circRNA секвенциясы - Иллюмин
Өзгөчөлүктөрү
● рРНКнын азайышы, андан кийин багыттуу китепкананы даярдоо, сапка тиешелүү маалыматтарды секвенирлөө мүмкүнчүлүгүн берет.
● Биоинформатикалык иш процесси circRNAны болжолдоого жана экспрессияны сандык аныктоого мүмкүндүк берет
Кызматтын артыкчылыктары
●Кененирээк РНК китепканалары:биз китепканага чейинки даярдоодо сызыктуу РНКнын түгөнүшүнүн ордуна рРНКнын түгөнүшүн колдонобуз, бул секвенирлөө маалыматтары circRNA гана эмес, мРНК жана lncRNAны да камтып, бул маалымат топтомдорун биргелешип анализдөөгө мүмкүндүк берет.
●атаандаш эндогендик РНК (ceRNA) тармактарынын кошумча талдоо: уюлдук жөнгө салуу механизмдерин тереңирээк түшүнүү менен камсыз кылуу
●Extensive Expertise: BMKде 20 000ден ашуун үлгүлөрдү иштетүү тажрыйбасы менен, ар кандай үлгү түрлөрүн жана lncRNA долбоорлорун камтыган биздин команда ар бир долбоорго бай тажрыйбаны алып келет.
●Катуу сапатты көзөмөлдөө: биз үлгүлөрдү жана китепкананы даярдоодон секвенирлөө жана биоинформатикага чейин бардык этаптарда негизги контролдук пункттарды ишке ашырабыз.Бул кылдат мониторинг ырааттуу жогорку сапаттагы натыйжаларды берүүнү камсыз кылат.
● Сатуудан кийинки колдоо: Биздин милдеттенмебиз 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтү менен долбоордун аяктоосунан ашат.Бул убакыттын ичинде, биз натыйжаларга байланыштуу бардык суроолорду чечүү үчүн долбоорлорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү аныктоо боюнча жардам жана суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.
Үлгү талаптары жана жеткирүү
| Китепкана | Платформа | Сунушталган маалыматтар | Маалымат QC |
| Poly A байытылган | Illumina PE150 | 16-20 Гб | Q30≥85% |
Үлгү талаптары:
Нуклеотиддер:
| Конц.(нг/мкл) | Суммасы (мкг) | Тазалык | актык |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Чектелген же жок белок же ДНК булганышы гелде көрсөтүлгөн. | Өсүмдүктөр үчүн: RIN≥6,5; Жаныбарлар үчүн: RIN≥7,0; 5.0≥28S/18S≥1.0; чектелген же негизги бийиктиги жок |
● Өсүмдүктөр:
Тамыр, сабагы же желекчеси: 450 мг
Жалбырак же үрөн: 300 мг
жемиш: 1,2 г
● Жаныбар:
Жүрөк же ичеги: 450 мг
Viscera же мээ: 240 мг
Булчуң: 600 мг
Сөөк, чач же тери: 1,5 г
● муунак буттуулар:
Курт-кумурскалар: 9г
Crustacea: 450 мг
● Толук кан:2 түтүк
● Клеткалар: 106 клеткалар
● Сыворотка жана плазма: 6 мл
Сунушталган үлгү жеткирүү
Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)
Үлгү этикеткалоо: Топ+репликация, мисалы, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Жөнөтүү:
1. Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.
2. RNAstable түтүктөр: РНК үлгүлөрүн РНКны турукташтыруучу түтүктө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жөнөтүүгө болот.
Кызматтын иш агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
РНК экстракциясы
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
Биоинформатика
circRNA болжолдоо: хромосомалык бөлүштүрүү
Дифференциалдык экспрессияланган циркРНКлар – Вулкан сюжети
Дифференциалдык экспрессияланган circRNAs – иерархиялык кластерлөө
circRNAнын гендердин функционалдык байытылуусу
Басылмалардын тандалып алынган жыйнагы аркылуу BMKGene' circRNA секвенирлөө кызматтары көмөк көрсөткөн илимий жетишкендиктерди изилдеңиз.
Ван, X. жана башкалар.(2021) 'CPSF4 circRNA түзүлүшүн жана гепатоцеллярдык ракта микроРНК ортомчу гендин үнсүздүгүн жөнгө салат', Oncogene 2021 40:25, 40(25), 4338–4351-б.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. жана башкалар.(2023) 'X oo-жооптуу транскриптом күрүчтө OsARAB экспрессиясын жөнгө салуу аркылуу ооруларга туруштук берүүдөгү тегерек RNA133 ролун ачып берет', Phytopathology Research, 5(1), 1-14-беттер.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. жана башкалар.(2023) 'CPSF3 гепатоцеллярдык рактын тегерек жана сызыктуу транскрипттеринин балансын модуляциялайт'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Чжан, Y. жана башкалар.(2023) 'Цирротикалык кардиомиопатияда circRNAs комплекстүү баалоо чейин жана боор трансплантациялоодон кийин', Эл аралык Immunopharmacology, 114, б.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
