BMKCloud кирүү

Продукциялар

ДНК/РНК секвенирлөө – Нанопора секвенирлөөчү

ДНК/РНК секвенирлөө – Nanopore секвенирлөөчүсү Сунушталган сүрөт

ONT секвенирлөөсү - бул нанокөңдөйчөлөргө негизделген бир молекулалуу реалдуу убакыттагы электрдик сигналдарды секвенирлөө технологиясы, ар бир платформанын секвенирлөө принциби бирдей. Кош тизмектүү ДНК/РНК биофильмге орнотулган нанокөңдөйлүү белокко байланышып, кыймылдаткыч белоктун жетекчилиги астында чечилет, биофильмдин эки тарабындагы чыңалуу айырмасынын таасири астында ДНК/РНК жипчелери нанокөңдөйлүү канал белогу аркылуу белгилүү бир ылдамдыкта өтөт. ДНК/РНК жипчесиндеги ар кандай негиздердин химиялык касиеттеринин айырмачылыктарынан улам, бир негиз же ДНК молекуласы нанокөңдөйлүү канал аркылуу өткөндө, ар кандай электрдик сигналдардын өзгөрүшүнө алып келет. Бул сигналдарды аныктоо жана аларга туура келүү менен, тиешелүү негиз түрлөрүн эсептеп, ырааттуулукту реалдуу убакытта аныктоону аяктоого болот.

Биз менен байланышыңыз

Кызматтын чоо-жайы

Демо натыйжасы

Кызматтын чоо-жайынын өзгөчөлүктөрү

Платформа	Китепкананын көлөмү	Теориялык маалыматтардын түшүмдүүлүгү (бир уячага)	Бир базалык тактык	Колдонмолор
Нанопора	8Kb, 10kb, 20kb, Ультраузун, кДНК-ПЦР	70-90 Гб/Уяча	85-92%	SV чакыруу, De novo, Толук метраждуу секвенирлөө, Iso-Seq, Ген аннотациясы, ДНК метилденүүсүн аныктоо

Кызматтын артыкчылыктары

● PacBio секвенирлөө платформасында 5 жылдан ашык тажрыйба, ар кандай түрлөр менен миңдеген жабык долбоорлор.
● BMKGENE кош платформалуу РНК/ДНК сертификатына ээ болгон Oxford Nanopore компаниясынын расмий өнөктөшү.
● Толук жабдуулары жана жетиштүү секвенирлөө жөндөмдүүлүгү бар секвенсорлордун негизги моделдери бар.
● Nanopore платформасынын негизинде, Denovo компаниясынын жаныбарлар жана өсүмдүктөр боюнча 10дон ашык изилдөөлөрү эл аралык деңгээлдеги белгилүү журналдарда жарыяланган.

Үлгү талаптары

Үлгү түрү

Сумма

Концентрация (Qubit®)

Үн көлөмү

Тазалык

Башкалары

Геномдук ДНК

Маалымат талабына жараша

≥20нг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

260 нм тунук чоку, булгануу жок

Концентрацияны Qubit жана Qubit/Nanopore ≤ 2 менен өлчөө керек.

Жалпы РНК

≥1.2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; булгануулар жок

RIN мааниси ≥7.5

Кызмат көрсөтүүнүн жумуш агымы

Үлгү даярдоо

Китепкана куруу

Ырааттуулук

Маалыматтарды талдоо

Долбоорду жеткирүү

Мурунку: Illumina алдын ала даярдалган китепканалары

Кийинки: Белгилүү бир локус менен күчөтүлгөн фрагменттерди ырааттуулукка келтирүү (SLAF-Seq)

ДНК үлгүсүнүн маалыматтарынын сапатын баалоо

1-таблица. Таза маалыматтар боюнча статистика.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	тазаN50Len	тазаN90Len	тазаОртоЛен	тазаМаксЛен	тазаОрточоКвалификация
ДНК_BMK01	1,218,239	26.37	1 121 736	25.90	28,014	15,764	23 090	143,181	9

РНК үлгүсүнүн маалыматтарынын сапатын баалоо

1-таблица. Таза маалыматтар боюнча статистика.

Шилтемелер аты	Кардардын IDси	ОкууСан	BaseNum	N50	Орточо узундук	Максималдуу узундук	Орточо балл
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12