Продукциялар

ДНК/РНК секвенирлөө – Нанопора секвенсер

ДНК/РНК ырааттуулугу – Nanopore Sequencer Featured Image

ONT секвенциясы – бул нанокесектерге негизделген реалдуу убакыт режиминдеги бир молекулалык электр сигналын секвенирлөө технологиясы, ар бир платформанын секвенирлөө принциби бирдей.Кош тилкелүү ДНК/РНК биоплёнкага камтылган nanoporous протеин менен байланышат жана мотор протеининин жетекчилиги астында ачылат, биофильмдин эки тарабындагы чыңалуу айырмасынын таасири астында ДНК/РНК тилкелери нанопороктук протеин аркылуу белгилүү бир деңгээлде өтөт. чен.ДНК/РНК тилкесиндеги ар кандай негиздердеги химиялык касиеттердин айырмачылыгынан улам, бир база же ДНК молекуласы нанопур каналынан өткөндө, ар кандай электрдик сигналдардын өзгөрүшүнө себеп болот.Бул сигналдарды аныктоо жана аларга туура келүү менен, тиешелүү базалык типтерди эсептөөгө болот жана ырааттуулукту реалдуу убакытта аныктоого болот.

Биз менен байланыш

Кызматтын чоо-жайы

Демо натыйжасы

Кызматтын чоо-жайынын өзгөчөлүктөрү

Платформа	Китепкана өлчөмү	Теориялык маалыматтардын кирешелүүлүгү (ар бир клетка үчүн)	Бир базалык тактык	Тиркемелер
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Cell	85-92%	SV чакыруу, De novo, Толук узундуктагы секвенирлөө, Iso-Seq, Ген аннотациясы, ДНК метилизациясын аныктоо

Кызматтын артыкчылыктары

● PacBio секвенирлөө платформасында 5 жылдан ашык тажрыйба, ар кандай түрдөгү миңдеген жабык долбоорлор.
● BMKGENE - Oxford Nanopore компаниясынын расмий өнөктөшү, кош платформа РНК/ДНК сертификаты бар.
● Толук жабдылышы жана жетиштүү секвенсер өткөрүү жөндөмдүүлүгү бар секвенсерлердин негизги моделдери бар.
● Nanopore платформасынын негизинде 10дон ашык жаныбарлар жана өсүмдүктөр боюнча Деново изилдөөлөрү эл аралык белгилүү журналдарда жарыяланган.

Үлгү талаптары

Үлгү түрү

Суммасы

Концентрация(Qubit®)

Көлөм

Тазалык

Башкалар

Геномдук ДНК

Маалыматтын талабына жараша

≥20нг/мкл

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

260 нмде ачык чоку, булгануулар жок

Концентрацияны Qubit жана Qubit/Nanopore ≤ 2 менен өлчөө керек

Жалпы РНК

≥1.2μg

≥100μг/мкл

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; булгануулар жок

RIN мааниси ≥7,5

Кызматтын иш процесси

Үлгү даярдоо

Китепкананын курулушу

Секвенциялоо

Маалыматтарды талдоо

Долбоорду жеткирүү

Мурунку: ДНК/РНК секвенирлөө – Иллюминанын секвенсери

Кийинки: Өзгөчө локустун күчөтүлгөн фрагменттеринин тизилиши (SLAF-Seq)

ДНК үлгүсүндөгү маалыматтардын сапатын баалоо

Таблица 1. Таза маалыматтар боюнча статистика.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

РНК үлгүсүндөгү маалыматтардын сапатын баалоо

Таблица 1. Таза маалыматтар боюнча статистика.

Шилтемелер аты	ClientID	ReadNum	BaseNum	N50	MeanLength	Максималдуу узундук	MeanQscore
RNA_BMK001	C2	8 947 708	4,047,230,083	398	452	129,227	Q12