Genetics Evolutionis
Servitium Commoda
Takagi et al.Acta plantarum, 2013
Aestimare species diversitatem temporis et velocitatis secundum variationes in gradu nucleotide et amino acida
Revelantia certius relationem phylogeneticae inter species cum influxu evolutionis convergentium et evolutione parallelo elevato.
Nexus inter geneticas mutationes et phaenotypos construere ut lineamentum genesis actis detegamus
Aestimare diversitatem geneticam, quae reflectit evolutionis potentiae speciei
Velocius Turnaround tempus
● Extensiva experientia: BMK magnam experientiam in hominum et evolutionis relatarum inceptis coacervatam plusquam XII annos, centenas speciei, etc. contulit, et plus quam 80 alta incepta in Natura Communicationum, Plantarum Moleculares, Plantarum Acta Biotechnologiae Plantarum, etc.
Service Specifications
Materiae:
Communiter, saltem tres sub-populationes (exempli species vel modos) commendatur.Quaelibet sub-multitudo continere debet non minus quam X singulos (Plantae -15, ob raras species reduci possunt).
De consilio sequendo:
* WGS pro speciebus adhiberi potest cum genoma summa qualitate referente, SLAF-Seq ad species applicatur vel cum genoma vel sine relatio, vel genoma speciei vilitatis referente.
| Locum genome magnitudine | WGS | SLAF-Tas (×10,000) |
| ≤ 500 Mb | 10×/singula | WGS magis commendatae |
| 500 Mb | 10 | |
| 1 Gb - 2 Gb | 20 | |
| ≥2 Gb | 30 |
Bioinformatics analyses
Analysis Evolutionis
selectivam facie
Gene fluunt
Historiae Demographicae
tempus
Sample Requisita et Delivery
Sample Requisita:
| Species | TEXTUS | WGS-NGS | SLAF |
| Animal
| Viscerum |
0.5~1g
|
0.5g
|
| Musculus TEXTUS | |||
| Mammalia sanguinis | 1.5mL
| 1.5mL
| |
| Gallinae / Piscium sanguine | |||
| Planta
| Folium recens | 1~2g | 0.5~1g |
| Petal/Stem | |||
| Radix/Semen | |||
| Cellulae | Cellula culta |
| gDNA | Coniunctis | Moles (ug) | OD260/OD280 |
| SLAF | ≥35 | ≥1.6 | 1.6-2.5 |
| WGS-NGS | ≥1 | ≥0.1 | - |
Service Opus O
Experimentum design
Sample traditio
Library construction
Sequencing
Analysis
Post-venditionis officia
*Proventus Demo hic ostensus sunt omnes e genomes cum BMKGENE editis
1. Evolutionis analysis continet constructionem arboris phylogeneticae, hominum structurae et PCA secundum variationes geneticae.
Arbor phylogenetica relationes taxonomicae et evolutionis inter species cum dempto communi repraesentat.
PCA intendit ad visualize propinquitatem inter sub-populationes.
Structura incolarum ostendit praesentiam genece sub-populationis distinctae in terminis frequentiarum allelarum.
Chen, et.al.PNAS, 2020
2.Selective facie
Verrus selectivus refertur ad processum, quo situs opportunus eligitur et frequentiae coniunctorum situs neutrarum augentur et situs nexus minuuntur, inde reductione regionalium.
Deprehensio genome-wide in regiones selectivas deprehensio processit a calculis hominum index geneticiπ，Fst, Tajimas D) omnium SNPs intra fenestram delabentem (100 Kb) ad certum gradum (10 Kb).
Nucleotide diversitas (π *
Tajima's D
Fixation index(Fst)
Wu, et.al.Planta hypothetica, 2018
3.Gene O
Wu, et.al.Planta hypothetica, 2018
4.Demographic historia
Zhang, et.al.Natura Ecologiae & Evolutionis, 2021
5.Divergence tempore
Zhang, et.al.Natura Ecologiae & Evolutionis, 2021
BMK Case
Tabula variatio genomica perspicientia praebet in fundamento genetico Veris Sinensi Brassicae (Brassica rapa ssp. Pekinensis) lectio
Published: Planta hypothetica, 2018
De consilio sequendo:
Resequens: sequenceing profundum: 10×
Eventus key
In hoc studio 194 brassicae Sinenses processerunt ad re-sequendum cum altitudine mediocris 10×, quae dabant 1,208,499 SNPs et 416,070 InDels.Analysis phylogenetica in his 194 versibus ostenditur, has lineas in tres ecotypa dividi posse, vere, aestatem et autumnum.Praeterea, hominum structura et analysis PCA significabat vere brassicam Sinensem ortam esse ex brassica autumnali in Shandong, Sinis.Qui postea in Coream et Iaponiam introducti sunt, lineis localibus transierunt et nonnullae varietates earum late- patulae in Sinas introductae sunt et demum ver brassicae Sinenses factae sunt.
Genome-late intuens in vere caules Sinenses et caulas autumnales in delectu revelata 23 loca genomica quae per validam electionem transierunt, quorum duo e regione temporis continentis in QTL-mapping fundata erant.Hae duae regiones inventae sunt continentes gena clavorum regularium florentium, BrVIN3.1 et BrFLC1.Haec duo genera amplius confirmata sunt ut tempus claudendi per studium transumptum et experimenta transgenica involvantur.
 Populatio analysis structuram in caulibus Sinica |  Geneticae notitia in Seres brassica lectio |
Tongbing, et al."A Genomic Variationis Map Insights in Geneticae Basis Veris Sinensium Brassicae (Brassica rapa ssp.pekinensis) Electio praebet."Plantae hypotheticae11(2018):1360-1376.
