Узак коддолбогон ырааттуулук-Illumina
Кызматтын артыкчылыктары
●мРНК жана lncРНК биргелешкен анализи: мРНК транскрипттеринин сандык аныктоосун lncRNA жана алардын буталарын изилдөө менен айкалыштыруу менен, клеткалык жооптун негизинде жаткан жөнгө салуу механизмине терең сереп салууга болот.
●Кеңири экспертизаБиз ар кандай үлгүлөрдү жана долбоорлордун максаттарын камтыган 230 000ден ашык үлгүлөрдү иштеттик. Биз ар бир долбоорго тажрыйбанын байлыгын алып келебиз.
●мРНК жана lncРНК биргелешкен анализиБиз мРНК транскрипттеринин сандык аныктоосун lncRNA жана алардын буталарын изилдөө менен айкалыштырабыз, бул клеткалык жооптун негизинде жаткан жөнгө салуу механизмине терең сереп салууга мүмкүндүк берет.
●Катуу сапатты көзөмөлдөөБиз үлгүлөрдү даярдоодон баштап, китепканага даярдоого, ырааттуулукту аныктоого жана биоинформатикага чейинки бардык этаптарда негизги көзөмөл пункттарын ишке ашырабыз. Биздин кылдат мониторингибиз дайыма жогорку сапаттагы натыйжаларды алууну камсыз кылат.
●Толук аннотацияБиз дифференциалдык экспрессияланган гендерди (ДЭГ) функционалдык жактан аннотациялоо жана тиешелүү байытуу анализдерин жүргүзүү үчүн бир нече маалымат базаларын колдонобуз. Бул комплекстүү ыкма транскриптомдук жооптун негизинде жаткан клеткалык жана молекулярдык процесстерди түшүнүүгө мүмкүндүк берет, бул сиздин экспериментиңиздин маалыматтары жөнүндө мүмкүн болгон бардык маалыматты алууну камсыздайт.
●Сатуудан кийинки колдооБиз катышуунун канчалык маанилүү экенин түшүнөбүз, ошондуктан биздин милдеттенмебиз долбоорду аяктоодон тышкары, 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтүн камтыйт. Бул убакыттын ичинде биз долбоорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүүгө жардам берүү жана жыйынтыктарга байланыштуу ар кандай суроолорго жооп берүү үчүн суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.
Үлгү талаптары жана жеткирүү
| Китепкана | Платформа | Сунушталган маалыматтар | Маалыматтардын сапатын көзөмөлдөөчү |
| рРНКнын азайып кеткен багыттуу китепканасы | Иллюминат PE150 | 10-16 Гб | Q30≥85% |
Нуклеотиддер:
| Конц. (нг/мкл) | Суммасы (мкг) | Тазалык | Бүтүндүк |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Гелде белоктун же ДНКнын булганышы чектелген же такыр жок экени көрсөтүлгөн. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; базалык бийиктиги чектелген же такыр жок |
● Өсүмдүктөр:
Тамыр, сабак же желекче: 450 мг
Жалбырак же урук: 300 мг
Мөмө-жемиш: 1,2 г
● Жаныбар:
Жүрөк же ичеги: 450 мг
Ички органдар же мээ: 240 мг
Булчуң: 600 мг
Сөөктөр, чач же тери: 1,5 г
● Муун буттуулар:
Курт-кумурскалар: 9 г
Рак сымалдары: 450 мг
● Кандын таза түрү:2 түтүк
● Уячалар: 106 клеткалар
● Кан сары суусу жана плазма: 6 мл
Сунушталган үлгү жеткирүү
Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)
Үлгү белгилөө: Топ+көчүрмө, мисалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жөнөтүү:
1. Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.
2. РНК-туруктуу түтүктөр: РНК үлгүлөрүн РНК-турукташтыруу түтүгүндө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жеткирүүгө болот.
Кызмат көрсөтүүнүн жумуш агымы
Эксперименттик дизайн
Үлгү жеткирүү
РНКны бөлүп алуу
Китепкана куруу
Ырааттуулук
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
Биоинформатика
- Чийки маалыматтар
- Маалыматтардын сапатын көзөмөлдөөчү
- Геномдун тегизделиши
- Гендин түзүлүшү (Альтернативдик сплайсинг, гендин түзүлүшүн оптималдаштыруу жана жаңы гендерди божомолдоо)
- Ген экспрессиясын сандык жактан аныктоо
- Дифференциалдык экспрессияны талдоо
- DEG аннотациясы жана байытуу + Дифференциалдык экспрессияланган lncRNA максаттуу гендери
- Транскриптти идентификациялоо
- lncRNA идентификациясы (lncRNAны сактоо жана белгилүү lncRNA)
- lncRNA максаттуу гендерин алдын ала айтуу
- lncRNA экспрессиясын сандык жактан аныктоо
- мРНК маалыматтары менен биргелешкен анализ
Дифференциалдык ген экспрессиясын (ДЭГ) талдоо
lncRNA экспрессиясын сандык жактан аныктоо – кластерлөө
lncRNA максаттуу гендерин байытуу
Биргелешкен мРНК жана lncRNA позициясын талдоо – Циркос диаграммасы (ортоңку тегерек мРНК, ал эми ички цикл lncRNA)
BMKGene компаниясынын lncRNA эквенирлөө кызматтары аркылуу жетишилген жетишкендиктерди атайын тандалган басылмалар жыйнагы аркылуу изилдеңиз.
Жи, Х. жана башкалар (2020) 'Келемиштердин боорунда суук стресске байланыштуу lncRNAларды идентификациялоо, функционалдык божомолдоо жана негизги lncRNA текшерүүсү',Илимий баяндамалар2020 10:1, 10(1), 1–14-беттер. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. жана башкалар (2021) 'Интегративдик транскриптомикалык анализ CyHV-3кө туруктуу кадимки сазан балыгынын иммундук механизмин ачып берет',Иммунологиядагы чек аралар, 12, стр. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Ван, XJ жана башкалар (2022) 'Кичинекей клеткалуу өпкө рагындагы атаандаш эндогендик РНК жөнгө салуу тармактарынын мультиомика интеграциясына негизделген артыкчылыктуулугу: молекулярдык мүнөздөмөлөр жана дары-дармектерге талапкерлер',Онкологиядагы чек аралар, 12, стр. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Сяо, Л. жана башкалар (2020) 'Populusтагы фотосинтездин негизинде жаткан гендердин биргелешип экспрессия тармагынын генетикалык диссекциясы',Өсүмдүктөр биотехнологиясы журналы, 18(4), 1015–1026-беттер. doi: 10.1111/PBI.13270.
Чжэн, Х. жана башкалар (2022) 'Грейвс оорусу жана Хашимото тиреоидитинин микрочөйрөсүндөгү иммундук клеткалардагы ген экспрессиясынын бузулушу жана анормалдуу метаболикалык сигнал берүү боюнча глобалдык жөнгө салуу тармагы',Иммунологиядагы чек аралар, 13, стр. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
