-
Voll Längt mRNA Sequencing-Nanopore
RNA Sequencing war e wäertvollt Tool fir eng ëmfaassend Transkriptomanalyse.Zweiwel, traditionell Kuerzliese Sequenzéierung huet vill wichteg Entwécklung hei erreecht.Trotzdem begéint et dacks Aschränkungen a Volllängt Isoform Identifikatiounen, Quantifikatioun, PCR Bias.
Nanopore Sequenzéierung ënnerscheet sech vun anere Sequenzéierungsplattformen, an datt d'Nukleotiden direkt ouni DNA Synthese gelies ginn a laang Liesen op zéng Kilobasen generéieren.Dëst erméiglecht direkt Ausliesen iwwer Volllängt Transkriptiounen an unzegoen d'Erausfuerderungen an Isoform-Niveau Studien.
Plattform:Nanopore PromethION
Bibliothéik:cDNA-PCR
-
De novo Volllängt Transkriptom Sequencing -PacBio
De neienVolllängt Transkriptom Sequenzéierung, och bekannt alsDe neienIso-Seq hëlt d'Virdeeler vum PacBio Sequenzer an der Lieslängt, wat d'Sequenzéierung vu Volllängt cDNA Molekülen ouni Pausen erméiglecht.Dëst vermeit komplett Feeler generéiert an Transkriptversammlungsschrëtt a konstruéiert unigene Sets mat Isoform-Niveau Opléisung.Dës Unigene Sets liwwert mächteg genetesch Informatioun als "Referenzgenom" um Transkriptomniveau.Zousätzlech, kombinéiert mat der nächster Generatioun Sequenzéierungsdaten, erméiglecht dëse Service eng korrekt Quantifikatioun vum Isoform-Niveau Ausdrock.
Plattform: PacBio Sequel IIBibliothéik: SMRT Bell Bibliothéik -
Eukaryotesch mRNA Sequencing-Illumina
mRNA Sequencing erméiglecht d'Profiling vun all mRNAs, déi aus Zellen ënner spezifesche Bedéngungen transkriptéiert sinn.Et ass eng mächteg Technologie fir Genausdrockprofil, Genstrukturen a molekulare Mechanismen vu bestëmmte biologesche Prozesser z'entdecken.Bis haut ass mRNA Sequenzéierung wäit an der fundamentaler Fuerschung, klinescher Diagnostik, Drogenentwécklung, etc.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
-
Net-Referenz baséiert mRNA Sequencing-Illumina
mRNA Sequencing adoptéiert d'nächst Generatioun Sequencing Technik (NGS) fir de Messenger RNA (mRNA) Form Eukaryote an enger spezifescher Period z'erreechen, déi e puer speziell Funktiounen aktivéieren.De längsten Transkript gespléckt gouf 'Unigene' genannt a benotzt als Referenzsequenz fir spéider Analyse, wat en effektiv Mëttel ass fir de molekulare Mechanismus a reglementaresche Netzwierk vun der Spezies ouni Referenz ze studéieren.
No Transkriptom Datenversammlung an unigen funktionell Annotatioun
(1) SNP Analyse, SSR Analyse, CDS Viraussetzung a Genstruktur wäert virgeformt ginn.
(2) Quantifikatioun vun unigenen Ausdrock an all Prouf gëtt duerchgefouert.
(3) Differenziell ausgedréckte Unigenen tëscht Proben (oder Gruppen) ginn entdeckt baséiert op unigen Ausdrock
(4) Clustering, funktionell Annotatioun a Beräicherungsanalyse vun differentiell ausgedréckte Unigenen ginn duerchgefouert
-
Laang Net-coding sequencing-Illumina
Laang net-kodéierend RNAs (lncRNAs) sinn eng Zort RNA-Moleküle mat enger Längt vun iwwer 200 nt, déi duerch extrem niddereg Kodéierungspotenzial charakteriséiert sinn.LncRNA, als Schlësselmember an net-kodéierende RNAs, gëtt haaptsächlech am Kär a Plasma fonnt.D'Entwécklung an der Sequenzéierungstechnologie a Bioinformtik erméiglecht d'Identifikatioun vu ville neien lncRNAs an assoziéiert déi mat biologesche Funktiounen.Akkumulativ Beweiser suggeréieren datt lncRNA wäit an der epigenetescher Reguléierung, Transkriptiounsreguléierung a Post-Transkriptiounsreguléierung involvéiert ass.
