●ເວທີ:Illumina NovaSeq 6000 ແລະ NovaSeq X Plus
●ຮູບແບບການຈັດລໍາດັບ:PE150 ແລະ PE250
●ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດກ່ອນທີ່ຈະຈັດລໍາດັບ
●ການຈັດລຽງຂໍ້ມູນ QC ແລະການຈັດສົ່ງ:ການຈັດສົ່ງບົດລາຍງານ QC ແລະຂໍ້ມູນດິບໃນຮູບແບບ fastq ຫຼັງຈາກ demultiplexing ແລະການກັ່ນຕອງ Q30 ອ່ານ
●Versatility ຂອງການບໍລິການ Sequencing:ລູກຄ້າອາດຈະເລືອກທີ່ຈະຈັດລໍາດັບໂດຍເສັ້ນທາງ, flow cell, ຫຼືໂດຍຈໍານວນຂອງຂໍ້ມູນທີ່ຕ້ອງການ (ການຈັດລໍາດັບເສັ້ນບາງສ່ວນ).
●ປະສົບການຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນເວທີການຈັດລໍາດັບ Illumina:ກັບຫລາຍພັນໂຄງການປິດທີ່ມີຊະນິດຕ່າງໆ.
●ການຈັດສົ່ງບົດລາຍງານ QC ລໍາດັບ:ມີ metrics ຄຸນະພາບ, ຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງຂໍ້ມູນແລະການປະຕິບັດໂດຍລວມຂອງໂຄງການລໍາດັບ.
●ຂະບວນການຈັດລໍາດັບຜູ້ໃຫຍ່:ດ້ວຍເວລາທີ່ສັ້ນ.
●ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຢ່າງເຂັ້ມງວດ: ພວກເຮົາປະຕິບັດຄວາມຕ້ອງການ QC ທີ່ເຄັ່ງຄັດເພື່ອຮັບປະກັນການຈັດສົ່ງຜົນໄດ້ຮັບທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ.
ເວທີ | Flow Cell | ຮູບແບບການຈັດລໍາດັບ | ໜ່ວຍ | ຄາດຄະເນຜົນຜະລິດ |
NovaSeq X | 10B (8 ເລນ) | PE150 | ເສັ້ນທາງດຽວ ເລນບາງສ່ວນ | 375Gb/ເລນ |
25B (8 ເລນ) | PE150 | ເສັ້ນທາງດຽວ ເລນບາງສ່ວນ | 1000 Gb/ເລນ | |
NovaSeq 6000 | SP Flow cell (2 ເລນ) | PE250 | Flow Cell ເສັ້ນທາງດຽວ ເລນບາງສ່ວນ | 325-400 M reads/ລ້ານຊ້າງ |
S4 Flow cell (4 ເລນ) | PE150 | Flow Cell ເສັ້ນທາງດຽວ ເລນບາງສ່ວນ | ~800 Gb / ເລນ |
ຈຳນວນຂໍ້ມູນ (X) | ຄວາມເຂັ້ມຂຸ້ນ (qPCR/nM) | ປະລິມານ | |
ການຈັດລຳດັບເສັ້ນທາງບາງສ່ວນ
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 ມລ |
10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 ມລ | |
50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 ມລ | |
X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 ມລ | |
ການຈັດລໍາດັບເສັ້ນທາງ | ຕໍ່ລ້ານຊ້າງ | ≥ 1.5 nM / ສະນຸກເກີຫ້ອງສະຫມຸດ | ≥ 25 μl / ສະນຸກເກີຫ້ອງສະຫມຸດ |
ນອກເຫນືອໄປຈາກຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນແລະຈໍານວນທັງຫມົດ, ຮູບແບບສູງສຸດທີ່ເຫມາະສົມແມ່ນຍັງຕ້ອງການ.
ໝາຍເຫດ: ການຈັດຮຽງລຳດັບຂອງຫ້ອງສະໝຸດທີ່ມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍຕໍ່າຕ້ອງການ PhiX spike-in ເພື່ອຮັບປະກັນການເອີ້ນຖານທີ່ແຂງແຮງ.
ພວກເຮົາແນະນຳໃຫ້ສົ່ງຫ້ອງສະໝຸດກ່ອນລວມເປັນຕົວຢ່າງ. ຖ້າທ່ານຕ້ອງການ BMKGENE ເພື່ອປະຕິບັດການລວມຫ້ອງສະຫມຸດ, ກະລຸນາເບິ່ງ
ຂໍ້ກໍານົດຫ້ອງສະຫມຸດສໍາລັບການລໍາດັບເສັ້ນທາງບາງສ່ວນ.
ສູງສຸດຕົ້ນຕໍຄວນຈະຢູ່ພາຍໃນ 300-450 bp.
ຫໍສະໝຸດຄວນມີຈຸດສູງສຸດອັນດຽວ, ບໍ່ມີການປົນເປື້ອນຂອງອະແດບເຕີ ແລະບໍ່ມີ primer dimers.
ບົດລາຍງານກ່ຽວກັບຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດແມ່ນສະຫນອງໃຫ້ກ່ອນທີ່ຈະຈັດລໍາດັບ, ການປະເມີນຈໍານວນຫ້ອງສະຫມຸດ, ແລະການແບ່ງແຍກ.
ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິກ່ຽວກັບຂໍ້ມູນລໍາດັບ.
ID ຕົວຢ່າງ | BMKID | ອ່ານດິບ | ຂໍ້ມູນດິບ (bp) | ການອ່ານທີ່ສະອາດ (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
ຮູບ 1. ການແຈກຢາຍຄຸນນະພາບຕາມການອ່ານໃນແຕ່ລະຕົວຢ່າງ
ຮູບທີ 2. ການແຈກຢາຍເນື້ອຫາພື້ນຖານ
ຮູບ 3. ການແຜ່ກະຈາຍຂອງເນື້ອໃນທີ່ອ່ານຢູ່ໃນລໍາດັບຂໍ້ມູນ