circRNA Sequencing-Illumina
Eegeschaften
● rRNA Ausschöpfung gefollegt vun der Direktiounsbibliothéikpräparatioun, wat Sequenzéierungsdaten erméiglecht, déi strengspezifesch sinn.
● Bioinformatesche Workflow erméiglecht circRNA Viraussoen an Ausdrockquantifikatioun
Service Virdeeler
●Méi ëmfaassend RNA Bibliothéiken:mir benotzen rRNA Ausarmung amplaz vun linear RNA Ausschöpfung an eiser Pre-Bibliothéik Virbereedung, garantéiert datt d'Sequenzéierungsdaten net nëmmen circRNA enthalen awer och mRNA an lncRNA, wat eng gemeinsam Analyse op dësen Datesätz erméiglecht.
●Optional Analyse vu kompetitive endogenen RNA (ceRNA) Netzwierker: méi déif Abléck an cellulär Reguléierungsmechanismen ubidden
●Extensiv Expertise: mat engem Track Record vun der Veraarbechtung vun iwwer 20.000 Echantillon bei BMK, déi verschidde Probetypen an lncRNA Projeten iwwerspannt, bréngt eis Team e Räichtum un Erfahrung fir all Projet.
●Richteg Qualitéitskontroll: Mir implementéiere Kär Kontrollpunkten iwwer all Stadien, vu Probe a Bibliothéikpräparatioun bis Sequenzéierung a Bioinformatik.Dës virsiichteg Iwwerwaachung garantéiert d'Liwwerung vu konsequent qualitativ héichwäerteg Resultater.
● Post-Verkaf Ënnerstëtzung: Eist Engagement erstreckt sech iwwer d'Réalisatioun vum Projet mat enger 3-Mount After-Sale Service Period.Wärend dëser Zäit bidde mir de Projet Suivi, Troubleshooting Hëllef, a Q&A Sessiounen fir all Ufroen am Zesummenhang mat de Resultater unzegoen.
Prouf Ufuerderunge a Liwwerung
| Bibliothéik | Plattform | Recommandéiert Donnéeën | Daten QC |
| Poly A beräichert | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Sample Ufuerderunge:
Nukleotiden:
| Konzentratioun (ng/μl) | Betrag (μg) | Rengheet | Integritéit |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limitéiert oder keng Protein oder DNA Kontaminatioun op Gel gewisen. | Fir Planzen: RIN≥6,5; Fir Déieren: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitéiert oder keng Basislinn Héicht |
● Planzen:
Wuerzel, Stamm oder Bléieblieder: 450 mg
Blat oder Som: 300 mg
Uebst: 1,2 g
● Déier:
Häerz oder Darm: 450 mg
Viscera oder Gehir: 240 mg
Muskel: 600 mg
Schanken, Hoer oder Haut: 1,5g
● Arthropoden:
Insekten: 9g
Crustacea: 450 mg
● Ganz Blutt:2 rohren
● Zellen: 106 Zellen
● Serum a Plasma:6ml
Recommandéiert Sample Liwwerung
Behälter: 2 ml Zentrifuge Röhre (Zinnfolie ass net recommandéiert)
Probe Etikettéierung: Grupp + replizéieren zB A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Sendung:
1. Dréchent Äis: Echantillon mussen a Poschen gepackt ginn an an dréchen Äis begruewe ginn.
2. RNAstable Réier: RNA Echantillon kënnen an RNA Stabiliséierung Rouer gedréchent ginn (zB RNAstable®) an an Raumtemperatur geschéckt.
Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
RNA Extraktioun
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
Bioinformatik
circRNA Prediction: chromosomal Verdeelung
Differenziell ausgedréckt circRNAs - Vulkan Komplott
Differenziell ausgedréckt CirRNAs - hierarchesch Clustering
Funktionell Beräicherung vun circRNA d'Host Genen
Entdeckt d'Fuerschungsfortschrëtter erliichtert vum BMKGene 'circRNA Sequenzéierungsservicer duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen.
Wang, X, et al.(2021) 'CPSF4 reguléiert d'CirRNA-Bildung an d'MicroRNA-mediéiert Gen-Silencing am hepatozelluläre Karzinom', Oncogene 2021 40:25, 40(25), S. 4338-4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al.(2023) 'X oo-reaktiounsfäeger Transkriptom weist d'Roll vum kreesfërmegen RNA133 an der Krankheetresistenz duerch d'Reguléierung vum Ausdrock vun OsARAB am Reis', Phytopathology Research, 5(1), S. 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/Figuren/6.
Y, H et al.(2023) 'CPSF3 moduléiert d'Gläichgewiicht vun kreesfërmeg a linear Transkriptiounen am hepatozelluläre Karzinom'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Comprehensive Evaluation of circRNAs in cirrhotic cardiomyopathie virun an no der Liewer Transplantatioun', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
