-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq bitt Genom-breet Profiléierung vun DNA Ziler fir Histonmodifikatioun, Transkriptiounsfaktoren an aner DNA-assoziéiert Proteinen.Et kombinéiert d'Selektivitéit vu Chromatin-Immunausfäll (ChIP) fir spezifesch Protein-DNA-Komplexen ze recuperéieren, mat der Kraaft vun der nächster Generatioun Sequencing (NGS) fir High-Throughput-Sequenzéierung vun der erholl DNA.Zousätzlech, well d'Protein-DNA Komplexe vu liewegen Zellen erholl ginn, kënne Bindungsplazen a verschiddenen Zellarten a Stoffer vergläicht ginn, oder ënner verschiddene Konditiounen.Uwendungen reichen vun transkriptionaler Reguléierung bis Entwécklungsweeër bis Krankheetsmechanismen an doriwwer eraus.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
-
Ganz Genom Bisulfit Sequenzéierung
DNA Methylatioun op der fënnefter Positioun am Zytosin (5-mC) huet e fundamentalen Afloss op Genausdrock an Zellaktivitéit.Abnormal Methylatiounsmuster si mat verschiddene Konditiounen a Krankheeten verbonne ginn, wéi Kriibs.WGBS ass de Goldstandard ginn fir Genom-breet Methylatioun bei enger eenzeger Basisopléisung ze studéieren.
Plattform: Illumina NovaSeq6000
-
Assay fir Transposase-Accessible Chromatin mat High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq ass eng High-Throughput Sequenzéierungsmethod fir d'Analyse vun der Genom-breet Chromatin Accessibilitéit, wat wichteg ass fir déi global epigenetesch Kontroll vum Genausdrock.Sequencing Adapter ginn an oppe Chromatinregiounen duerch hyperaktiv Tn5 Transposase agebaut.No PCR Amplifikatioun gëtt eng Sequenzéierungsbibliothéik konstruéiert.All déi oppe Chromatinregiounen kënnen ënner engem spezifesche Raumzäitbedingung kritt ginn, net nëmmen op d'Bindungsplaze vun engem Transkriptiounsfaktor oder enger gewëssener Histon modifizéierter Regioun limitéiert.
-
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)
DNA Methylatiounsfuerschung war ëmmer e waarmt Thema an der Krankheetsfuerschung, an ass enk verbonne mat Genausdrock a phänotypesche Charakteren.RRBS ass eng korrekt, effizient a wirtschaftlech Method fir DNA Methylatiounsfuerschung.D'Beräicherung vu Promoteur a CpG Inselregiounen duerch enzymatesch Spaltung (Msp I), kombinéiert mat Bisulfit Sequenzéierung, bitt héich Opléisung DNA Methylatiounserkennung.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
