Highlights
An dësem zwee Stonne Webinar ass et eis grouss Éier sechs Experten an der Crop Genomics Arena invitéiert ze hunn.Eis Spriecher ginn eng déif Interpretatioun iwwer zwee Rye genomesch Studien, déi viru kuerzem publizéiert goufenNatur Genetik:
1. Chromosom-Skala Genom Assemblée liwwert Abléck an Roggenbiologie, Evolutioun an agronomescht Potenzial
2. Eng qualitativ héichwäerteg Genomversammlung beliicht Roggen genomesch Charakteristiken an agronomesch wichteg Genen
Och si mir frou de Senior R&D Wëssenschaftler vu Biomarker Technologies ze hunn fir seng Erfarung an der de novo Genom Assemblée ze deelen.
Agenda
09:00 Uhr CET
Wëllkomm Remarque
Zheng Hong-kun
Grënner & CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
President, School of Advanced Agricultural Sciences Peking University
09:15 Uhr
Verbessert Roggen, Triticale a Weess Verbesserung duerch d'Benotzung vun héichqualitativen Referenzgenom Sequenz
An dësem Webinar huet de Prof. Gruppen déi an de Wierker féieren a bäidroen.
09:25 Uhr
Cereal Genomics @ IPK Gatersleben
Cereal Gräser vum Triticeae Stamm waren eng wichteg Nahrungsquell an temperéierten Regiounen, déi laang als Hotspot bei der Ernteverbesserung an der Zucht ugesi gouf.Ënnert all kultivéiert Arten ass dëse Stamm berühmt fir hir extrem komplex genomesch Features, dorënner grouss Genomgréissten, héijen Inhalt vun TEs, Polyploidie, etc. An dëser Sessioun huet de Prof. genomic research@IPK Gatersleben.
09:35 Uhr
Chromosom-Skala Genom Assemblée liwwert Abléck an Roggenbiologie, Evolutioun an agronomescht Potenzial
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institut fir Planzgenetik a Crop Plan Research (IPK)Rye (Secale cereale L.) ass eng aussergewéinlech klimatesch elastesch Getreidekultur, déi extensiv benotzt gëtt fir verbesserte Weesszorten duerch introgressiv Hybridiséierung ze produzéieren, an huet de ganze Repertoire vun Genen déi néideg sinn fir Hybridzucht z'erméiglechen.Rye ass allogam an eréischt kierzlech domestizéiert, wat kultivéiert Roggen Zougang zu engem diversen an exploitéierbare Wëllgenpool gëtt.Fir dem Rye säin agronomesche Potenzial weider ze verbesseren, hu mir eng chromosomen-Skala annotéiert Versammlung vum 7.9 Mbp Roggengenom produzéiert an extensiv seng Qualitéit validéiert mat enger Suite vu molekulare genetesche Ressourcen.Mir weisen Uwendungen vun dëser Ressource mat enger breet Palette vun Ermëttlungen.Mir presentéieren Erkenntnisser iwwer kultivéiert Roggen onkomplett genetesch Isolatioun vu wëlle Familljememberen, Mechanismen vun der struktureller Evolutioun vum Genom, Pathogenresistenz, Tieftemperaturtoleranz, Fruchtbarkeetskontrollsystemer fir Hybridzucht, an d'Ausbezuelungsvirdeeler vu Roggen-Weess Introgressiounen.
10:05 Uhr
Eng héichqualitativ Genomversammlung beliicht Roggen genomesch Charakteristiken an agronomesch wichteg Genen
Rye ass eng wäertvoll Nahrung a Fudderkultur, eng wichteg genetesch Ressource fir Weess an Triticale Verbesserung, an en onverzichtbare Material fir effizient vergläichend Genomikstudien a Gräser.Hei hu mir de Genom vum Weining Roggen, eng Elite Chinese Roggen Varietéit, sequenzéiert.Déi versammelt Contigs (7.74 Gb) hunn 98.47% vun der geschätzter Genomgréisst (7.86 Gb) ausgemaach, mat 93.67% vun de Contigs (7.25 Gb) zu siwe Chromosomen zougewisen.Repetitive Elementer hunn 90,31% vum versammelten Genom ausgemaach.Am Verglach mat virdru sequentéierten Triticeae Genomen, hunn Daniela, Sumaya a Sumana Retrotransposonen staark Expansioun am Roggen gewisen.Weider Analyse vun der Weining Assemblée werfen neit Liicht op genombreet Genduplikatioune an hiren Impakt op Stärkebiosynthese Genen, kierperlech Organisatioune vu komplexe Prolamin Loci, Genausdrock Features ënnerierdesch fréie Rubrik Trait, a putativ Domestikatioun-assoziéiert chromosomal Regiounen a Loci am Roggen.Dës Genom Sequenz versprécht d'Genomik a Zuchtstudien vu Roggen a verwandte Getreidekulturen ze beschleunegen.
10:35 Uhr
Erausfuerderungen, Léisungen an Zukunft fir Genome de novo Assemblée
Genom vu héich Qualitéit ass d'Basis vun der genomescher Studie.Och wann déi séier Entwécklung am Sequenzéierung an Algorithmus eng vill méi einfach a méi effizient Genom Assemblée beméit huet, klammen d'Ufuerderungen an der Assemblée Genauegkeet a Vollständegkeet och mat der Verdéifung vu Fuerschungsziler.An dësem Gespréich wäert ech déi aktuell populär Technologien an der Genomversammlung mat e puer erfollegräiche Fäll diskutéieren an e Bléck op déi zukünfteg Entwécklung huelen.
Post Zäit: Jan-08-2022