-
Chromatin Immunoprecipitation Sequncing (ChIP-seq)
Chip-Seq ສະຫນອງການຂະຫຍາຍພັນທຸກໍາຂອງເປົ້າຫມາຍ DNA ສໍາລັບການດັດແກ້ histone, ປັດໃຈການຖອດຂໍ້ຄວາມ, ແລະໂປຣຕີນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ DNA ອື່ນໆ.ມັນປະສົມປະສານການຄັດເລືອກຂອງ chromatin immuno-precipitation (ChIP) ເພື່ອຟື້ນຕົວສະລັບສັບຊ້ອນທາດໂປຼຕີນ - DNA ສະເພາະ, ດ້ວຍພະລັງງານຂອງລໍາດັບການຜະລິດຕໍ່ໄປ (NGS) ສໍາລັບລໍາດັບສູງໂດຍຜ່ານ DNA ທີ່ຟື້ນຕົວຄືນມາ.ນອກຈາກນັ້ນ, ເນື່ອງຈາກວ່າສະລັບສັບຊ້ອນຂອງທາດໂປຼຕີນ - DNA ໄດ້ຖືກຟື້ນຕົວຈາກຈຸລັງທີ່ມີຊີວິດ, ສະຖານທີ່ຜູກມັດສາມາດຖືກປຽບທຽບຢູ່ໃນປະເພດແລະຈຸລັງທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ຫຼືພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂທີ່ແຕກຕ່າງກັນ.ຄໍາຮ້ອງສະຫມັກມີຕັ້ງແຕ່ກົດລະບຽບການຖ່າຍທອດໄປສູ່ເສັ້ນທາງການພັດທະນາໄປສູ່ກົນໄກຂອງພະຍາດແລະອື່ນໆ.
ເວທີ: Illumina NovaSeq 6000
-
ການຈັດລໍາດັບ genome bisulfite ທັງໝົດ
DNA methylation ຢູ່ໃນຕໍາແຫນ່ງທີຫ້າໃນ cytosine (5-mC) ມີອິດທິພົນພື້ນຖານຕໍ່ການສະແດງອອກຂອງ gene ແລະກິດຈະກໍາຂອງເຊນ.ຮູບແບບ methylation ຜິດປົກກະຕິແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບເງື່ອນໄຂແລະພະຍາດຕ່າງໆ, ເຊັ່ນ: ມະເຮັງ.WGBS ໄດ້ກາຍເປັນມາດຕະຖານຄໍາສໍາລັບການສຶກສາ methylation ກວ້າງ genome ໃນຄວາມລະອຽດຖານດຽວ.
ເວທີ: Illumina NovaSeq6000
-
ການວິເຄາະສໍາລັບ Transposase-Accessible Chromatin ດ້ວຍລໍາດັບການສົ່ງຜ່ານສູງ (ATAC-seq)
ATAC-seq ແມ່ນວິທີການຈັດລໍາດັບທີ່ມີຄວາມລະອຽດສູງສໍາລັບການວິເຄາະການເຂົ້າເຖິງ chromatin ກວ້າງຂອງ genome, ເຊິ່ງເປັນສິ່ງສໍາຄັນສໍາລັບການຄວບຄຸມການສະແດງອອກຂອງ genetic epigenetic ທົ່ວໂລກ.ອະແດບເຕີການຈັດລໍາດັບຖືກໃສ່ເຂົ້າໄປໃນພາກພື້ນ chromatin ເປີດໂດຍ hyperactive Tn5 transposase.ຫຼັງຈາກການຂະຫຍາຍ PCR, ຫ້ອງສະຫມຸດຕາມລໍາດັບແມ່ນການກໍ່ສ້າງ.ພາກພື້ນ chromatin ທັງຫມົດທີ່ເປີດສາມາດໄດ້ຮັບພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂທີ່ໃຊ້ເວລາພື້ນທີ່ສະເພາະ, ບໍ່ພຽງແຕ່ຈໍາກັດສະຖານທີ່ຜູກມັດຂອງປັດໄຈການຖອດຂໍ້ຄວາມ, ຫຼືພາກພື້ນທີ່ແກ້ໄຂ histone ທີ່ແນ່ນອນ.
-
ການຫຼຸດຜ່ອນການເປັນຕົວແທນ Bisulfite Sequencing (RRBS)
ການຄົ້ນຄວ້າກ່ຽວກັບ DNA methylation ເຄີຍເປັນຫົວຂໍ້ຮ້ອນໃນການຄົ້ນຄວ້າພະຍາດ, ແລະມີຄວາມກ່ຽວຂ້ອງຢ່າງໃກ້ຊິດກັບການສະແດງອອກຂອງ gene ແລະລັກສະນະ pheno-typic.RRBS ແມ່ນວິທີການທີ່ຖືກຕ້ອງ, ມີປະສິດທິພາບແລະປະຫຍັດສໍາລັບການຄົ້ນຄວ້າ DNA methylation.ການເສີມສ້າງພູມສັນຖານຂອງໂປໂມຊັ່ນແລະ CpG ເກາະໂດຍການ cleavage enzymatic (Msp I), ສົມທົບກັບລໍາດັບ Bisulfite, ສະຫນອງການແກ້ໄຂ DNA methylation ສູງ.
ເວທີ: Illumina NovaSeq 6000