-
Kleng RNA Sequencing-Illumina
Kleng RNA bezitt sech op eng Klass vun net-kodéierende RNA-Moleküle déi normalerweis manner wéi 200nt an der Längt sinn, dorënner Mikro-RNA (miRNA), kleng Interferenz-RNA (siRNA), a piwi-interagéierend RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) ass eng Klass vun endogene klenge RNA mat enger Längt vun ongeféier 20-24nt, déi eng Vielfalt vu wichtege reglementaresche Rollen an Zellen spillt.miRNA involvéiert a ville Liewensprozesser déi Tissue - spezifesch a Bühne - spezifesch Ausdrock opdecken an héich konservéiert a verschiddenen Arten.
-
circRNA Sequencing-Illumina
Ganz Transkriptom Sequenzéierung ass entwéckelt fir all Zorte vu RNA Molekülen ze profiléieren, inklusiv coding (mRNA) an net-kodéierend RNAs (inklusiv lncRNA, circRNA a miRNA) déi vu spezifesche Zellen zu enger bestëmmter Zäit transkripéiert ginn.Ganz Transkriptom Sequenzéierung, och bekannt als "total RNA Sequencing" zielt fir iwwergräifend Reguléierungsnetzwierker um Transkriptomniveau z'entdecken.Profitéiert vun der NGS Technologie, Sequenze vu ganzen Transkriptomprodukter si verfügbar fir ceRNA Analyse a gemeinsame RNA Analyse, déi den éischte Schrëtt a Richtung funktionell Charakteriséierung bitt.Offenbarung reglementaresche Reseau vun circRNA-miRNA-mRNA baséiert ceRNA.
-
Ganz Transkriptom Sequenzéierung - Illumina
Ganz Transkriptom Sequenzéierung ass entwéckelt fir all Zorte vu RNA Molekülen ze profiléieren, inklusiv coding (mRNA) an net-kodéierend RNAs (inklusiv lncRNA, circRNA a miRNA) déi vu spezifesche Zellen zu enger bestëmmter Zäit transkripéiert ginn.Ganz Transkriptom Sequenzéierung, och bekannt als "total RNA Sequencing" zielt fir iwwergräifend Reguléierungsnetzwierker um Transkriptomniveau z'entdecken.Profitéiert vun der NGS Technologie, Sequenze vu ganzen Transkriptomprodukter si verfügbar fir ceRNA Analyse a gemeinsame RNA Analyse, déi den éischte Schrëtt a Richtung funktionell Charakteriséierung bitt.Offenbarung reglementaresche Reseau vun circRNA-miRNA-mRNA baséiert ceRNA.
-
Prokaryotesch RNA Sequenzéierung
Prokaryotesch RNA Sequencing benotzt d'nächst Generatioun Sequencing (NGS) fir d'Präsenz an d'Quantitéit vun RNA zu engem bestëmmte Moment z'entdecken, andeems de verännert Zellular Transkriptom analyséiert.Eis Gesellschaft prokaryotesch RNA Sequenzéierung, zielt speziell op Prokaryote mat Referenzgenomen, fir Iech Transkriptomprofiléierung, Genstrukturanalyse, asw.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranskriptom Sequenzéierung
Metatranscriptome sequencing identifizéiere Genausdrock vu Mikroben (souwuel Eukaryoten a Prokaryoten) bannent natierlechen Ëmfeld (dh Buedem, Waasser, Mier, Feeën, an Darm). vun Arten, funktionell Beräicherung Analyse vun anescht ausgedréckt Genen, a méi.
Plattform: Illumina NovaSeq 6000
