Трансезаска жеткиликтүүлүктүн жетекчилиги үчүн Assay High Clectut Sectut (Atac-SEQ)
Кызмат өзгөчөлүктөрү
● кызматы ДНК-протеиндин өз ара аракеттенүүсүн сактоо үчүн, ткандардын үлгүлөрүн, анын ордуна кыртыштын үлгүлөрүн талап кылат.
● Атак методу, андан кийин нукюмдун изоляциясы, TN5 Дарылоо жана тазалоо, ПККнын амплитиясы, өлчөмүн тандоо жана ырааттуулукка ээ.
● Ильюмашиядагы Новазык
Кызматтын артыкчылыктары
●Жогорку сезимталдык:Жибитиканы даярдоо жана ырааттуулук үчүн клеткадан башталган баштапкы саны жетиштүү.
●Жогорку маалыматтуу техникасы: бир эле учурда ачык хроматин жана транскрипция фактору сыяктуу жигердүү ченемдик укуктук элементтердин геномдук жайларын жана жигердүү ченемдик элементтерди ачат.
●Жакшы эксперименталдык репродукция: Техникалык репликациялар мыкты кайталоолорду көрсөтөт.
●Кеңири экспертиза: Жүздөгөн ATAC 2015-жылдагы жүздөгөн статистин долбоорлору ийгиликтүү аяктады, БМКЖЕНЕК ӨТКӨНДӨГҮНДӨГҮ ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО ТАЗАЛОО КҮНДҮН АДАМДАР, МАЗМУНУ МАЗМУНУ ЖАНА МАЗМУНУ МАЗМУНУ КОЛДОНУЛГАН КОЛДОО.
●Транспорттук анализ менен кошулуу мүмкүнчүлүгү: ATAC SEQдин интеграцияланган анализине интеграцияланган анализге, мисалы, РНК-СЕК.
● Биоинформатикалык анализ: Хроматиндин ачык аймактарын жана алардын тиешелүү функциялары (промоутерлер, өйлөр, экзон, интрасттар), ошондой эле хроматин ачык аймактардын ортосундагы айырмачылыктарды талдоодо.
Кызмат мүнөздөмөлөрү
| Китепкана | Сезүү стратегия | Сунуш кылынган маалыматтардын чыгышы | Сапатты көзөмөлдөө |
| ATAC-SEQ | Illumina pe150 | > 20м окуйт Genome өлчөмүнө жараша (адам: 50 м окуйт) | Q30≥85% |
Үлгү талаптары
Үлгүлөр Түрү: Ткандардын, жандуу же тоңгон клеткалар, кан
● Уюлдук номери: ≥ 106клеткалар
● Ткань Салмагы: ≥ 200мг жаңы ткандар
● Кан: ≥ 4 мл
Кызматтын агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
ДНК казып алуу
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Маалыматтын сапатын контролдоо;
● Маалыматтык геномго картага негизделген чалуу;
● гендин чокусундагы жери боюнча ген;
● Мотиф талдоосу: Транскрипция факторун милдеттүү сайттарды аныктоо (TFBS);
● Дифференциалдык жогорку талдоо жана аннотация.
1.HeatMAP ATAC TSS жана чектеш аймактарда бөлүштүрүүнү окуйт (± 3 КБ)
2. Башка геном компоненттери боюнча ачык хроматин аймагынын ачылышы
3.Бул топтордун ортосунда чалуу
BMKGENE'S ATAC SEQACNCE кызматтарынын жардамы менен BMKGENE'S ATAC SEQACNCENCING SERVICTES тарабынан иштелип чыккан изилдөө иштерин изилдөө.
ФУ, А.et al.(2023) "Теломере-Теломере-Теломере Геномендин Геномили (Моморика Чанантия Л. Вар. Abbreviata ser.) Жемиш өнүгүүсүн, курамын жана бышып жетилген генетикалык мүнөздөмөлөрдү көрсөтөт",Horticulture Research, 10 (1). DOI: 10.1093 / HR / UHA228.
Гонг, Б.et al.(2023) "Секретариат киноштурасынын эпигенетикалык жана транскрептөөсү Glioma 'in Oncogene катары,Генетика жана геномика журналы, 50 (6), 422-433-бб. DOI: 10.1016 / J.JGG.2023.01.008.
Ал, Y.et al.(2023) "Бутират верроптоздун каршылыгын колоректалдык рак оорусуна каршылык көрсөтөт",Redox биология, 65, б. 102822. DOI: 10.1016 / J.redox.2023.102822.
