Нанопоралуу толук узундуктагы транскриптом

Нанопора транскриптомдук секвенирлөө толук узундуктагы кДНКларды секвенирлөөнүн, транскрипт изоформаларын так аныктоонун жана сандык жактан аныктоонун күчтүү ыкмасы болуп саналат. BMKCloud Nanopore толук узундуктагы транскриптомдук түтүкчөсү Nanopore платформасында түзүлгөн РНК-Seq маалыматтарын жогорку сапаттагы, жакшы аннотацияланган шилтеме геномуна каршы талдоо үчүн иштелип чыккан, бул ген жана транскрипт деңгээлинде сапаттык жана сандык анализди камсыз кылат. Сапатты көзөмөлдөөдөн кийин, толук узундуктагы химердик эмес (FLNC) ырааттуулуктар алынат жана ашыкча транскрипттерди алып салуу үчүн консенсус ырааттуулуктары шилтеме геномуна карталанат. Бул транскрипт топтомунан экспрессия сандык жактан аныкталат жана дифференциалдык түрдө экспрессияланган гендер жана транскрипттер аныкталат жана функционалдык жактан аннотацияланат. Түтүкчөгө ошондой эле альтернативдүү полиаденилдөө (APA) анализи, альтернативдүү сплайсинг анализи, жөнөкөй ырааттуулукту кайталоо (SSR) анализи, lncRNA жана тиешелүү буталарды божомолдоо, коддоо ырааттуулуктарын (CDS) божомолдоо, ген үй-бүлөсүн анализдөө, транскрипция факторун анализдөө, жаңы гендерди божомолдоо жана транскрипттердин функционалдык аннотациясы кирет.