BMKCloud Log in
条形banner-03

Продукциялар

Геном боюнча ассоциациянын анализи

Геном боюнча жалпы ассоциациялык изилдөө (GWAS) өзгөчө белгилерге (фенотипке) байланышкан генетикалык варианттарды (генотип) аныктоого багытталган.GWAS изилдөө генетикалык маркерлер көп сандагы адамдардын бүт геномунун кайчылаш изилдейт жана популяция деңгээлинде статистикалык талдоо аркылуу генотип-фенотип бирикмелерин болжолдойт.Ал адамдын ооруларын изилдөөдө жана жаныбарлардын же өсүмдүктөрдүн татаал белгилери боюнча функциялык генди казып алууда кеңири колдонулат.


Кызматтын чоо-жайы

Демо натыйжасы

Өзгөчөлөнгөн басылма

сүрөт3

1. Кызматтын артыкчылыктары

● Долбоордун көп учурлары: 2009-жылы түзүлгөндөн бери, BMKGENE популяциялык GWAS изилдөөлөрүндө жүздөгөн түр долбоорлорун аяктады, изилдөөчүлөргө 100дөн ашык макалаларды жарыялоого жардам берди, ал эми кумулятивдик импакт фактору 500гө жетти.
● Кесипкөй аналитиктер.
● Кыскача талдоо цикли.
● Маалыматтарды так иштетүү.

2. Кызматтын спецификациялары

Type

Популяциянын масштабы

Стратегия жана тереңдик

SLAF-GWAS Үлгү номери ≥200 Геномдун көлөмү < 400M, ref-геному менен WGS сунушталат

Геномдун өлчөмү ≤ 1G, 100K Tags жана 10X

1G ≤ Геном өлчөмү ≤ 2G, 200K тэг жана 10X

Геномдун көлөмү > 2G, 300K Tags жана 10X

WGS-GWAS

Үлгү номери ≥200

Ар бир үлгү үчүн 10X

3. Материалды тандоо

动物1
动物2
сүрөт 7

Ар кандай сорттор, түрчөлөр, ландрасалар/генбанктар/аралаш үй-бүлөлөр/жапайы ресурстар

Ар кандай сорттор, түрчөлөр, жер кыртыштары

Жарым сибдүү үй-бүлө/толук сибдүү үй-бүлө/жапайы ресурстар

4. Биоинформациялык анализ

● Геном боюнча ассоциациянын анализи
● маанилүү SNP талдоо жана скрининг
● Талапкер генинин функционалдык аннотациясы

5. Кызматтын иш агымы

QC үлгүсү

Эксперимент дизайны

үлгү жеткирүү

Үлгү жеткирүү

Пилоттук эксперимент

РНК экстракциясы

Китепкана даярдоо

Китепкананын курулушу

Секвенциялоо

Секвенциялоо

Маалыматтарды талдоо

Маалыматтарды талдоо

Сатуудан кийинки кызматтар

Сатуудан кийинки кызматтар


  • Мурунку:
  • Кийинки:

  • а.Фенотип QC

    Жыштыктарды бөлүштүрүү гистограммасы

    сүрөт 9

    Фенотип статистикасы

    сүрөт 10

    б.Ассоциация анализи (Модель: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    QQ Plot

    сүрөт 11

    Манхэттен участогу

    Ammia_emmax_manhattan_00

    Жыл

    Журнал

    IF

    Title

    2022

    NC

    17.69

    Дарак пиондорунун гига-хромосомаларынын жана гига-геномунун геномдук негиздери Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Үйдөгү изи сояда агрономиялык мааниге ээ геномдук аймактарды бириктирет

    2018

    MP

    9.32

    Рапс кошулмаларынын бүткүл дүйнөлүк коллекциясын бүтүндөй геномдук ресеквенсациялоо алардын экотиптеринин дивергенциясынын генетикалык негизин ачып берет.

    2022

    HR

    7.29

    Геномдук ассоциациянын анализи дарбыз уруктарынын өлчөмүнүн табигый өзгөрүшүнө молекулярдык түшүнүктөрдү берет

    цитата алуу

    Бул жерге билдирүүңүздү жазып, бизге жөнөтүңүз

    Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: