-
Genome-breet Association Analyse
Genome-breet Associatiounsstudie (GWAS) zielt fir genetesch Varianten (Genotyp) z'identifizéieren, déi mat spezifesche Charaktere (Phenotyp) verbonne sinn.GWAS Studie ënnersicht genetesch Markéierer duerch de ganze Genom vu grousser Zuel vun Individuen a virausgesot Genotyp-Phänotyp Associatiounen duerch statistesch Analyse op Bevëlkerungsniveau.Et gouf wäit an der Fuerschung iwwer mënschlech Krankheeten a funktionnelle Genmining op komplexe Spure vun Déieren oder Planzen applizéiert.
-
Planz / Déier Ganzen Genom Sequencing
Ganz Genom Re-Sequencing, och bekannt als WGS, erméiglecht d'Entdeckung vu béide gemeinsamen a rare Mutatiounen am ganze Genom abegraff Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), a Copy Number Variation (CNV) ).SVs maachen e méi groussen Deel vun der Variatiounsbasis aus wéi SNPs an hunn e méi groussen Impakt op de Genom, wat e wesentlechen Effekt op lieweg Organismen huet.Laang gelies resequencing erlaabt fir méi präzis Identifikatioun vu grousse Fragmenter a komplizéiert Variatiounen well laang liesen maachen et vill méi einfach ze chromosomal Kräizgang iwwer komplizéiert Regiounen wéi Tandem Wiederholungen, GC / AT-räich Regiounen, an hyper-variable Regiounen.
Plattform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Evolutionär Genetik
Evolutiounsgenetik ass e gepackte Sequenzéierungsservice entworf fir eng ëmfaassend Interpretatioun iwwer evolutiver Informatioun vu bestëmmte Materialien op Basis vu genetesche Variatiounen ze bidden, dorënner SNPs, InDels, SVs an CNVs.Et gëtt all fundamental Analyse néideg fir eng beschreiwen evolutive Ännerungen an genetesch Fonctiounen vun Populatiounen, wéi Bevëlkerung Struktur, genetesch Diversitéit, phylogeny Relatiounen, etc.
-
Comparative Genomics
Comparativ Genomik bedeit wuertwiertlech déi komplett Genomsequenzen a Strukture vu verschiddenen Arten ze vergläichen.Dës Disziplin zielt d'Arten Evolutioun, Genfunktioun, Genreguléierungsmechanismus um Genom Niveau z'entdecken andeems d'Sequenzstrukturen an Elementer z'identifizéieren déi iwwer verschidden Arten konservéiert oder differenzéiert sinn.Typesch komparativ Genomikstudie enthält Analysen an der Genfamill, evolutiv Entwécklung, ganz Genom Duplikatioun, selektiven Drock, etc.
-
Hi-C baséiert Genom Assemblée
Hi-C ass eng Method entwéckelt fir Chromosomkonfiguratioun z'erfaassen andeems se proximity-baséiert Interaktiounen an High-Throughput Sequenzen kombinéiert.D'Intensitéit vun dësen Interaktiounen gëtt ugeholl datt se negativ mat der kierperlecher Distanz op Chromosomen korreléiert sinn.Dofir kéinten Hi-C Daten d'Clustering, Uerdnung an Orientéierung vu versammele Sequenzen an engem Entworfsgenom guidéieren an déi op eng gewëssen Zuel vu Chromosomen verankeren.Dës Technologie erméiglecht e Chromosom-Niveau Genomversammlung an der Verontreiung vu Populatiounsbaséierter genetescher Kaart.All eenzel Genom brauch en Hi-C.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform / DNBSEQ
-
Planz / Déier De Novo Genom Sequencing
De NovoSequencing bezitt sech op d'Konstruktioun vum ganze Genom vun enger Spezies mat Sequenzéierungstechnologien, zB PacBio, Nanopore, NGS, etc., a Feele vun engem Referenzgenom.Déi bemierkenswäert Verbesserung vun der Lieslängt vun Drëtt Generatioun Sequenzéierungstechnologien huet nei Méiglechkeete bei der Versammlung vun komplexe Genome bruecht, sou wéi déi mat héijer Heterozygositéit, héije Verhältnis vu repetitive Regiounen, Polyploiden, etc. Opléisung vun repetitive Elementer, Regioune mat anormal GC Inhalter an aner héich komplex Regiounen.
Plattform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Plattform
-
Mënsch Ganzen Exome Sequencing
Ganz Exome Sequencing (WES) gëtt als eng kosteneffektiv Sequenzéierungsstrategie ugesinn fir Krankheet-verursaache Mutatiounen z'identifizéieren.Och wann Exonen nëmmen ongeféier 1,7% vum ganze Genom ophuelen, representéiert et de Profil vun de Gesamtproteinfunktiounen direkt.Am mënschleche Genom ass et gemellt ginn datt méi wéi 85% vu Krankheet-verbonne Mutatiounen an der Proteinkodéierungsregioun optrieden.
BMKGENE bitt ëmfaassend a flexibel mënschlech ganz Exome Sequenzéierungsservicer mat verschiddenen Exon Capture Strategien verfügbar fir verschidde Fuerschungsziler z'erreechen.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
High-Throughput Genotyping, besonnesch op grousser Bevëlkerung, ass e fundamentale Schrëtt an der genetescher Associatiounsstudien, déi genetesch Basis fir funktionell Genentdeckung, evolutiv Analyse, etc. ) gëtt agefouert fir d'Sequenzéierungskäschte pro Probe ze minimiséieren, wärend raisonnabel Effizienz bei der Genetescher Marker Entdeckung erhalen.Dëst gëtt allgemeng erreecht andeems d'Restriktiounsfragment an engem bestëmmte Gréisstberäich extrahéiert gëtt, wat reduzéiert Representatiounsbibliothéik (RRL) genannt gëtt.Spezifesch-Locus amplifizéiert Fragment Sequencing (SLAF-Seq) ass eng selbst entwéckelt Strategie fir SNP Genotyping mat oder ouni Referenzgenom.
Plattform: Illumina NovaSeq Plattform
