BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Planz / Déier Ganzen Genom Sequencing

Ganz Genom Re-Sequencing, och bekannt als WGS, erméiglecht d'Entdeckung vu béide gemeinsamen a rare Mutatiounen am ganze Genom abegraff Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), a Copy Number Variation (CNV) ).SVs maachen e méi groussen Deel vun der Variatiounsbasis aus wéi SNPs an hunn e méi groussen Impakt op de Genom, wat e wesentlechen Effekt op lieweg Organismen huet.Laang gelies resequencing erlaabt fir méi präzis Identifikatioun vu grousse Fragmenter a komplizéiert Variatiounen well laang liesen maachen et vill méi einfach ze chromosomal Kräizgang iwwer komplizéiert Regiounen wéi Tandem Wiederholungen, GC / AT-räich Regiounen, an hyper-variable Regiounen.

Plattform: Illumina, PacBio, Nanopore


Service Detailer

Demo Resultat

Featured Publikatioun

1.Service Virdeeler

Extensiv Erfahrung am Genom Sequenzéierung fir iwwer 1000 Arten.

Iwwer 800 publizéiert Fäll mat engem akkumulative Impaktfaktor vun iwwer 4000.

Iwwergräifend Bioinformatik Analyse iwwer Variatiounsopruff a Funktiounsanalyse.

2. Service Spezifikatioune

Plattform

Bibliothéik

Recommandéiert seq Déift

Illumina

PE 150

Fir SNP, InDel Uruff ≥ 10x

Fir SV, CNY Vocatioun ≥ 30x

 

 

Nanopore

 

8 kb vun

Fir SV, CNY Vocatioun ≥ 20x

Pacbio

CCS

15 kb vun

Fir SNP, InDel, SV, CNY Uruff ≥ 10x

3. Prouf Ufuerderunge

Plattform

Konz.(ng/μL)

 

Betrag (ng)

 

Rengheet

 

Agarose Gel

 

OD260/280

OD260/230

1. Kloer Haaptrei Band ouni oder limitéiertDegradatioun op Gel observéiert.

2. Keng oder limitéiert RNA oder Protein Kontaminatioun

 

Illumina

≥1

≥30

 

-

-

Nanopore

 

≥30

Hänkt vun Daten Erléisung of

10 μg/Zell

1.7-2.2

≥1,5

Pacbio

CCS

≥50

1.7-2.2

1,8-2,5

4. Bioinformation Analyse

wps_doc_3

5. Service Work Flow

Echantillon Liwwerung

Echantillon Liwwerung

Pilot Experiment

DNA Extraktioun

Bibliothéik Virbereedung

Bibliothéik Bau

Sequenzéieren

Sequenzéieren

Donnéeën Analyse

Donnéeën Analyse

数据上传-03

Daten Liwwerung


  • virdrun:
  • Nächste:

  • 1) Statistike vun Genome Mapping

    Dësch 1 Statistike vun Mapping Resultat

    wps_doc_5

    Figur 1 Verdeelung vun Insert Gréisst a liest Ofdeckung.

    wps_doc_14 wps_doc_6

     

    2) Variant Detektioun

    Figur 2 Statistiken an Annotatioun vun SNP / INDEL / SV ënnert Echantillon

    wps_doc_7 wps_doc_8

     

    Figur 3 Genom-breet Verdeelung vun vatiations

    wps_doc_9

    3) Funktionell Annotatioun vu Variatiounen

    wps_doc_10 wps_doc_11 wps_doc_12

     

    2019

    Natur Kommunikatiounen

    Ganz-Genom Resequencing enthält Brassica napus Hierkonft a genetesch Loci involvéiert a senger Verbesserung

    2020

    PNAS

    D'evolutionär Hierkonft an Domestikatiounsgeschicht vu Goldfësch (Carassius auratus)

    2021

    Planz Biotechnologie Journal

    Referenzgenome vun den zwou kultivéierte Jute Arten

    2021

    Planz Biotechnologie Journal

    Genomesch Ënnerschrëfte vu Geméis- an Ueleg-allopolyploid Brassicajuncea a genetesch Loci déi d'Akkumulation vu Glucosinolate kontrolléieren

    2019

    Molekulare Planz

    Ganz-Genom Resequencing vun enger weltwäiter Sammlung vu Raps-Bäitrëtter weist d'genetesch Basis vun hirer Ökotyp Divergenz

    2022

    Horticulture Fuerschung

    Genom-breet Associatiounsanalyse bitt molekulare Abléck an déi natierlech Variatioun vun der Waassermeloun Som Gréisst

    2021

    Journal of Experimental Botany

    Genome-breet Associatiounsstudie identifizéiert Varianten vu GhSAD1 déi kal Toleranz a Koteng vermëttelen

    2021

    Journal of Experimental Botany

    Genom-breet Associatiounsstudie an Transkriptomverglach verroden nei QTL a Kandidatgenen déi d'Bléiebliedergréisst bei Raps kontrolléieren

    kréien en Devis

    Schreift Äre Message hei a schéckt en un eis

    Schéckt eis Äre Message: