Eukaryotesch mRNA Sequencing-Illumina
Virdeeler
ØHéich Erlieft: Iwwer 200.000 Echantillon goufen am BMK veraarbecht, déi verschidde Probe-Typen ofdecken, dorënner Zellkultur, Tissu, Kierperflëssegkeet, asw.. an iwwer 7.000 mRNA-Seq-Projeten zougemaach iwwer verschidde Fuerschungsberäicher.
ØStrikt Qualitéitskontrollsystem: Kernqualitéitskontrollpunkte duerch all Schrëtt abegraff Probepräparatioun, Bibliothéikpräparatioun, Sequenzéierung a Bioinformatik sinn ënner enker Iwwerwaachung fir qualitativ héichwäerteg Resultater ze liwweren.
ØMultiple Datenbanken verfügbar fir Funktiounsannotatioun a Beräicherungsstudien fir verschidde Fuerschungsziler ze erfëllen.
ØAfter-sale-Servicer: After-sale-Servicer gëlteg fir 3 Méint nom Ofschloss vum Projet, inklusiv Projete Suivi, Troubleshooting, Resultater Q&A, etc.
Prouf Ufuerderunge a Liwwerung
| Bibliothéik | Sequenzéierungsstrategie | Daten recommandéiert | Qualitéitskontroll |
| Poly A beräichert | Illumina PE150 | 6 gbg | Q30≥85% |
Sample Ufuerderunge:
Nukleotiden:
| Rengheet | Integritéit | Betrag |
| OD260/280≥1.7-2.5 OD260/230≥0.5-2.5Limitéiert oder keng Protein oder DNA Kontaminatioun op Gel gewisen. | Fir Planzen: RIN≥6.5; Fir Déieren: RIN≥7;28S/18S≥1.0;limitéiert oder keng Basislinn Héicht | Konz.≥30 ng/μl;Volumen ≥ 10 μl;Total ≥ 1,5 μg |
Tissue: Gewiicht (dréchen):≥1 g
* Fir Tissue méi kleng wéi 5 mg, empfeelen mir Flash gefruerene (a flëssege Stickstoff) Tissueprobe ze schécken.
Zell Suspension:Zellzuel = 3×106- 1 × 107
* Mir recommandéieren gefruer Zell lysate ze schécken.Am Fall datt d'Zelle méi kleng wéi 5 × 105 zielt, gëtt Flash gefruer a flëssege Stickstoff recommandéiert, wat am léifsten ass fir Mikroextraktioun.
Bluttprouwen:Volume ≥1 ml
Mikroorganismen:Mass ≥ 1 g
Recommandéiert Sample Liwwerung
Behälter: 2 ml Zentrifuge Röhre (Zinnfolie ass net recommandéiert)
Probe Etikettéierung: Grupp + replizéieren zB A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Sendung:
- Dréchent Äis: D'Probe mussen a Poschen gepackt ginn an an dréchen Äis begruewe ginn.
- RNAstable Réier: RNA Echantillon kënnen an RNA Stabiliséierungsröhre gedréchent ginn (zB RNAstable®) a bei Raumtemperatur verschéckt ginn.
Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
RNA Extraktioun
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
Bioinformatik
Eukaryotesch mRNA Sequencing Analyse Workflow
Bioinformatik
ØMatière Daten Qualitéitskontroll
ØReferenz Genom Ausrichtung
ØTranskript Struktur Analyse
ØAusdrock Quantifikatioun
ØDifferential Ausdrock Analyse
ØFunktioun Annotatioun a Beräicherung
1.mRNA Daten Saturatiounskurve
2.Differential Ausdrock Analyse-Vulkan Komplott
3.KEGG Annotatioun op DEGs
4.GO Klassifikatioun op DEGs
