BMKCloud Log in
条形banner-03

Продукциялар

ДНК/РНК секвенирлөө – Иллюминанын секвенсери

Illumina секвенирлөө технологиясы, синтез жолу менен секвенирлөө (SBS) дүйнө жүзү боюнча кеңири кабыл алынган кийинки муундун секвенирлөө (NGS) технологиясы, ал дүйнөдөгү секвенирлөө маалыматтарынын 90%дан ашыгын түзүүгө жооптуу.Ар бир dNTP кошулган сайын флуоресценттик белгиленген реверсивдүү терминатор сүрөттөлөт, андан кийин кийинки базаны кошууга уруксат берүү үчүн бөлүнөт.Ар бир секвенирлөө циклинде бардык 4 реверсивдүү терминатор менен байланышкан dNTP бар болгондуктан, табигый атаандаштык инкорпорациянын кыйшаюусун азайтат.Метод кайталанган нуклеотиддердин (гомополимерлердин) саптары менен байланышкан каталарды жана кабыл алынбай калган чалууларды дээрлик жокко чыгарат.Синтез технологиясы боюнча Illumina секвенциясы бир окулуучу жана жупташкан китепканаларды колдойт.SBS технологиясы жогорку резолюциядагы геномдун секвенциясы үчүн кыска кыстаруу жупталуу мүмкүнчүлүгүн сунуштайт, ошондой эле эффективдүү ырааттуулукту чогултуу, де novo секвенирлөө жана башкалар үчүн узун кыстарылган жупташкан окууларды сунуштайт.Кыска кыстаруулардын жана узун окуулардын айкалышы ар кандай геномду толук мүнөздөй алуу мүмкүнчүлүгүн жогорулатат.


Кызматтын чоо-жайы

Демо натыйжасы

Кызматтын чоо-жайынын өзгөчөлүктөрү

Платформа

Секвенция режими

Тиркемелер

Illumina Nova системасы

SE50

PE50

PE150

PE250

1. Бүтүндөй геномдорду тез ыраатташтыруу

2. Максаттуу аймактарды терең ырааттуулук менен кичирейтиңиз

3. РНКнын секвенирлөөсүн (РНК-Seq) жаңы РНК варианттарын жана сплайс жерлерин табуу үчүн колдонуңуз же ген экспрессиясын талдоо үчүн mRNAлардын санын аныктаңыз

4. Геном боюнча ДНК метилизациясы жана ДНК-белоктун өз ара аракеттенүүсү сыяктуу эпигенетикалык факторлорду талдоо

5. Рак үлгүлөрүн сейрек кездешүүчү соматикалык варианттарды, шишик субклондорун жана башкаларын изилдөө үчүн ырааттуулук менен тандаңыз Адамдардагы же айлана-чөйрөдөгү микробдук ар түрдүүлүктү изилдөө

Кызматтын артыкчылыктары

● Illumina секвенирлөө платформасында ар кандай түрдөгү миңдеген жабык долбоорлор менен кеңири тажрыйба.
● Кыска убакыт менен жетилген секвенирлөө процесси.
● Толук төмөнкү агымдагы биоинформатика талдоо кызматтары.
● Катуу сапатты көзөмөлдөө системасы: секвенирлөө маалыматтардын катуу QC стандарты.

Үлгү талаптары*

ырааттуу платформа &

Секвенирлөө стратегиясы

Маалыматтын көлөмү

 

Концентрация
(Thermo Life Qubit 3.0)

 

Көлөм

Суммасы

QC натыйжасы

Novaseq системасы,

жупташкан аягы 150bp

X≤30Гб

≥1нг/мкл

≥20 мкл

≥20нг

Квалификациялуу

30Гб < X≤100Гб

≥1нг/мкл

≥25 мкл

≥30нг

X>100Gb

≥2нг/мкл

≥25 мкл

≥50нг

Эскертүү:
  • Концентрациядан жана жалпы суммадан тышкары, ылайыктуу чоку үлгүсү да талап кылынат.

Жалгыз тилке (Illumina)

Платформа

 

 

Концентрация
(qPCR nM)

 

Көлөм

QC натыйжасы

HiseqXten

≥2,5нМ

≥20μL

Квалификациялуу

NovaSeq 6000 S4

≥2nM

≥30μL

NovaSeg 6000 SP

≥2nM

≥30μL

 

Сураныч, үлгүлөрүңүз баштапкы материалдын талаптарына жооп бербесе, бизге кайрылыңыз.

Кызматтын иш процесси

үлгү даярдоо

Китепкананын сапатын көзөмөлдөө

Секвенциялоо

Секвенциялоо

Маалыматтарды талдоо

Маалыматтын сапатын көзөмөлдөө

QC үлгүсү

Долбоорду жеткирүү


  • Мурунку:
  • Кийинки:

  • РНК үлгүсүндөгү маалыматтардын сапатын баалоо

    Таблица 1. Маалыматтарды секвенирлөө боюнча статистика.

    Үлгү ID

    BMKID

    Чийки окуйт

    Чийки дайындар (bp)

    Таза окуулар (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6 861 036 000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4,415,360,100

    96.00

    98,95

    93.89

    37.08

    Сүрөт 1. Ар бир үлгүдөгү окуулар боюнча сапаттын бөлүштүрүлүшү

    A9

    2-сүрөт. Негизги мазмундун бөлүштүрүлүшү

    A10

    3-сүрөт. Окулган мазмундун секвенирлөө маалыматтарында бөлүштүрүлүшү

    A11

    цитата алуу

    Бул жерге билдирүүңүздү жазып, бизге жөнөтүңүз

    Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: