Illumina an BGI
Eegeschaften
●Plattformen:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten a BGI-DNB-T7
●Sequenzéierungsmodi:PE50, PE100, PE150, PE250
●Qualitéitskontroll vu Bibliothéiken virum Sequenzéierung
●Sequenzéierungsdaten Liwwerung a QC:Liwwerung vun QC Rapport an Matière Daten am fastq Format no demultiplexing an Filter Q30 liesen.
Service Virdeeler
●Villsäitegkeet vu Sequencing Servicer:de Client kann decidéieren no Spuer, Fluxzell oder Betrag vun Daten ze sequenzéieren.
●Villsäitegkeet vu Plattformen:DNB Bibliothéike kënnen op Illumina Plattformen transferéiert ginn
●Extensiv Erfahrung op der Illumina Sequenzéierungsplattform:mat Dausende vu zouene Projete mat verschiddenen Arten.
●Liwwerung vum Sequenzéierungs QC Bericht:mat Qualitéitsmetriken, Datengenauegkeet an allgemeng Leeschtung vum Sequenzéierungsprojet.
●Mature Sequenzéierungsprozess:mat kuerzer Wendung Zäit.
●Richteg Qualitéitskontroll: Mir implementéieren strikt QC Ufuerderunge fir d'Liwwerung vu konsequent héichqualitativen Resultater ze garantéieren.
Beispill Ufuerderunge *
Partiell Lane Sequencing
| Datebetrag (X) | Konzentratioun (qPCR/nM) | Volumen |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Single Lane (Illumina)
| Plattform | Konzentratioun (qPCR/nM) | Volumen |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Zousätzlech zu der Konzentratioun an der Gesamtbetrag ass och e passende Peakmuster erfuerderlech.
Gitt w.e.g. un eis wann Är Proben net den Ufuerderunge vum Startmaterial entspriechen.
Service Workflow
Bibliothéik Qualitéitskontroll
Sequenzéieren
Daten Qualitéitskontroll
Projet Liwwerung
Bibliothéik QC Rapport
E Bericht iwwer d'Qualitéit vun der Bibliothéik gëtt virum Sequenzéierung geliwwert, d'Bibliothéiksbetrag beurteelt a Fragmentatioun.
Sequenzéierung QC Bericht
Dësch 1. Statistiken op sequencing Donnéeën.
| Beispill ID | BMKID | Raw liest | Raw Daten (bp) | Propper Liesungen (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figur 1. Qualitéit Verdeelung laanscht liest an all Prouf
Figur 2. Basis Inhalt Verdeelung
Figur 3. Verdeelung vun liesen Inhalt am Sequenz Donnéeën
