Кичинекей РНК секвенирлөө-Illumina
Өзгөчөлүктөрү
● Өлчөмдү тандоо китепканасын даярдоо.
● Биоинформатикалык анализ miRNA божомолуна жана максаттарына багытталган.
Кызматтын артыкчылыктары
●Кеңири экспертизаБиз ар кандай үлгү түрлөрүн камтыган 300дөн ашык үлгүлөрдү иштеттик. Биз ар бир долбоорго тажрыйбанын байлыгын алып келебиз.
●Катуу сапатты көзөмөлдөөБиз үлгү даярдоодон баштап, китепканага даярдоого, ырааттуулукту аныктоого жана биоинформатикага чейинки бардык этаптарда негизги көзөмөл пункттарын ишке ашырабыз. Биздин кылдат мониторингибиз дайыма жогорку сапаттагы натыйжаларды алууну камсыз кылат.
●Комплекстүү биоинформатикалык анализ:Бул белгилүү жана жаңы miRNAларды аныктоого, miRNAлардын буталарын аныктоого жана тиешелүү функционалдык аннотацияларды түзүүгө жана бир нече маалымат базалары (KEGG, GO) менен байытууга мүмкүндүк берет.
●Сатуудан кийинки колдооБиз катышуунун канчалык маанилүү экенин түшүнөбүз, ошондуктан биздин милдеттенмебиз долбоорду аяктоодон тышкары, 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтүн камтыйт. Бул убакыттын ичинде биз долбоорду көзөмөлдөө, көйгөйлөрдү чечүүгө жардам берүү жана жыйынтыктарга байланыштуу ар кандай суроолорго жооп берүү үчүн суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.
Үлгү талаптары жана жеткирүү
| Китепкана | Платформа | Сунушталган маалыматтар | Маалыматтардын сапатын көзөмөлдөөчү |
| Өлчөм тандалды | Иллюмина SE50 | 10M-20M окуулар | Q30≥85% |
Үлгү талаптары:
Нуклеотиддер:
| Конц. (нг/мкл) | Суммасы (мкг) | Тазалык | Бүтүндүк |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Гелде белоктун же ДНКнын булганышы чектелген же такыр жок экени көрсөтүлгөн. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; базалык бийиктиги чектелген же такыр жок |
● Өсүмдүктөр:
Тамыр, сабак же желекче: 450 мг
Жалбырак же урук: 300 мг
Мөмө-жемиш: 1,2 г
● Жаныбар:
Жүрөк же ичеги: 450 мг
Ички органдар же мээ: 240 мг
Булчуң: 600 мг
Сөөктөр, чач же тери: 1,5 г
● Муун буттуулар:
Курт-кумурскалар: 9 г
Рак сымалдары: 450 мг
● Бүтүн кан: 2 түтүк
● Уячалар: 106 клеткалар
● Кан сары суусу жана плазма:6 мл
Сунушталган үлгү жеткирүү
Контейнер: 2 мл центрифуга түтүгү (калай фольга сунушталбайт)
Үлгү белгилөө: Топ+көчүрмө, мисалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жөнөтүү:
1. Кургак муз: Үлгүлөрдү баштыктарга салып, кургак музга көмүү керек.
2. РНК-туруктуу түтүктөр: РНК үлгүлөрүн РНК-турукташтыруу түтүгүндө (мисалы, RNAstable®) кургатып, бөлмө температурасында жеткирүүгө болот.
Кызмат көрсөтүүнүн жумуш агымы
Эксперименттик дизайн
Үлгү жеткирүү
РНКны бөлүп алуу
Китепкана куруу
Ырааттуулук
Маалыматтарды талдоо
Сатуудан кийинки кызматтар
Биоинформатика
● Чийки маалыматтардын сапатын көзөмөлдөө
● Кичинекей РНКнын классификациясы
● miRNA экспрессиясы жана дифференциалдык экспрессияны талдоо
● miRNA максаттуу гени жана дифференциалдуу экспрессияланган miRNA максаттуу генинин аннотациясы
● Максаттуу генди аннотациялоо жана дифференциалдуу экспрессияланган miRNA ген функциясын байытуу
miRNAны аныктоо: түзүлүшү жана тереңдиги
miRNAнын дифференциалдык экспрессиясы – иерархиялык кластерлөө
Дифференциалдуу экспрессияланган miRNAлардын бутасынын функционалдык аннотациясы
BMKGene компаниясынын sRNA секвенирлөө кызматтары тарабынан ишке ашырылган изилдөө жетишкендиктерин тандалган басылмалар жыйнагы аркылуу изилдеңиз.
Чен, Х. жана башкалар (2023) 'Вирустук инфекциялар Panax notoginsengде сапонин биосинтезин жана фотосинтезди басаңдатат',Өсүмдүктөрдүн физиологиясы жана биохимиясы, 203, б. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Ли, Х. жана башкалар (2023) 'Өсүмдүктүн FYVE доменин камтыган FREE1 протеини микропроцессордун компоненттери менен байланышып, miRNA биогенезин басат',EMBO отчеттору, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ю, Ж. жана башкалар (2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p бал аарысынын Apis melliferaдагы бир нече эпидермалдык өсүү факторуна окшош 8-генди (megf8) бутага алуу менен личинка куурчакчасынын өнүгүшүн көзөмөлдөйт',Эл аралык молекулярдык илимдер журналы, 24(6), 5726-бет. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Эттин сапаты менен байланышкан MiRNA жана гендердин интеграцияланган анализи Gga-MiR-140-5p тооктордун булчуң ичиндеги майдын топтолушуна таасир этерин көрсөттү',Клеткалык физиология жана биохимия, 46(6), 2421–2433-бб. doi: 10.1159/000489649.
