Kleng RNA-Sequenzéierung - Illumina
Fonctiounen
● Virbereedung vun der Gréisstenauswielbibliothéik.
● Bioinformatesch Analyse konzentréiert sech op miRNA-Prognose an Ziler.
Virdeeler vum Service
●Grouss ExpertiseMir hunn iwwer 300 Proben veraarbecht, déi verschidden Zorte vu Proben ofdecken. Mir bréngen eis räich Expertise an all Projet.
●Rigoréis QualitéitskontrollMir implementéieren Kärkontrollpunkten an alle Phasen, vun der Proufvirbereedung bis zur Bibliothéiksvirbereedung, der Sequenzéierung an der Bioinformatik. Eis grëndlech Iwwerwaachung garantéiert d'Liwwerung vu konsequent héichqualitative Resultater.
●Ëmfangräich bioinformatesch Analyse:Et erméiglecht d'Identifikatioun vu souwuel bekannte wéi och neie miRNAs, d'Identifikatioun vu miRNA-Ziler, an déi entspriechend funktionell Annotatioun an Beräicherung mat verschiddene Datenbanken (KEGG, GO).
●Ënnerstëtzung nom VerkafMir verstinn, wéi wichteg et ass, präsent ze sinn, dofir geet eist Engagement iwwer d'Projetofschloss eraus, mat engem 3-Méint After-Sales-Service. Wärend dëser Zäit bidden mir Projet-Follow-up, Hëllef bei Troubleshooting a Froestonnen un, fir all Froen am Zesummenhang mat de Resultater ze beäntwerten.
Ufuerderunge fir d'Prouf a Liwwerung
| Bibliothéik | Plattform | Recommandéiert Donnéeën | Daten-QC |
| Gréisst ausgewielt | Illumina SE50 | 10M-20M Liesungen | Q30≥85% |
Ufuerderunge fir d'Beispill:
Nukleotiden:
| Konzentratioun (ng/μl) | Quantitéit (μg) | Rengheet | Integritéit |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limitéiert oder keng Protein- oder DNA-Kontaminatioun um Gel ze gesinn. | RIN≥6.0; 5,0≥28S/18S≥1,0; limitéiert oder keng Basishéicht |
● Planzen:
Wuerzel, Stamm oder Bléieblatt: 450 mg
Blat oder Som: 300 mg
Fruucht: 1,2 g
● Déier:
Häerz oder Darm: 450 mg
Innereien oder Gehir: 240 mg
Muskel: 600 mg
Schanken, Hoer oder Haut: 1,5 g
● Arthropoden:
Insekten: 9g
Krustaceaen: 450 mg
● Vollblutt2 Réier
● Zellen: 106 Zellen
● Serum a Plasma:6 ml
Recommandéiert Proufliwwerung
Behälter: 2 ml Zentrifugeröhrchen (Aluminiumfolie ass net recommandéiert)
Beispillbeschrëftung: Grupp+Widderhuelung z.B. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Liwwerung:
1. Dréchenäis: D'Prouwen mussen a Säck verpackt a mat Dréchenäis verstoppt ginn.
2. RNAstable Réier: RNA-Prouwen kënnen an engem RNA-Stabiliséierungsréier (z.B. RNAstable®) gedréchent a bei Raumtemperatur verschéckt ginn.
Service-Aarbechtsfloss
Experimentdesign
Proufliwwerung
RNA-Extraktioun
Bibliothéiksbau
Sequenzéierung
Datenanalyse
After-Sales-Servicer
Bioinformatik
● Qualitéitskontroll vun de Réidaten
● Klassifikatioun vu klenge RNAen
● miRNA-Expressioun an Differentialexpressiounsanalyse
● miRNA-Zilgen- an differenziell expriméiert miRNA-Zilgen-Annotatioun
● Annotatioun vun Zilgenen an differenziell expriméiert miRNA-Genfunktiounsanreicherung
Identifikatioun vu miRNA: Struktur an Déift
Differenziell Expressioun vu miRNA – hierarchesch Clustering
Funktionell Annotatioun vum Zil vun differentiell expriméierten miRNAs
Entdeckt d'Fuerschungsfortschrëtter, déi vun de sRNA-Sequenzéierungsservicer vu BMKGene duerch eng kuréiert Sammlung vu Publikatiounen erméiglecht ginn.
Chen, H. et al. (2023) 'Virusinfektiounen hemmen d'Saponinbiosynthese an d'Photosynthese am Panax notoginseng',Planzephysiologie a Biochemie, 203, S. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'De Protein FREE1, deen de FYVE-Domän enthält a Planzen, assoziéiert sech mat Mikroprozessorkomponenten, fir d'Biogenese vu miRNA z'ënnerdrécken',EMBO-RapportenEng., 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'D'MicroRNA Ame-Bantam-3p kontrolléiert d'Entwécklung vu Larvenpuppen andeems se de Gen fir verschidde epidermal Wuesstumsfaktor-ähnlech Domainen 8 (megf8) an der Hunnegbei, Apis mellifera, gezielt attackéiert',International Zäitschrëft fir Molekularwëssenschaften, 24(6), S. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Integréiert Analyse vu MiRNA a Genen, déi mat der Fleeschqualitéit assoziéiert sinn, weist datt Gga-MiR-140-5p d'intramuskulär Fettoflagerung bei Hënn beaflosst',Zellulär Physiologie a Biochemie, 46(6), S. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
