Genomica Comparativa
Commoda Servitii
●Peritia Ampla et Acta PublicationumCum accumulatione, BMKGene plus quam 90 proiecta genomicae comparativae perfecit, cum factore impactus cumulativo 900 perveniente.
●Analysis bioinformatica comprehensivaFasciculus analytica octo analyses frequentissime requisitas continet, figuras bene designatas et ad publicandum paratas praebens et facilem interpretationem eventuum permittens.
●Turma bioinformatica peritissima et cyclus analysis brevisMagna experientia in analysi genomicae comparativae praedita, turma BMKGene variis postulatis analysis personalizatis brevi tempore satisfacit.
●Auxilium Post-Venditionis:Nostra obligatio ultra completionem operis extenditur, cum spatio trium mensium servitii post-venditionis. Per hoc tempus, subsequentia operis, auxilium in remediis difficultatum, et sessiones interrogationum et responsionum offerimus ad quaslibet quaestiones de eventibus tractandas.
Specificationes Servitii
| Tempus conversionis aestimatum | Numerus specierum | Analyses |
| Triginta dies laboris | VI - XII | Congregatio familiae genorum Expansio et contractio familiae genorum Constructio arboris phylogeneticae Aestimatio temporis divergentiae (calibratio fossilium requiritur) Tempus insertionis LTR (plantis) Duplicatio totius genomi (pro plantis) Pressio selectiva Analysis synteniae |
Analyses bioinformaticae
● Familia genetica
● Phylogenetica
● Tempus divergentiae
● Pressio selectiva
● Analysis synteniae
Requisita Exemplorum et Traditio
Requisita Exemplorum:
Textus vel ADN ad sequentiationem et compositionem genomi
Pro Textu
| Species | Textus | Inspectio | PacBio CCS |
| Animal | Textus visceralis | 0.5 ~ 1 grammata | ≥ 3.5 g |
| Textus muscularis | |||
| ≥ 5.0 g | |||
| ≥ 5.0 mL | |||
| Sanguis mammalium | |||
| ≥ 0.5 mL | |||
| Sanguis avium/piscium | |||
| Planta | Folium recens | 1 ~ 2 grammata | ≥ 5.0 g |
| Petalum/Caulis | 1 ~ 2 grammata | ≥ 10.0 g | |
| Radix/Semen | 1 ~ 2 grammata | ≥ 20.0 g | |
| Cellulae | Cellula culta | - | ≥ 1 × 108 |
Data
Fasciculi sequentiarum genomatis (.fasta) et fasciculi annotationum (.gff3) specierum arcte cognatarum
Fluxus Operis Servitii
Designatio experimenti
Traditio speciminis
Constructio bibliothecae
Sequentiatio
Analysis datorum
Officia post-venditionis
*Resultata demonstrationis hic monstrata omnia ex genomis cum Biomarker Technologies editis sunt.
1. Aestimatio temporis insertionis LTR: Figura distributionem bimodalem singularem in temporibus insertionis LTR-RTs in genoma secalini Weining ostendit, comparatum cum aliis speciebus. Culmen recentissimum apparuit abhinc annos circiter 0.5 miliones.
Li Guang et alii.Genetica Naturae, 2021
2. Analysis phylogenesis et familiae genorum in *Sechio edule* chayota: Analysando chayotam et alias 13 species cognatas in familia genorum, Chayota maxime cognata cum *Trichosanthe anguina* inventa est. Chayota a *Trichosanthe anguina* derivata est ante circiter 27-45 Mya et duplicatio totius genomi (WGD) in chayota ante 25±4 Mya observata est, quod est tertium eventum WGD in *Cucuibitaceis*.
Fu A et alii.Investigatio Horticulturae, 2021
3. Analysis synteniae: Nonnulla gena ad phytohormona in fructuum evolutione pertinentia in chayota, cucurbita serpentina et cucurbita inventa sunt. Correlatio inter chayotam et cucurbitam paulo altior est quam quae inter chayotam et cucurbitam serpentinam pertinet.
Fu A et alii.Investigatio Horticulturae, 2021
4. Analysis familiae genorum: Locupletatio KEGG in expansione et contractione familiae genorum in genomis G. thurberi et G. davidsonii ostendit genes biosynthesis steroidum et biosynthesis brassinosteroidum relatos expansos esse.
Yang Z et alii.BMC Biologia, 2021
5. Analysis duplicationis totius genomi: analysis distributionis 4DTV et Ks duplicationem totius genomi ostendit. Cacumina intraspeciem duplicationes ostenderunt. Cacumina interspeciem speciationes ostenderunt. Analysis indicavit O. europaeam, comparatam cum aliis tribus speciebus arcte cognatis, recentius duplicationem genorum magnae scalae subisse.
Rao G et alii.Investigatio Horticulturae, 2021
BMK Case
Rosa sine aculeis: perspicientiae genomicae cum adaptatione ad humiditatem coniunctae.
Publicatum: Recensio Scientiae Nationalis, 2021
Ratio sequentiandi:
BasyeSine spinis(R.)Wichurainan) genoma:
Circiter 93 X PacBio + circiter 90 X Nanopore + 267 X Illumina
Resultata principalia
1. Genomum R.wichuraianae altae qualitatis constructum est utens technicis sequentiationis longae lectionis, quae congregationem 530.07 Mb praebuerunt (magnitudo genomatis aestimata erat circiter 525.9 Mb per cytometriam fluxus et 525.5 per inquisitionem genomatis; Heterozygositas erat circiter 1.03%). Punctum BUSCO aestimatum erat 93.9%. Comparatum cum "Old blush" (haploOB), qualitas et completio huius genomatis confirmata est per accuratam basis singularis et indicem congregationis LTR (LAI = 20.03). Genomum R.wichuraianae continet 32,674 gena proteinorum codificantia.
2. Analysis coniuncta multi-omica, genomica comparativa, transcriptomica, et analysi QTL populationis geneticae constans, speciationem crucialem inter *R. wichuraianam* et *Rosam chinensem* revelavit. Praeterea, variatio expressionis genorum affinium in QTL verisimiliter cum configuratione aculeorum caulis coniuncta est.
Analysis genomica comparativa inter *Basye's Thornless* et *Rosam chinensem*, inclusa analysi synteniae, fasciculorum familiae genorum, et expansionis et contractionis, magnum numerum variationum ostendit, quae ad proprietates cruciales in rosis pertinebant. Expansio singularis in familiis genorum NAC et FAR1/FRS probabilissime cum resistentia contra *maculam nigram* coniuncta est.
Analysis genomica comparativa inter genoma BT et haploOB.
Zhong, M., et al. "Rosa sine aculeo: perspicientiae genomicae cum adaptatione ad humiditatem coniunctae"Recensio Scientiae Nationalis(Anno MMXXI; nwab092).
