Платформа | Китепкана өлчөмү | Теориялык маалыматтардын түшүмдүүлүгү (бир клетка үчүн) | Бир базалык тактык | Өтүнмөлөр |
Nanoropore | 8KB, 10KB, 20KB, УЛТРОЛОН, CDNA-PCR | 70-90ГБ / Клетка | 85-92% | SV Calling, de Novo, Sument Stenge Sentencing, iso-seq, ген аннотация, ДНК металлациясын аныктоо |
Pacbio 5 жылдан ашуун тажрыйбанын ар кандай түрлөрү бар миңдеген жабык долбоорлору бар платформация менен жүргүзүлөт.
Bmkgene - бул Оксфорд Нанорордун расмий өнөктөшү, Дуал Платформасы РНК / ДНК сертификаты менен.
● Толук жабдуулар жана жетиштүү катышуу аркылуу жетишкендиктер менен башталган максенчилердин негизги моделдери бар.
● Нанипор платформасынын негизинде 10дон ашык жаныбар жана отургузулган декларациялар эл аралык белгилүү журналдарда жарыяланган.
Үлгү түрү | Суммасы | Концентрион (QUBIT ®) | Көлөмү | Тазалык | Башкалар |
Genomic DNA | Маалымат талаптарын көз каранды | ≥20Г / μL | ≥15μЛ | OD260 / 280 = 1.7-2.2; OD260 / 230≥1.5; Таза чоку 260 нм, булгангандар жок | Концентрация талап кылынышы керек |
Жалпы RNA | ≥1.2μg | ≥100μg / μl | ≥15μЛ | OD260 / 280 = 1.7-2.5; OD260 / 230 = 0.5-2.5; булганган жок | Рин мааниси ≥7.5 |
ДНК үлгүсүнүн маалыматтарын баалоо
1-таблица. Таза маалыматтардын статистикасы.
BMKID | rawseqnum | раввасумб | CleanSeQnum | Cleansumbase | Cleann50len | cleann90len | CleanMeanlen | cleanmaxlen | CleanMeanqual |
Dna_bmk01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
RNA үлгүсүндөгү маалыматтардын сапатын баалоо
1-таблица. Таза маалыматтардын статистикасы.
Шилтемелер аты | Кардарлар | Readnum | Басенум | N50 | Магазин | Maxlent | Магазин |
Rna_bmk001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
1-сүрөт. Узун бөлүштүрүүнү окуу
2-сүрөт. Таза маалыматтарды таратуу сапатынын бөлүштүрүлүшү
3-сүрөт. Таза маалыматтардын узактыгы жана сапаттуу упай бөлүштүрүлүшү