Ganz Transkriptom Sequenzéierung - Illumina
Eegeschaften
● Dual Bibliothéik fir de komplette Transkriptom ze sequenzéieren: rRNA Verarmung gefollegt vun PE150 Bibliothéik Virbereedung a Gréisst Auswiel gefollegt vun SE50 Bibliothéik Virbereedung
● Komplett Bioinformatik Analyse vu mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA a getrennten Bioinformatik Berichter
● Gemeinsam Analyse vun all RNS Ausdrock am kombinéiert Rapport, dorënner ceRNA Netzwierker Analyse.
Service Virdeeler
●Déift Analyse vun reglementaresche Netzwierker: ceRNA Netzwierkanalyse gëtt aktivéiert duerch d'gemeinsame Sequenzéierung vu mRNA, lncRNA, circRNA a miRNA an duerch en ustrengenden bioinformatesche Workflow.
●Iwwergräifend Annotatioun: Mir benotze verschidde Datenbanken fir d'Differentially Expressed Genes (DEGs) funktionell annotéieren an déi entspriechend Beräicherungsanalyse auszeféieren, Abléck iwwer déi cellulär a molekulare Prozesser déi d'Transkriptomreaktioun ënnerleien.
●Extensiv Expertise: mat engem Streckrekord fir iwwer 2000 ganz Transkriptomprojeten a verschiddene Fuerschungsberäicher erfollegräich ofzeschléissen, bréngt eis Team e Räichtum un Erfahrung fir all Projet.
●Richteg Qualitéitskontroll: Mir implementéiere Kär Kontrollpunkten iwwer all Stadien, vu Probe a Bibliothéikpräparatioun bis Sequenzéierung a Bioinformatik.Dës virsiichteg Iwwerwaachung garantéiert d'Liwwerung vu konsequent qualitativ héichwäerteg Resultater.
● Iwwergräifend Annotatioun: Mir benotze verschidde Datenbanken fir d'Differentially Expressed Genes (DEGs) funktionell annotéieren an déi entspriechend Beräicherungsanalyse auszeféieren, Abléck iwwer déi cellulär a molekulare Prozesser déi d'Transkriptomreaktioun ënnerleien.
●Post-Verkaf Ënnerstëtzung: Eist Engagement erstreckt sech iwwer d'Réalisatioun vum Projet mat enger 3-Mount After-Sale Service Period.Wärend dëser Zäit bidde mir de Projet Suivi, Troubleshooting Hëllef, a Q&A Sessiounen fir all Ufroen am Zesummenhang mat de Resultater unzegoen
Prouf Ufuerderunge a Liwwerung
| Bibliothéik | Sequenzéierungsstrategie | Daten recommandéiert | Qualitéitskontroll |
| rRNA ofgeschaaft | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Gréisst ausgewielt | Illumina SE50 | 10-20M liesen |
Sample Ufuerderunge:
Nukleotiden:
| Konzentratioun (ng/μl) | Betrag (μg) | Rengheet | Integritéit |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limitéiert oder keng Protein oder DNA Kontaminatioun op Gel gewisen. | Planzen: RIN≥6,5 Déier: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; limitéiert oder keng Basislinn Héicht |
Recommandéiert Sample Liwwerung
Container:
2 ml Zentrifugerröhr (Zinnfolie ass net recommandéiert)
Probe Etikettéierung: Grupp + replizéieren zB A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Sendung:
1.Dry-Äis: Echantillon mussen an Poschen gepackt ginn an an dréchen-Äis begruewe ginn.
2.RNAstable Réier: RNA Echantillon kënnen an RNA Stabiliséierungsröhre gedréchent ginn (zB RNAstable®) a bei Raumtemperatur verschéckt ginn.
Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
RNA Extraktioun
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
Bioinformatik
RNA Ausdrock Iwwersiicht
Differenziell ausgedréckt Genen
ceRNA Analyse
Differenziell ausgedréckt miRNAs a verbonne RNAs
Entdeckt d'Fuerschungsfortschrëtter erliichtert vum BMKGene 'ganz Transkriptom Sequenzéierungsservicer duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen.
Dai, Y. et al.(2022) 'Comprehensive Expression Profile of mRNAs, lncRNAs and miRNAs in Kashin-Beck disease identified by RNA-sequencing', Molecular Omics, 18(2), S. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. Nan et al.(2022) 'Voll Längt Transkriptomen Analyse vun der Kältebeständegkeet vum Apis cerana am Changbai Mountain während der Iwwerwinterperiod.', Gene, 830, S. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Multi-Omics Integratioun-Baséiert Prioritéit vun Konkurrenz Endogenous RNA Reguléierungsnetzwierker an kleng Zell Lung Cancer: Molekulare Charakteristiken an Drogenofhängeger Kandidaten', Grenzen an Onkologie, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) "Integréiert Analyse vun den lncRNA / circRNA-miRNA-mRNA Ausdrock Profiler verréid nei Abléck an potenziell Mechanismen als Äntwert op Root-Knuet Nematoden an Erdnuss", BMC Genomics, 23(1), S. 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGUER/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Whole-Transcriptome RNA Sequencing beliicht déi molekulare Mechanismen verbonne mat der Ënnerhalt vun der Postharvest Qualitéit a Broccoli duerch rout LED Bestralung', Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
