条形ປ້າຍໂຄສະນາ - 03

ຜະລິດຕະພັນ

assay ສໍາລັບ chromatin ທີ່ສາມາດເຂົ້າເຖິງໄດ້ດ້ວຍການປະຕິບັດຄວາມສູງ (ATAC-SEQ)

ATAC-SEQ ແມ່ນເຕັກນິກການເລື່ອນພາບທີ່ຖືກນໍາໃຊ້ໃນການກວດສອບ goodom ທີ່ໃຊ້ສໍາລັບການວິເຄາະການເຂົ້າເຖິງ good. ມັນໃຊ້ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈເລິກເຊິ່ງກ່ຽວກັບກົນລະຍຸດສະລັບສັບຊ້ອນຂອງການຄວບຄຸມໂລກຂອງໂລກໃນທົ່ວເຊື້ອສາຍ. ວິທີການດັ່ງກ່າວໃຊ້ TNPPOSASE TN5 ທີ່ມີຄວາມລະອຽດອ່ອນນຸ້ມແລະແທັກເປີດ chromatin ພ້ອມໆກັນໂດຍການໃສ່ເຄື່ອງດັດສະນີ. ຕໍ່ມາ PCR ຂະຫຍາຍດ້ວຍຜົນໄດ້ຮັບໃນການສ້າງຫໍສະມຸດຢຸດ, ເຊິ່ງອະນຸຍາດໃຫ້ສໍາລັບການກໍານົດພາກພື້ນ chromatin ທີ່ກ້ວາງຂວາງພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂສະເພາະເວລາສະເພາະ. ATAC-seq ສະຫນອງທັດສະນະຂອງພູມສັນຖານທີ່ສາມາດເຂົ້າເຖິງໄດ້ງ່າຍ, ບໍ່ຄືກັນກັບວິທີການທີ່ສຸມໃສ່ສະຖານທີ່ທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວໂດຍສະເພາະຫຼືເຂດທີ່ມີການປ່ຽນແປງໂດຍສະເພາະ. ໂດຍອີງຕາມເຂດທີ່ເປີດກວ້າງຂອງ ATAC-SEQ ສະແດງໃຫ້ເຫັນເຖິງສະຖານທີ່ທີ່ມີຜົນກະທົບທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວແລະມີຄວາມເຂົ້າໃຈທີ່ມີຄ່າໃນການແກ້ໄຂແບບເຄື່ອນໄຫວໃນ Gen.


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະພາບ

ຜົນໄດ້ຮັບສາທິດ

ສິ່ງພິມທີ່ໂດດເດັ່ນ

ຄຸນນະສົມບັດການບໍລິການ

●ການບໍລິການຮຽກຮ້ອງໃຫ້ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອ, ແທນທີ່ຈະສະກັດອາຊິດແກນ, ເພື່ອຮັກສາການຕິດຕໍ່ Protectic-protectin.

●ວິທີການ Atac ປະກອບມີການແບ່ງແຍກເນື້ອເຍື່ອ, ຕາມດ້ວຍ Nuclei Isolation, TN5 ການຮັກສາແລະຄວາມຊໍານິຊໍານານ, ການເລືອກຂອງ PCR, ການຄັດເລືອກຂະຫນາດແລະລໍາດັບຂະຫນາດ.

●ການຕັ້ງແຖວໃນ Illumina Novaseq

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

ຄວາມອ່ອນໄຫວສູງ:ປະລິມານຂອງຈຸລັງເລີ່ມຕົ້ນຕໍ່າແມ່ນພຽງພໍສໍາລັບການກະກຽມແລະການສືບສວນຂອງຫໍສະມຸດ.

ເຕັກນິກທີ່ມີຂໍ້ມູນສູງ: ພ້ອມກັນເປີດເຜີຍສະຖານທີ່ Genomic ຂອງ Open Chromatin ແລະ Elements ທີ່ມີການເຄື່ອນໄຫວເຊັ່ນ: ສະຖານທີ່ຜູກມັດຕົວແປ.

ການສືບພັນທີ່ດີໃນການທົດລອງ: ການເຮັດຊ້ໍາແບບວິຊາສະເພາະສະແດງໃຫ້ເຫັນຄືນທີ່ດີເລີດ. 

ຄວາມຊ່ຽວຊານຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ກັບໂຄງການທີ່ມີຄວາມສໍາເລັດຫຼາຍຮ້ອຍຂອງ ATAC, ປະສົບການໃນທົດສະວັດ, ທີມງານວິເຄາະທີ່ມີຄວາມຊໍານິຊໍານານ, ແລະການສະຫນັບສະຫນູນດ້ານຫຼັງທີ່ສົມບູນແບບ.

