●ການບໍລິການຮຽກຮ້ອງໃຫ້ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອ, ແທນທີ່ຈະສະກັດອາຊິດແກນ, ເພື່ອຮັກສາການຕິດຕໍ່ Protectic-protectin.
●ວິທີການ Atac ປະກອບມີການແບ່ງແຍກເນື້ອເຍື່ອ, ຕາມດ້ວຍ Nuclei Isolation, TN5 ການຮັກສາແລະຄວາມຊໍານິຊໍານານ, ການເລືອກຂອງ PCR, ການຄັດເລືອກຂະຫນາດແລະລໍາດັບຂະຫນາດ.
●ການຕັ້ງແຖວໃນ Illumina Novaseq
●ຄວາມອ່ອນໄຫວສູງ:ປະລິມານຂອງຈຸລັງເລີ່ມຕົ້ນຕໍ່າແມ່ນພຽງພໍສໍາລັບການກະກຽມແລະການສືບສວນຂອງຫໍສະມຸດ.
●ເຕັກນິກທີ່ມີຂໍ້ມູນສູງ: ພ້ອມກັນເປີດເຜີຍສະຖານທີ່ Genomic ຂອງ Open Chromatin ແລະ Elements ທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວເຊັ່ນ: ສະຖານທີ່ຜູກມັດຕົວແປ.
●ການສືບພັນທີ່ດີໃນການທົດລອງ: ການເຮັດຊ້ໍາແບບວິຊາສະເພາະສະແດງໃຫ້ເຫັນຄືນທີ່ດີເລີດ.
●ຄວາມຊ່ຽວຊານຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ກັບໂຄງການທີ່ມີຄວາມສໍາເລັດຫຼາຍຮ້ອຍຂອງ ATAC, ປະສົບການໃນທົດສະວັດ, ທີມງານວິເຄາະທີ່ມີຄວາມຊໍານິຊໍານານ, ແລະການສະຫນັບສະຫນູນດ້ານຫຼັງທີ່ສົມບູນແບບ.
●ຄວາມເປັນໄປໄດ້ທີ່ຈະເຂົ້າຮ່ວມກັບການວິເຄາະທາງດ້ານການວິເຄາະ: ອະນຸຍາດໃຫ້ມີການວິເຄາະແບບປະສົມປະສານຂອງ ATAC SEQ ກັບຂໍ້ມູນອື່ນໆຂອງ omics ເຊັ່ນ RNA-SEq.
●ການວິເຄາະດ້ານຊີວະປະຫວັດທີ່ສົມບູນແບບ: ເປີດໃຊ້ງານບໍ່ພຽງແຕ່ການກໍານົດພາກພື້ນຂອງ Chromatin ແລະການຈັດງານທີ່ກົງກັນ, ການວິເຄາະ) ແຕ່ຍັງການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງລະຫວ່າງບັນດາພາກສ່ວນເປີດ chromatin ໃນບັນດາຕົວຢ່າງ.
ຫໍສະຫມຸດ | ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ | ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນທີ່ແນະນໍາ | ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ |
ATAC-SEQ | Illumina PE150 | > 20m ອ່ານ ອີງຕາມຂະຫນາດ gome (ມະນຸດ: 50 m ອ່ານ) | ent30≥85% |
ປະເພດຕົວຢ່າງ: ແພຈຸລັງ, ຈຸລັງທີ່ມີຊີວິດຫລືແຊ່ແຂງ, ເລືອດ
●ເລກເຊນເມັດ: ≥ 106ຈຸລັງ
●ນ້ໍາຫນັກຂອງເນື້ອເຍື່ອ: ≥ເນື້ອເຍື່ອສົດ 200mg
●ເລືອດ: ≥ 4 ມລ
ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
●ຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນດິບ;
● PEAK ໂທຫາໂດຍອີງໃສ່ແຜນທີ່ເພື່ອອ້າງອີງ genome;
● Gene Avalotation ໃນສະຖານທີ່ສູງສຸດ;
●ການວິເຄາະ Motif: ການກໍານົດສະຖານທີ່ສົ່ງຂໍ້ມູນການໂອນຍ້າຍ (TFBs);
●ການວິເຄາະສູງສຸດທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະເປັນຄໍາບັນຍາຍ.
1.heatmap ກ່ຽວກັບ ATAC ອ່ານການແຈກຢາຍຢູ່ TSS ແລະບໍລິເວນທີ່ຢູ່ຕິດກັນ (± 3 kb)
2. ເພີ່ມສະຖິຕິຂອງພາກພື້ນ chromatin ເປີດໃນສ່ວນປະກອບທີ່ແຕກຕ່າງກັນ
3. ການໂທຫາລະຫວ່າງກຸ່ມ
ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າໃນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການການບໍລິການຂອງ ATAC ຂອງ BMKGene ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການເກັບກ່ຽວ.
Fu, A.et al.(2023) 'ການປະຊຸມພູມລະວັງ (Momordica Charantia L. VAR. Abbreviata SE.)ການຄົ້ນຄວ້າສວນດອກໄມ້ສວນ, 10 (1). DOI: 10.1093 / hr / uhac228.
GONG, B.et al.(2023) 'ການກະຕຸ້ນທາງດ້ານວິຊາການແລະການໂອນຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບຄວາມຄິດປານເດືອນທີ່ລຶກລັບ Kinase Asterc ເປັນ iscogenene ໃນ glioma',ວາລະສານຂອງພັນທຸກໍາແລະ Genomics, 50 (6), PP. 422-433. DOI: 10.1016 / j.jgg.2023.01.008.008.
ລາວ, Y.et al.(2023)ຊີວະສາດ RedoX, 65, p. 102822. DOI: 10.1016 / J.Redox.2023.1028222.