BMKMANU S1000 мейкиндик транскриптому
BMKMANU S1000 мейкиндик транскриптомунун техникалык схемасы
BMKMANU S1000 артыкчылыктары
1) Суб-клеткалык резолюция: Ар бир тартуу аймагы 2 миллиондон ашык мейкиндик штрих-коддуу тактарды камтыган, диаметри 2,5 мкм жана так борборлорунун ортосундагы 5 мкм аралык, суб-клеткалык резолюция (5 мкм) менен мейкиндик транскриптомуна анализ жүргүзүүгө мүмкүндүк берет.
2) Көп деңгээлдүү резолюцияны талдоо: 100 мкмден 5 мкмге чейинки ийкемдүү көп деңгээлдүү талдоо оптималдуу чечимде ар кандай кыртыш өзгөчөлүктөрүн чечүү үчүн.
3) Транскриптомдун комплекстүү профили: бүт кыртыш слайдынан алынган транскрипттерди максаттуу гендердин санына жана максаттуу аймакка чектөөсүз талдоо мүмкүн.
Кызмат спецификациялары
| Китепкана | Секвенирлөө стратегиясы | Берилиштерди чыгаруу сунушталат |
| S1000 cDNA китепканасы | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Гб/үлгү |
Үлгү талаптары
| Үлгү | Сан | Өлчөмү | РНК сапаты |
| OCT камтылган кыртыш блогу | 2-3 блок/үлгү | Болжол менен6,8x6,8x6,8 мм3 | RIN≥7 |
Үлгү даярдоо боюнча көрсөтмөлөр жана кызматтын иш процесси боюнча кененирээк маалымат алуу үчүн аBMKGENE эксперти
Кызматтын иш агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
Алдын ала эксперимент
Мейкиндик штрих коддоо
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
BMKMANU S1000 тарабынан түзүлгөн маалыматтар BMKGENE тарабынан өз алдынча иштелип чыккан "BSTMatrix" программалык камсыздоосу менен талданат, анын ичинде:
1) Ген экспрессиясынын матрицасын генерациялоо
2) HE сүрөттү иштетүү
3) Талдоо үчүн төмөнкү үчүнчү тараптын программалык камсыздоосу менен шайкеш келет
4) Онлайн "BSTViewer" ар кандай резолюцияларда визуализация натыйжаларын алууга жардам берет.
1.Spot кластерлөө
2. Мейкиндик бөлүштүрүү
Nоте: Резолюциядеңгээл=13 (100 мкм, солго); 7 (50 мкм, туура)
3.Маркер туюнтмасы молчулук кластердик жылуулук картасы
4. Үлгүлөр аралык маалыматтарды талдоо
