Fungal геному
Кызматтын артыкчылыктары
● Ар кандай изилдөө максаттары үчүн бир нече иреттөө стратегиялары
● 10 000ден ашык пене-толук геномду чогултуу менен козу карындардын геномунун жыйындысы боюнча жогорку тажрыйбалуу.
● Кесиптик сатуудан кийинки техникалык колдоо тобу конкреттүү изилдөө муктаждыктарын канааттандырат.
Кызмат спецификациялары
| Кызмат | Секвенирлөө стратегиясы | Сапатына кепилдик берилет | Болжолдуу айлануу убактысы |
| Грибок жакшы карта | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Мб | 35 жумушчу күн |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Грибок пене-толук карта | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Хромосомалардын анкердик катышы >90% | 45 жумушчу күн |
Биоинформатика анализи
● чийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө
● Геном жыйындысы
● Геном компоненттеринин анализи
● Ген функциясынын аннотациясы
● Салыштырмалуу геномдук анализ
Үлгү талаптары жана жеткирүү
Үлгү талаптары:
үчүнДНК экстракттары:
| Үлгү түрү | Суммасы | Концентрация | Тазалык |
| ДНК экстракттары | ＞ 1,2 мкг | ＞ 20 нг/мкл | OD260/280= 1,6-2,5 |
кыртыш үлгүлөрү үчүн:
| Үлгү түрү | Сунушталган үлгү дарылоо | Үлгү сактоо жана жөнөтүү |
| Бир клеткалуу козу карын | Микроскоп астында ачыткыларды байкап, аларды экспоненциалдык фазасында чогултуңуз Маданиятты (болжол менен 3-4,5e9 клетканы камтыган) 1,5 же 2 мл эппендорфка өткөрүңүз.(Муз үстүндө кармаңыз) Бактерияларды чогултуу үчүн түтүктү 1 мүнөт 14000 г центрифугалаңыз жана үстүнкү затты кылдаттык менен алып салыңыз Түтүктү жабыңыз жана бактерияларды суюк азотто 1-3 сааттан кем эмес тоңдуруңуз.Түтүктү -80 ℃ муздаткычта сактаңыз. | Үлгүлөрдү суюк азотто 3-4 саат тоңдуруңуз жана суюк азотто же -80 градуска чейин узак мөөнөткө сактаңыз.кургак муз менен үлгү жеткирүү талап кылынат. |
| Макро кычыткы | жигердүү өсүп фазасында кыртыш сунуш кылынат. эндотоксин-эркин суу менен кыртыш чайкоо, андан кийин 70% ethonal. Үлгүнү крио-түтүкчөлөргө сактаңыз. |
Кызматтын иш агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкананын курулушу
Секвенциялоо
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
1. Циркос диаграммасы грибоктун геномдук компоненттери боюнча
2. Салыштырмалуу геномика анализи: Филогенетикалык дарак