ຄວາມເປັນໄປໄດ້ທີ່ຈະເຂົ້າຮ່ວມກັບການວິເຄາະທາງດ້ານການວິເຄາະ: ອະນຸຍາດໃຫ້ມີການວິເຄາະແບບປະສົມປະສານຂອງ ATAC SEQ ກັບຂໍ້ມູນອື່ນໆຂອງ omics ເຊັ່ນ RNA-SEq.

●ການວິເຄາະດ້ານຊີວະປະຫວັດທີ່ສົມບູນແບບ: ເປີດໃຊ້ງານບໍ່ພຽງແຕ່ການກໍານົດພາກພື້ນຂອງ Chromatin ແລະການຈັດງານທີ່ກົງກັນ, ການວິເຄາະ) ແຕ່ຍັງການວິເຄາະຄວາມແຕກຕ່າງລະຫວ່າງບັນດາພາກສ່ວນເປີດ chromatin ໃນບັນດາຕົວຢ່າງ.

ຂໍ້ສະເພາະຂອງການບໍລິການ

ຫໍສະຫມຸດ

ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ

ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນທີ່ແນະນໍາ

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ

ATAC-SEQ

Illumina PE150

> 20m ອ່ານ

ອີງຕາມຂະຫນາດ gome (ມະນຸດ: 50 m ອ່ານ)

ent30≥85%

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ

ປະເພດຕົວຢ່າງ: ແພຈຸລັງ, ຈຸລັງທີ່ມີຊີວິດຫລືແຊ່ແຂງ, ເລືອດ

●ເລກເຊນເມັດ: ≥ 106ຈຸລັງ

●ນ້ໍາຫນັກຂອງເນື້ອເຍື່ອ: ≥ເນື້ອເຍື່ອສົດ 200mg

●ເລືອດ: ≥ 4 ມລ

ກະແສການເຮັດວຽກບໍລິການ

ຕົວຢ່າງ QC

ການທົດລອງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການທົດລອງທົດລອງ

ການສະກັດເອົາ DNA

ການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ

ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ

ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ

ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ຫຼັງຈາກການບໍລິການຂາຍ

ບໍລິການຫລັງການຂາຍ


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • 表观 -02

    ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:

    ●ຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນດິບ;

    ● PEAK ໂທຫາໂດຍອີງໃສ່ແຜນທີ່ເພື່ອອ້າງອີງ genome;

    ● Gene Avalotation ໃນສະຖານທີ່ສູງສຸດ;

    ●ການວິເຄາະ Motif: ການກໍານົດສະຖານທີ່ສົ່ງຂໍ້ມູນການໂອນຍ້າຍ (TFBs);

    ●ການວິເຄາະສູງສຸດທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະເປັນຄໍາບັນຍາຍ.

    1.heatmap ກ່ຽວກັບ ATAC ອ່ານການແຈກຢາຍຢູ່ TSS ແລະບໍລິເວນທີ່ຢູ່ຕິດກັນ (± 3 kb)

     

    3 (1)2. ເພີ່ມສະຖິຕິຂອງພາກພື້ນ chromatin ເປີດໃນສ່ວນປະກອບທີ່ແຕກຕ່າງກັນ

     

    4 (1)

    3. ການໂທຫາລະຫວ່າງກຸ່ມ

     

    5 (1)

    ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າໃນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການການບໍລິການຂອງ ATAC ຂອງ BMKGene ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການເກັບກ່ຽວ.

     

    Fu, A.et al.(2023) 'ການປະຊຸມພູມລະວັງ (Momordica Charantia L. VAR. Abbreviata SE.)ການຄົ້ນຄວ້າສວນດອກໄມ້ສວນ, 10 (1). DOI: 10.1093 / hr / uhac228.

    GONG, B.et al.(2023) 'ການກະຕຸ້ນທາງດ້ານວິຊາການແລະການໂອນຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບຄວາມຄິດປານເດືອນທີ່ລຶກລັບ Kinase Asterc ເປັນ iscogenene ໃນ glioma',ວາລະສານຂອງພັນທຸກໍາແລະ Genomics, 50 (6), PP. 422-433. DOI: 10.1016 / j.jgg.2023.01.008.008.

    ລາວ, Y.et al.(2023)ຊີວະສາດ RedoX, 65, p. 102822. DOI: 10.1016 / J.Redox.2023.1028222.

     

    ໄດ້ຮັບໃບສະເຫນີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານຢູ່ທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານໄປໃຫ້ພວກເຮົາ: