мРНК-сек (NGS) - De novo
мРНК секвенирлөө клеткалардагы бардык мРНК транскрипттерин белгилүү бир шарттарда профилдөөгө мүмкүндүк берет жана ар кандай изилдөө тармактарында кеңири колдонулган технология болуп саналат. BMKCloud De novo мРНК-секвенирлөө түтүгү эч кандай шилтеме геному жок болгондо поли-А менен байытылган секвенирлөө китепканаларын талдоо үчүн иштелип чыккан. Түтүк сапатты көзөмөлдөөдөн башталат, андан кийинжаңытранскрипт чогултуу жана униген топтомун тандоо. Униген структурасын талдоо коддоо ырааттуулугун (CDS) жана жөнөкөй ырааттуулуктун кайталанышын (SSR) алдын ала айтат. Андан кийин, дифференциалдык экспрессия анализи текшерилген шарттардын арасынан дифференциалдык экспрессияланган гендерди (DEG) табат, андан кийин биологиялык түшүнүктөрдү алуу үчүн функционалдык аннотация жана DEGлерди байытуу жүргүзүлөт.
Биоинформатика
