Superlative Genomics
Servitium Commoda
analyses comprehensivas involucrum, quod octo analyses maxime requiritur
Excelsa commendatio in analysi cum accurata et facili interpretatione de eventibus
Bene disposuerat paratus-ad-evulgare figuras
●Proh peritus bioinformatics equos diversa personalizata analysis postulat
Brevius rursus circa tempus cum superiore accurate in analysis
● Experientia abundanter cum super 90 secundis casibus cum ictum factorem super 900 . cumulativum editum
Service Specifications
| Aestimari rursus, circa tempus | numerus specierum | Analyses |
| XXX opus diebus | 6 - 12 | Gene familia pampineis Gene familiae expansio et contractio Constructione phylogenetica arbor Pars temporis aestimatio (Fossilia calibration requiritur) LTR tempus insertio (Pro plantis) Totum genome duplicatum (Pro plantis) Pressura electionem selectivam Synteny analysis |
Bioinformatics analyses
Gene family
Phylogenetica
tempus
selectivam pressura
Synteny analysis
Sample Requisita et Delivery
Sample Requisita:
TEXTUS seu DNA ad genome sequencia et conventus
Nam TEXTUS
| Species | TEXTUS | Survey | PacBio CCS |
| Animal | Viscerum | 0.5 ~ 1g | ≥ 3.5g |
| Musculus TEXTUS | |||
| ≥ 5.0g | |||
| ≥ 5.0mL | |||
| Mammalia sanguinis | |||
| ≥ 0.5mL | |||
| Gallinae / Piscium sanguine | |||
| Planta | Folium recens | 1 ~ 2g | ≥ 5.0g |
| Petal/Stem | 1 ~ 2g | ≥ 10.0g | |
| Radix/Semen | 1 ~ 2g | ≥ 20.0g | |
| Cellulae | Cellula culta | - | ≥ 1 x 108 |
Data
Genome series imaginum (.fasta) et imaginum annotationis (.gff3) specierum propinquarum
Service Opus O
Experimentum design
Sample traditio
Library construction
Sequencing
Analysis
Post-venditionis officia
*Demo eventus hic ostensi sunt omnes e genomes editis apud Biomarker Technologies
1.LTR temporis aestimatio inserta: Figura ostendit singularem distributionem bimodalem in LTR-RTs inserendi temporibus in genoma secali Weining, aliis speciebus comparatum.Recentissimum apicem circiter 0,5 miliones annos apparuit.
Li Guang et al.Natura Genetics, 2021
2.Phylogenia et analysis gena familiae in chayote (Sechium edule): Per chayote et reliquas 13 species cognatorum generum familiae digerendo inventa est Chayote arctissima cum cucurbita anguina (Trichosanthes anguina).Chayote derivata ab cucurbita serpentis in circuitu 27-45 Mya et duplicatione tola genoma (WGD) observata est in chayote in 25±4 Mya, quod est tertium WGD eventum in cucuibitaceis.
Fu A et al.Investigatio horti, 2021
3. Synteny analysis: Quaedam genera ad phytohormones in fructu evolutionis pertinentia inventa sunt in chayote, cucurbita et cucurbita serpentis.Correlatio inter chayote et cucurbitae paulo altior est quam inter cucurbitam et cucurbitam anguis.
Fu A et al.Investigatio horti, 2021
4. Genera analysi familiae: KEGG ditior ad expansionem et contractionem familiae generum in G.thurberi et G.davidsonii genomes monstravit biosynthesin et brasinosteroidea biosynthesi cognatae genesis dilatatae.
Yang Z et al.BMC Biology, 2021
5. Analysis genome duplicatio: 4DTV et Ks analysis distributio totius genoma duplicationis eventuum ostensa est.Montium intraspecierum duplicationem eventus ostenderunt.Montium interspecierum speciatio eventus ostendit.Analysis significavit comparationem cum aliis tribus speciebus proxime affinibus O. europaea per magnam scalam gene duplicationem recentius perrexisse.
Rao G et al.Investigatio horti, 2021
BMK Case
Rosa sine aculeo: perceptos genomicas cum humori adaptatione coniungitur
Published: National Scientiae Review, 2021
De consilio sequendo:
'Basye's'Thornless' (R.Wichurainan) genome:
Proxime.93 X PacBio + approx.90 X Nanopore + 267 X Illumina
Eventus key
1. Generosa R.wichuraiana genome constructa est utens technicis longis-legendis sequendis, quae cedunt conventum 530.07 Mb (magnitudo genome Aestimata circiter 525.9 Mb erat iuxta cytometriam fluxum et 525.5 per genome survey； Heterozygositas circa 1.03%).BUSCO score aestimatur 93,9% erat.Comparando cum "Puero rubore" (haploOB), qualitas et perfectio huius genome confirmata est a basi unius-basi accuratione et indice conventus LTR (LAI=0.03).R.wichuraiana genome continet 32.674 interdum genesis coding.
2. Multi-omici analysi iuncturae, constans genomicis, transcriptomicis, QTL analysi geneticae incolarum, constantem speciationem crucialem inter R. wichuraiana et Rosa chinensem manifestaverunt.Etiam, expressio variatio generum in QTL cognatorum generum in QTL cum aculeo exemplaris associari verisimile erat.
Anaysis genomica comparativa inter Basye;s Thornless et Rosa chinensis, inter quas synteny analysin, genus botri generis, expansio et contractio analysis, magnum numerum varietatum revelavit, quae notae cruciales in rosis relatae sunt.Dilatatio unica in NAC et FAR1/FRS familia gene genetica valde verisimile est cum macula nigra resistenti sociari.
Analysis genomica comparativa inter BT et haploOB genomes.
Zhong, M., et al."Rosa sine aculeo: genomica perceptiones cum humori adaptatione"National Scientiae Review, 2021, nwab092.
