têkildar têne diyar kirin
Pêşketinên lêkolînê yên ku ji hêla BMKGene 'karûbarên rêzgirtina transkriptomeya tevahî ve hatî hêsan kirin bi navgîniya berhevokek weşanan ve bigerin.
Dai, Y. et al.(2022) 'Profîlên derbirînê yên berfireh ên mRNA, lncRNA û miRNA di nexweşiya Kashin-Beck de ku ji hêla rêzgirtina RNA ve têne nas kirin', Molecular Omics, 18 (2), rûpel 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Analîzkirina transkrîptoma dirêj a berxwedana sar a Apis cerana li Çiyayê Changbai di heyama zivistanê de.', Gene, 830, rûp. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Pêşîtkirina Bingeha Yekbûna Pir-Omics ya Tora Rêvebiriya RNA ya Endogenous a Pêşbaz di Penceşêra Pişikê ya Hucreya Piçûk de: Taybetmendiyên Molekular û Namzetên Dermanan', Sînorên di Onkolojiyê de, 12, r.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Analîzasyona yekbûyî ya profîlên îfadeya lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA di bersivdayîna nematodên girêk ên di fistiqê de nihêrînên nû li ser mekanîzmayên potansiyel eşkere dike', BMC Genomics, 23 (1), rûpel 1-12.doi: 10.1186 / S12864-022-08470-3 / WÊNE / 7.
Yan, Z. û hwd.(2022) 'Rêzkirina RNA-ya tevahî-transkrîptomê mekanîzmayên molekulî yên ku bi domandina kalîteya postharvestê di brokolî de ji hêla tîrêjkirina LED-ya sor ve girêdayî ne ronî dike', Biyolojî û Teknolojiya Postharvest, 188, r.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
