Бактериялардын толук геному
Кызматтын артыкчылыктары
● Ар кандай изилдөө максаттары үчүн бир нече иреттөө стратегиялары
● Бактериялардын толук геному 0 Gap кепилденет.
● 10 000ден ашык толук геномду чогултуу менен бактерия геномун түзүү боюнча тажрыйбалуу.
● Кесиптик сатуудан кийинки техникалык колдоо тобу конкреттүү изилдөө муктаждыктарын канааттандырат.
Кызмат спецификациялары
| СеквенциялооСтратегия | Китепкана | Сапатына кепилдик берилет | Болжолдуу айлануу убактысы |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Гап | 30 күн |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Биоинформатика анализи
● чийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө
● Геном жыйындысы
● Геном компоненттеринин анализи
● Ген функциясынын аннотациясы
● Салыштырмалуу геномдук анализ
Үлгү талаптары жана жеткирүү
Үлгү талаптары:
үчүнДНК экстракттары:
| Үлгү түрү | Суммасы | Концентрация | Тазалык |
| ДНК экстракттары | ＞ 2 мкг | ＞ 20 нг/мкл | OD260/280= 1,6-2,5 |
кыртыш үлгүлөрү үчүн:
| Үлгү түрү | Сунушталган үлгү дарылоо | Үлгү сактоо жана жөнөтүү |
| Бактериялар | микроскоп астында бактерияларды байкоо жана алардын экспоненциалдык фазасында бактерияларды чогултуу Бактерия маданиятын (болжол менен камтыган 3-4,5e9 клеткаларды) 1,5 же 2 мл эппендорфка өткөрүңүз.(Муз үстүндө кармаңыз) Бактерияларды чогултуу үчүн түтүктү 1 мүнөт 14000 г центрифугалаңыз жана үстүнкү затты кылдаттык менен алып салыңыз Түтүктү жабыңыз жана бактерияларды суюк азотто 30 мүнөттөн кем эмес тоңдуруңуз.Түтүктү -80 ℃ муздаткычта сактаңыз. | Үлгүлөрдү суюк азотто 3-4 саат тоңдуруңуз жана суюк азотто же -80 градуска чейин узак мөөнөткө сактаңыз.кургак муз менен үлгү жеткирүү талап кылынат. |
Кызматтын иш агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
1.Бактериялардын геномунун циркостору
2.Коддоочу генди болжолдоо
3. Салыштырмалуу геномика анализи: филогенетикалык дарак
