Metatranskriptomsequenzéierung
Service Funktiounen
● rRNA-Depletioun gefollegt vun der Virbereedung vun der direktionaler mRNA-Bibliothéik.
● Sequenzéierung op Illumina NovaSeq.
Virdeeler vum Service
●Studéiert d'Verännerunge vu komplexe mikrobiellen Gemeinschaften:Dëst geschitt op der Transkriptiounsniveau a exploréiert potenziell nei Genen.
●Erklärung vun den Interaktioune vu mikrobiellen Gemeinschaften mam Wirt oder der Ëmwelt.
●Ëmfangräich bioinformatesch AnalyseDëst gëtt Abléck an d'taxonomesch a funktionell Zesummesetzung vu Gemeinschaften, souwéi eng Analyse vun der differentieller Genexpression.
●Ausféierlech Genannotatioun:Benotzung vun aktuellen Genfunktiounsdatenbanken fir informativ Informatiounen iwwer d'Genexpression vu mikrobiellen Gemeinschaften.
●Ënnerstëtzung nom Verkaf:Eis Engagement geet iwwer d'Projetofschloss eraus mat enger 3-Méint After-Sales-Serviceperiod. Wärend dëser Zäit bidden mir Projet-Follow-up, Hëllef bei der Problemléisung a Froestonnen un, fir all Froen am Zesummenhang mat de Resultater ze beäntwerten.
Service Spezifikatiounen
| Sequenzéierungsplattform | Sequenzéierungsstrategie | Recommandéiert Donnéeën | Datenqualitéitskontroll |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | Q30≥85% |
Ufuerderunge fir d'Beispill
| Konzentratioun (ng/µL) | Gesamtbetrag (µg) | Volumen (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Service-Aarbechtsfloss
Proufliwwerung
Bibliothéiksbau
Sequenzéierung
Datenanalyse
After-Sales-Servicer
Enthält déi folgend Analyse:
● Qualitéitskontroll vun de Sequenzéierungsdaten
● Transkriptiounsmontage
● Taxonomesch Annotatioun an Heefegkeet
● Funktionell Annotatioun an Abundanz
● Expressiounsquantifizéierung an Differentialanalyse
Taxonomesch Verdeelung vun all Prouf:
Beta-Diversitéitsanalyse: UPGMA
Funktional Annotatioun – GO-Heefegkeet
Differenziell Taxonomie-Heefegkeet – LEFSE
Entdeckt d'Fortschrëtter, déi duerch d'Meta-Transkriptomik-Sequenzéierungsservicer vu BMKGene duerch eng kuréiert Sammlung vu Publikatiounen erméiglecht ginn.
Lu, Z. et al. (2023) 'Säure Toleranz vu Laktat-benotzende Bakterien vun der Uerdnung Bacteroidales dréit zur Präventioun vun der Pensazidose bei Geessen bäi, déi un eng konzentréiert Ernärung ugepasst sinn',Déierernährung, 14, S. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Entdeckung vun der zentraler funktioneller Mikrobiota an der traditioneller Festkierperfermentatioun duerch High-Throughput-Amplikonen a Metatranscriptomiksequenzéierung',Grenzen an der Mikrobiologie, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
Wang, W. et al. (2022) 'Nei Mykovirussen entdeckt aus enger Metatranscriptomik-Ëmfro vum phytopathogene Alternaria-Pilz',Viren, 14(11), S. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Parallel Metatranskriptomanalyse weist den Ofbau vu sekundäre Planzenmetabolitten duerch Käfer an hir Darmsymbionten',Molekular Ökologie, 31(15), S. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
