-
Planz / Déier De novo Genome Sequencing
De neienSequencing bezitt sech op d'Konstruktioun vum ganze Genom vun enger Spezies mat Sequenzéierungstechnologien, zB PacBio, Nanopore, NGS, etc., a Feele vun engem Referenzgenom.Déi bemierkenswäert Verbesserung vun der Lieslängt vun Drëtt Generatioun Sequenzéierungstechnologien huet nei Méiglechkeeten bruecht fir komplex Genomen ze sammelen, sou wéi déi mat héijer Heterozygositéit, héije Verhältnis vu repetitive Regiounen, Polyploiden, asw. Opléisung vun repetitive Elementer, Regioune mat anormal GC Inhalter an aner héich komplex Regiounen.
Plattform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C baséiert Genom Assemblée
Hi-C ass eng Method entwéckelt fir Chromosomkonfiguratioun z'erfaassen andeems se proximity-baséiert Interaktiounen an High-Throughput Sequenzen kombinéiert.D'Intensitéit vun dësen Interaktiounen gëtt ugeholl datt se negativ mat der kierperlecher Distanz op Chromosomen korreléiert sinn.Dofir kéinten Hi-C Daten d'Clustering, Uerdnung an Orientéierung vu versammelt Sequenzen an engem Entworfgenom guidéieren an déi op eng gewëssen Unzuel vu Chromosomen verankeren.Dës Technologie erméiglecht eng Chromosom-Niveau Genomversammlung an der Verontreiung vu Populatiounsbaséierter genetescher Kaart.All eenzel Genom brauch en Hi-C.
Plattform: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Evolutionär Genetik
Evolutiounsgenetik ass e gepackte Sequenzéierungsservice entworf fir eng ëmfaassend Interpretatioun iwwer evolutiver Informatioun vu bestëmmte Materialien op Basis vu genetesche Variatiounen ze bidden, dorënner SNPs, InDels, SVs an CNVs.Et gëtt all fundamental Analyse néideg fir eng beschreiwen evolutive Ännerungen an genetesch Fonctiounen vun Populatiounen, wéi Populatioun Struktur, genetesch Diversitéit, phylogeny Relatiounen, etc.
-
Comparative Genomics
Comparativ Genomik bedeit wuertwiertlech déi komplett Genomsequenzen a Strukture vu verschiddenen Arten ze vergläichen.Dës Disziplin zielt d'Arten Evolutioun, Genfunktioun, Genreguléierungsmechanismus um Genom Niveau z'entdecken andeems d'Sequenzstrukturen an Elementer z'identifizéieren déi iwwer verschidden Arten konservéiert oder differenzéiert sinn.Typesch komparativ Genomikstudie enthält Analysen an der Genfamill, evolutiv Entwécklung, ganz Genom Duplikatioun, selektiven Drock, etc.
-
Bulked Segregant Analyse
Bulked Segregant Analyse (BSA) ass eng Technik déi benotzt gëtt fir séier Phänotyp assoziéiert genetesch Marker z'identifizéieren.Main Workflow vu BSA enthält d'Auswiel vun zwou Gruppe vun Individuen mat extrem opposéierende Phänotypen, d'DNA vun all Individuen ze poolen fir zwee Masse vun DNA ze bilden, Differentialsequenzen tëscht zwee Poolen z'identifizéieren.Dës Technik gouf extensiv benotzt fir genetesch Marker z'identifizéieren déi staark assoziéiert mat geziilte Genen a Planz / Déier Genomen.
