Genomwäit Associatiounsanalyse
Aarbechtsfloss
Virdeeler vum Service
●Grouss Expertise a PublikatiounsrecordsMat der gesammelter Erfahrung am GWAS huet BMKGene Honnerte vun Aarteprojeten an der Populatiouns-GWAS-Fuerschung ofgeschloss, Fuerscher gehollef méi wéi 100 Artikelen ze publizéieren, an de kumulative Impaktfaktor huet 500 erreecht.
● Ëmfangräich bioinformatesch AnalyseDe Workflow enthält eng SNP-Trait-Associatiounsanalyse, déi eng Rei vu Kandidatengenen an hir entspriechend funktionell Annotatioun liwwert.
●Héichqualifizéiert Bioinformatikteam a kuerzen AnalysezyklusMat grousser Erfahrung an der fortgeschrattener Genomikanalyse liwwert d'Team vu BMKGene ëmfaassend Analysen mat enger schneller Ëmsetzungszäit.
●Ënnerstëtzung nom Verkaf:Eis Engagement geet iwwer d'Projetofschloss eraus mat enger 3-Méint After-Sales-Serviceperiod. Wärend dëser Zäit bidden mir Projet-Follow-up, Hëllef bei der Problemléisung a Froestonnen un, fir all Froen am Zesummenhang mat de Resultater ze beäntwerten.
Service Spezifikatiounen an Ufuerderungen
| Aart vun der Sequenzéierung | Recommandéiert Populatiounsskala | Sequenzéierungsstrategie | Ufuerderunge fir Nukleotiden |
| Sequenzéierung vum ganze Genom | 200 Proben | 10x | Konzentratioun: ≥ 1 ng/µL Gesamtbetrag ≥ 30ng Limitéiert oder keng Degradatioun oder Kontaminatioun |
| Spezifesch-Lokus-amplifizéiert Fragment (SLAF) | Tag Déift: 10x Zuel vun den Etiketten: < 400 Mb: WGS gëtt recommandéiert < 1Gb: 100K Tags 1Gb > 2Gb: 300K Tags Maximal 500k Tags | Konzentratioun ≥ 5 ng/µL Gesamtmenge ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1,6-2,5 Agarosegel: keng oder limitéiert Degradatioun oder Kontaminatioun
|
Materialauswiel
Verschidde Varietéiten, Ënnerarten, Landrassen/Genbanken/gemëschte Familljen/wëll Ressourcen
Verschidde Varietéiten, Ënnerarten, Landrassen
Hallefgeschwësterfamill/Ganzgeschwësterfamill/wëll Ressourcen
Service-Aarbechtsfloss
Experimentdesign
Proufliwwerung
RNA-Extraktioun
Bau vun der Bibliothéik
Sequenzéierung
Datenanalyse
After-Sales-Servicer
Enthält déi folgend Analyse:
- Genomwäit Associatiounsanalyse: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM Modell
- Funktionell Annotatioun vu Kandidatengenen
SNP-Trait-Associatiounsanalyse – Manhattan-Diagramm
SNP-Trait-Associatiounsanalyse – QQ-Diagramm
Entdeckt d'Fortschrëtter, déi duerch d'GWAS-Servicer vu BMKGene duerch eng kuréiert Sammlung vu Publikatiounen erméiglecht goufen:
Lv, L. et al. (2023) 'Abléck an d'genetesch Basis vun der Ammoniaktoleranz bei der Raséiermuschel Sinonovacula constricta duerch eng genomwäit Associatiounsstudie',Aquakultur, 569, S. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Multi-omics Analysen vun 398 Fuchsschwanzhirse-Accessiounen weisen genomesch Regiounen op, déi mat Domestizéierung, Metabolit-Eegeschaften an entzündungshemmenden Effekter verbonne sinn',Molekular Planz, 15(8), S. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Genomwäit Associatiounskartéierung vun Hulless Barely Phenotypen an enger dréchener Ëmwelt',Grenzen an der Planzewëssenschaft, 13, S. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, dat fir eng Sulfotransferase kodéiert, vermëttelt Resistenz géint d'Sojabohnenmosaikvirusstämm G2 an G3',Planz, Zell & Ëmwelt, 44(8), S. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
