BMKCloud Log in
条形banner-03

Продукциялар

Адамдын бүтүндөй экзомасын ырааттуулугу

Бүтүндөй экзома секвенциясы (WES) ооруну пайда кылуучу мутацияларды аныктоо үчүн экономикалык жактан натыйжалуу секвенирлөө стратегиясы катары каралат.Экзондор бүт геномдун болжол менен 1,7% гана ээлегени менен, ал түздөн-түз жалпы протеин функцияларынын профилин билдирет.Адамдын геномунда ооруга байланыштуу мутациялардын 85% дан ашыгы белок коддоочу аймакта кездешет.

BMKGENE ар кандай изилдөө максаттарына жетүү үчүн ар кандай экзон басып алуу стратегиялары менен комплекстүү жана ийкемдүү адамдын бүт экзомасын секвенирлөө кызматтарын сунуш кылат.

Платформа: Illumina NovaSeq платформасы


Кызматтын чоо-жайы

Демо натыйжалары

Кызматтын артыкчылыктары

● Максаттуу протеинди коддоо аймагы: протеинди коддоо аймагын басып алуу жана секвенирлөө аркылуу hWES белоктун структурасына тиешелүү варианттарды ачуу үчүн колдонулат;
● Жогорку тактык: жогорку секвенирлөө тереңдиги менен hWES жалпы варианттарды жана 1% дан төмөн жыштыктагы сейрек варианттарды табууга көмөктөшөт;
● Эффективдүү чыгымдар: hWES адам геномунун 1% адам ооруларынын мутацияларынын болжол менен 85% берет;
● Q30>85% кепилденген бүт процессти камтыган беш катуу QC процедурасы.

Үлгү спецификациялары

Платформа

 

Китепкана

 

Exon Capture Strategy

 

 Референциялоо стратегиясын сунуштоо

 

 

 

Illumina NovaSeq платформасы

 

PE150

Agilent SureSelect Human All Exon V6

IDT xGen Exome Hyb Panel V2

5 Гб

10 Гб

Үлгү талаптары

Үлгү түрү

 

 Суммасы(Qubit®)

 

Көлөм

 

 Концентрация

 

 

 Тазалык(NanoDrop™)

 

Геномдук ДНК

 

≥ 300 нг
≥ 15 мкл
≥ 20 нг/мкл
 
OD260/280=1,8-2,0
 
деградация, булгануу жок

 

Сунушталган секвенирлөө тереңдиги

Mendelian бузулуулар / сейрек оорулар үчүн: 50 × жогору натыйжалуу секвенирлөө тереңдиги
Шишик үлгүлөрү үчүн: 100 × жогору натыйжалуу секвенирлөө тереңдиги

Биоинформатика

WES_BI иш агымы_Disease-01
WES_BI иш агымы_Tumor-01

Кызматтын иш агымы

үлгү жеткирүү

Үлгү жеткирүү

Пилоттук эксперимент

ДНК экстракциясы

Китепкана даярдоо

Китепкананын курулушу

Секвенциялоо

Секвенциялоо

Маалыматтарды талдоо

Маалыматтарды талдоо

数据上传-01

Маалымат жеткирүү

Сатуудан кийинки кызматтар

Сатуудан кийинки кызматтар


  • Мурунку:
  • Кийинки:

  • 1. Тегиздөө статистикасы

    Таблица 1 Картанын натыйжаларынын статистикасы

     

    wps_doc_19

    Таблица 2 Экзоманы басып алуу статистикасы

    wps_doc_2

    2.Variation Detection

    1-сүрөт SNV жана InDel статистикасы

    wps_doc_4

    wps_doc_3


     

    3. Advanced Analysis

    2-сүрөт Геном боюнча зыяндуу SNV жана InDelдин Circos сюжети

    wps_doc_5 wps_doc_6

    Таблица 3 Ооруларды пайда кылуучу гендердин скрининги

    wps_doc_7 wps_doc_8 wps_doc_9

     

    цитата алуу

    Бул жерге билдирүүңүздү жазып, бизге жөнөтүңүз

    Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: