Illumina алдын ала даярдалган китепканалары
Өзгөчөлүктөрү
●Платформалар:Illumina NovaSeq 6000 жана NovaSeq X Plus
●Ырааттуулук режимдери:PE150 жана PE250
●Китепканалардын секвенирлөөдөн мурун сапатын көзөмөлдөө
●Маалыматтардын сыпаттамасын текшерүү жана жеткирүү:Q30 окууларын демультиплекстөөдөн жана чыпкалоодон кийин сапатты көзөмөлдөө отчетун жана чийки маалыматтарды fastq форматында жеткирүү
Кызматтын артыкчылыктары
●Ырааттуулук кызматтарынын ар тараптуулугу:Кардар тилке боюнча, агым уячасы боюнча же талап кылынган маалыматтардын көлөмү боюнча (тилкелердин жарым-жартылай ырааттуулугу) ырааттуулукту тандай алат.
●Illumina секвенирлөө платформасында кеңири тажрыйба:ар кандай түрлөр менен миңдеген жабык долбоорлор менен.
●Ырааттуулукту текшерүү боюнча сапатты көзөмөлдөө отчетун жеткирүү:сапаттык көрсөткүчтөр, маалыматтардын тактыгы жана секвенирлөө долбоорунун жалпы көрсөткүчтөрү менен.
●Жетилген секвенирлөө процесси:кыска айлануу убактысы менен.
●Катуу сапатты көзөмөлдөө: биз дайыма жогорку сапаттагы натыйжаларды камсыз кылуу үчүн катуу сапатты көзөмөлдөө талаптарын аткарабыз.
Үлгү платформалар
| Платформа | Агым клеткасы | Ырааттуулук режими | Бирдик | Болжолдуу чыгарылыш |
| NovaSeq X | 10B (8 тилке) | PE150 | Бир тилкелүү Жарым-жартылай тилке | 375 Гб / тилке |
| 25B (8 тилке) | PE150 | Бир тилкелүү Жарым-жартылай тилке | 1000 Гб/тилке | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow клеткасы (2 тилке) | PE250 | Агым клеткасы Бир тилкелүү Жарым-жартылай тилке | 325-400 M окуу / тилке |
| S4 Flow клеткасы (4 тилке) | PE150 | Агым клеткасы Бир тилкелүү Жарым-жартылай тилке | ~800 Гб / тилке |
Үлгү талаптары
| Маалыматтын көлөмү (Гб) | Концепция (qPCR) PE150 | Концепция (qPCR) PE250 | Үн көлөмү | |
| Жарым-жартылай тилке
| G ≤ 10 | ≥ 1 нМ | ≥ 2нМ | ≥ 25 мкл |
| 10 < G ≤ 50 | ≥ 2 нМ | ≥ 3нМ | ≥ 25 мкл | |
| 50 < G ≤ 100 | ≥ 3 нМ | ≥ 4нМ | ≥ 25 мкл | |
| G > 100 | ≥ 4 нМ | ≥ 4нМ | ≥ 25 мкл | |
| Бир тилкелүү | Ар бир тилкеге | ≥ 1,5 нМ/Китепкана пулу | ≥ 2 нМ/Китепкана пулу | ≥ 25 µL/Китепкана пулу |
Концентрациядан жана жалпы көлөмдөн тышкары, ылайыктуу чоку үлгүсү да талап кылынат.
Эскертүү: Төмөн ар түрдүүлүктөгү китепканалардын тилкелерин ырааттуулукка келтирүү үчүн базалык чалуунун ишенимдүүлүгүн камсыз кылуу үчүн PhiX кошумча киргизүүсү талап кылынат.
Тилкелерди ырааттуулукка келтирүү үчүн алдын ала топтолгон китепканаларды үлгү катары тапшыруу сунушталат. Эгерде сизге китепкананы бириктирүүнү BMKGENE аткарышы керек болсо, анда тилкелерди жарым-жартылай ырааттуулукка келтирүү үчүн китепкананын талаптарын караңыз.
Китепкананын көлөмү (чоку картасы)
PE150 ырааттуулугу үчүн, киргизүүнүн өлчөмү 300–400 bp (адаптерлерди кошпогондо) болушу керек; PE250 ырааттуулугу үчүн, киргизүүнүн өлчөмү 150–500 bp (адаптерлерди кошпогондо) болушу керек.
Китепканаларда бир негизги чоку болушу керек, адаптер булганбашы жана праймердин димерлери болбошу керек.
Эгерде сиздин үлгүлөрүңүз баштапкы материалдын талаптарына жооп бербесе, биз менен байланышыңыз.
Кызмат көрсөтүүнүн жумуш агымы
Китепкананын сапатын көзөмөлдөө
Ырааттуулук
Маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө
Долбоорду жеткирүү
Китепкананын сапатты көзөмөлдөө отчету
Китепкананын сапаты жөнүндө отчет ырааттуулукту аныктоодон, китепкананын көлөмүн баалоодон жана фрагментациялоодон мурун берилет.
Сапатты көзөмөлдөө боюнча ырааттуулук отчету
1-таблица. Ырааттуулук маалыматтары боюнча статистика.
| Үлгү ID | BMKID | Чийки окулгандар | Чийки маалыматтар (bp) | Таза окуулар (%) | Q20(%) | Q30(%) | Жалпы сумма (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
1-сүрөт. Ар бир үлгүдөгү окуулар боюнча сапаттык бөлүштүрүү
2-сүрөт. Негизги мазмундун бөлүштүрүлүшү
3-сүрөт. Окулган мазмундун секвенирлөө маалыматтарындагы бөлүштүрүлүшү
