Геном боюнча ассоциацияны талдоо
Жумуш агымы
Кызматтын артыкчылыктары
●Кеңири экспертиза жана жарыяланган жазууларGWAS жаатында топтолгон тажрыйба менен, BMKGene GWAS популяциясын изилдөө боюнча жүздөгөн түр долбоорлорун аяктады, изилдөөчүлөргө 100дөн ашык макала жарыялоого жардам берди жана жалпы таасир этүү коэффициенти 500гө жетти.
● Комплекстүү биоинформатикалык анализЖумуш агымы SNP-белги ассоциациясынын анализин камтыйт, талапкер гендеринин жыйындысын жана аларга тиешелүү функционалдык аннотацияны берет.
●Жогорку квалификациялуу биоинформатика командасы жана кыска анализ циклиӨркүндөтүлгөн геномдук анализ жаатында чоң тажрыйбага ээ болгон BMKGene командасы ар тараптуу анализдерди тез арада жүргүзөт.
●Сатуудан кийинки колдоо:Биздин милдеттенмебиз долбоорду аяктоодон тышкары, 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтүн камтыйт. Бул убакыттын ичинде биз долбоорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүүгө жардам берүү жана жыйынтыктарга байланыштуу ар кандай суроолорго жооп берүү үчүн суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.
Кызмат көрсөтүүнүн мүнөздөмөлөрү жана талаптары
| Ырааттуулуктун түрү | Сунушталган калктын масштабы | Ырааттуулук стратегиясы | Нуклеотидге болгон талаптар |
| Бүтүндөй геномдук ырааттуулук | 200 үлгү | 10x | Концентрациясы: ≥ 1 нг/мкл Жалпы суммасы ≥ 30 мг Деградация же булгануу чектелген же такыр жок |
| Белгилүү бир локус менен күчөтүлгөн фрагмент (SLAF) | Тегдин тереңдиги: 10x Тегдердин саны: < 400 Мб: WGS сунушталат < 1 Гб: 100 миң тег 1 Гб > 2 Гб: 300 миң тег Эң көп дегенде 500 миң тег | Концентрациясы ≥ 5 нг/µL Жалпы суммасы ≥ 80 нг Нанотамчы OD260/280=1.6-2.5 Агароза гели: бузулбайт же булганбайт
|
Материалды тандоо
Ар кандай сорттор, түрчөлөр, кургак расалар/генефонддор/аралаш үй-бүлөлөр/жапайы ресурстар
Ар кандай сорттор, түрчөлөр, кургак расалар
Жарым бир тууган үй-бүлө/толук бир тууган үй-бүлө/жапайы жаратылыш ресурстары
Кызмат көрсөтүүнүн жумуш агымы
Эксперименттик дизайн
Үлгү жеткирүү
РНКны бөлүп алуу
Китепкана куруу
Ырааттуулук
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
Төмөнкү анализди камтыйт:
- Геном боюнча ассоциациялык анализ: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM модели
- Кандидат гендердин функционалдык аннотациясы
SNP-өзгөчөлүк ассоциациясынын анализи – Манхэттен сюжети
SNP-өзгөчөлүк ассоциациясынын анализи – QQ графиги
BMKGene компаниясынын GWAS кызматтары тарабынан ишке ашырылган жетишкендиктерди атайын тандалган басылмалар жыйнагы аркылуу изилдеңиз:
Lv, L. жана башкалар (2023) 'Геном боюнча ассоциациялык изилдөө аркылуу Sinonovacula constricta устара молюскасындагы аммиак толеранттуулугунун генетикалык негиздерине көз караш',Аквакультура, 569, б. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Ли, Х. жана башкалар (2022) 'Түлкү куйруктуу тарысынын 398 үлгүсүнүн мультиомика анализдери үй шартында өстүрүү, метаболиттик өзгөчөлүктөр жана сезгенүүгө каршы таасирлер менен байланышкан геномдук аймактарды аныктайт',Молекулярдык өсүмдүк, 15(8), 1367–1383-бб. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Ли, Ж. жана башкалар (2022) 'Кургакчылык чөйрөсүндөгү кабыксыз араң фенотиптердин геном боюнча ассоциациялык картасы',Өсүмдүк таануудагы чек аралар, 13, б. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Жао, X. жана башкалар (2021) 'Сульфотрансферазаны коддогон GmST1 соя мозаика вирусунун G2 жана G3 штаммдарына туруктуулукту камсыз кылат',Өсүмдүк, клетка жана айлана-чөйрө, 44(8), 2777–2792-бб. doi: 10.1111/PCE.14066.
