Бактериялык жана грибоктук бүт геномду кайра секвенирлөө
Бактериялык жана козу карындын бүт геномунун секвенирлөө долбоорлору микробдук геномдорду аяктоо жана салыштыруу аркылуу микробдук геномиканы өнүктүрүү үчүн маанилүү болуп саналат. Бул ферментация инженериясын, өнөр жай процесстерин оптималдаштырууну жана метаболизмдин экинчилик жолдорун изилдөөнү жеңилдетет. Мындан тышкары, козу карындардын жана бактериялардын ре-секвенциясы экологиялык адаптацияны түшүнүү, штаммдарды оптималдаштыруу жана генетикалык эволюциянын динамикасын ачуу үчүн абдан маанилүү, бул медицинада, айыл чарбасында жана экология илиминде кеңири мааниге ээ.
Кызматтын артыкчылыктары
●Биоинформатикалык талдоо Variant Calling камтыйт:Кайра тизилген геномдорго функционалдык түшүнүктөрдү берүү.
● Кеңири тажрыйба: Жыл сайын өткөрүлүүчү миңдеген микробдук кайра секвенирлөө долбоорлору менен биз он жылдык тажрыйбаны, жогорку квалификациялуу анализ тобун, ар тараптуу мазмунду жана сатуудан кийинки эң сонун колдоону алып келебиз.
●Сатуудан кийинки колдоо:Биздин милдеттенмебиз 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтү менен долбоордун аяктоосунан ашат. Бул убакыттын ичинде биз натыйжаларга байланыштуу суроолорду чечүү үчүн долбоордун артынан, көйгөйлөрдү аныктоо боюнча жардамды жана суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.
Кызмат спецификациялары
| Секвенирлөө платформасы | Секвенирлөө стратегиясы | Берилиштер сунушталат | Сапатты көзөмөлдөө |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Тереңдиги 100x | Q30≥85% |
Үлгү талаптары
| Концентрация (нг/мкл) | Жалпы сумма (нг) | Көлөмү (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Бактериялар: ≥1x107 клеткалар
Бир клеткалуу козу карындар: ≥5x106-1x107 клеткалар
Макро козу карындар: ≥4г
Кызматтын иш агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
Төмөнкү анализди камтыйт:
- Берилиштердин сапатын көзөмөлдөө
- Шилтеме геномуна тегиздөө
- Variant Чакыруу: SNP жана InDel
- Variant Annotation
Variant чалуу: SNP түрлөрү
Variant чалуу: InDel узундугун бөлүштүрүү
BMKGeneнин микробдук геномду ре-секвенсациялоо кызматтары тарабынан түзүлгөн жетишкендиктерди изилдеңиз.
Jia, Y. жана башкалар. (2023) 'Буудай эргежээл бунт үчүн ооруга туруктуулук гендерин скрининг үчүн транскриптомду жана бүт геномду кайра ырааттуулукту айкалыштыруу',Эл аралык молекулярдык илимдер журналы, 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Цзян, М. жана башкалар. (2023) "Ампициллин менен башкарылуучу глюкозанын метаболизми бактериялардагы толеранттуулуктан туруктуулукка өтүүнү манипуляциялайт",Science Advances, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Янг, М. жана башкалар. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. Ноябрь, Кытай, Ички Монголия Автономиялуу районундагы сода көлүнөн бөлүнүп алынган галоалкалифилдик бактерия. J. Сист. Evol.Микробиол, 72, стр. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Жу, З., Ву, Р. жана Ванг, Г.-Х. (2024) 'Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a геномдук тизмеги, Nasonia vitripennisтен бөлүнүп алынган',Микробиология ресурсу боюнча кулактандыруулар. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
