ພັນທຸກໍາວິວັດທະນາການ
ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ
takagi et al.,ວາລະສານຕົ້ນໄມ້, 2013
●ການວິເຄາະດ້ານຊີວະພາບທີ່ສົມບູນແບບ:ເປີດໃຊ້ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຈາກຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງພັນທຸກໍາ, ເຊິ່ງສະທ້ອນໃຫ້ເຫັນເຖິງຄວາມສາມາດໃນການວັດຖຸວິວັດທະນາການ, ແລະການເປີດເຜີຍຄວາມສໍາພັນ phylogenetic ທີ່ຫນ້າເຊື່ອຖືລະຫວ່າງຊະນິດຂອງການວິວັດທະນາການ conventized ແລະວິວັດທະນາການຂະຫນານ
●ການວິເຄາະທີ່ກໍາຫນົດເອງ: ເຊັ່ນວ່າການຄາດຄະເນເວລາທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະຄວາມໄວໂດຍອີງໃສ່ການປ່ຽນແປງທີ່ Nucleotide ແລະ Amino Acids ໃນລະດັບ.
●ບັນທຶກການອະນຸມັດແລະການພິມເຜີຍແຜ່ຢ່າງກວ້າງຂວາງ: Bmkgene ໄດ້ສະສົມປະສົບການອັນໃຫຍ່ຫຼວງໃນໂຄງການພັນທຸກໍາແລະຫຼາຍກວ່າຊະນິດໃນການສື່ສານ, ພືດໂມເລກຸນ, ແລະອື່ນໆ.
●ທີມງານຊີວະວິເຄາະທີ່ມີຄວາມຊໍານິຊໍານານແລະມີຄວາມຊໍານານ: ດ້ວຍປະສົບການທີ່ດີໃນການວິເຄາະ Genomics ແບບພິເສດ, ທີມງານ BMKGENE ໄດ້ໃຫ້ການວິເຄາະຄົບວົງຈອນກັບເວລາຫັນປ່ຽນຢ່າງໄວວາ.
●ສະຫນັບສະຫນູນຫລັງການຂາຍ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍເກີນໄປທີ່ໂຄງການສໍາເລັດດ້ວຍໄລຍະການບໍລິການຫລັງການຂາຍໃນເວລາ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການແກ້ໄຂບັນຫາ, ການຊ່ວຍເຫຼືອ, ແລະ Q & A Sessions ເພື່ອແກ້ໄຂການສອບຖາມທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.
ຂໍ້ມູນສະເພາະດ້ານການບໍລິການແລະຂໍ້ກໍານົດ
| ປະເພດຂອງລໍາດັບ | ຂະຫນາດປະຊາກອນທີ່ແນະນໍາ | ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ | ຄວາມຕ້ອງການຂອງ Nucleotide |
| ການລຽງລໍາດັບ genome ທັງຫມົດ | ≥ 30 ບຸກຄົນ, ມີ≥ 10 ບຸກຄົນຈາກແຕ່ລະກຸ່ມຍ່ອຍ
| 10X | ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ: ≥ 1 NG / μL ຈໍານວນເງິນຈໍານວນທັງຫມົດ ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ |
| ຊິ້ນສ່ວນຂອງສະເພາະເຈາະຈົງ (ສະເພາະຂອງ slecified (slaf) | ຄວາມເລິກຂອງ Tag: 10X ຈໍານວນ tags: <400 MB: WGS ແນະນໍາ <1GB: Tags 100GB 1GB > 2GB: ປ້າຍ 300K ແທັກ MAX 500K | ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ≥ 5 ng / μL ຈໍານວນທັງຫມົດ≥ 80 ng nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5 Agrosose Gel: ບໍ່ມີການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນຈໍາກັດ
|
ກະແສການເຮັດວຽກບໍລິການ
ການທົດລອງ
ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ
ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ
ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ
ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ
ບໍລິການຫລັງການຂາຍ
ການບໍລິການປະກອບມີການວິເຄາະຂອງໂຄງສ້າງປະຊາກອນ (PCA, ຕາຕະລາງການແບ່ງແຍກປະຊາກອນ, ແລະປະຊາກອນ ການບໍລິການຍັງສາມາດລວມເອົາການວິເຄາະທີ່ຕ້ອງການ (ຕົວຢ່າງເວລາທີ່ແຕກຕ່າງກັນ, ເຊື້ອສາຍ).
*ຜົນໄດ້ຮັບສາທິດສະແດງຢູ່ທີ່ນີ້ແມ່ນທັງຫມົດຈາກ Genomee ທີ່ເຜີຍແຜ່ກັບ BMKGENE
ການວິເຄາະ 1.Evolution ປະກອບດ້ວຍຕົ້ນໄມ້ phylogenetic, ໂຄງສ້າງປະຊາກອນແລະ PCA ໂດຍອີງໃສ່ການປ່ຽນແປງທາງພັນທຸກໍາ.
ຕົ້ນໄມ້ Phylogenetic ເປັນຕົວແທນຂອງພາສີແລະການພົວພັນວິວັດທະນາການໃນບັນດາຊະນິດພັນກັບບັນພະບຸລຸດທົ່ວໄປ.
PCA ມີຈຸດປະສົງເພື່ອເບິ່ງເຫັນຄວາມໃກ້ຊິດລະຫວ່າງປະຊາກອນຍ່ອຍ.
ໂຄງສ້າງປະຊາກອນສະແດງໃຫ້ເຫັນປະຊາກອນຍ່ອຍທີ່ມີລັກສະນະທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃນແງ່ຂອງຄວາມຖີ່ຂອງ Allele.
chen, et. al.,ເປັຍ, 2020
ກາຍເປັນ
ຕົວກວາດທີ່ເລືອກໃຫ້ກັບຂະບວນການທີ່ເປັນເວັບໄຊທ໌ທີ່ມີປະໂຫຍດສູງແລະຄວາມຖີ່ຂອງການເຊື່ອມໂຍງສະຖານທີ່ທີ່ມີການເຊື່ອມໂຍງແມ່ນເພີ່ມຂື້ນແລະສະຖານທີ່ທີ່ບໍ່ມີສາຍແມ່ນຫຼຸດລົງ, ເຊິ່ງກໍ່ໃຫ້ເກີດການຫຼຸດລົງຂອງພາກພື້ນ.
ການຊອກຄົ້ນຫາທົ່ວໂລກໃນເຂດວາດສະຫນາທີ່ເລືອກໄດ້ໂດຍການຄິດໄລ່ດັດຊະນີພັນທຸກໍາ (π, tajima) ຂອງ SLIDE WIDE (100 KB) ໃນຂັ້ນຕອນທີ່ແນ່ນອນ (10 kb).
ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ Nucleotide (π)
tajima ຂອງງ
ດັດຊະນີ Fixation (FST)
Wu, et. al.,ໂຮງເລໂມເລກະ, 2018
3.Gene ໄຫຼ
Wu, et. al.,ໂຮງເລໂມເລກະ, 2018
4.demographic ປະຫວັດສາດ
Zhang, et. al.,ນິເວດວິທະຍາແລະວິວັດທະນາການ, 2021
5. ທັນເວລາDivergence
Zhang, et. al.,ນິເວດວິທະຍາແລະວິວັດທະນາການ, 2021
ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກຈາກການບໍລິການພັນທຸກໍາວິວັດກໍາລັງຂອງ BMKGENE ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການເກັບຮັກສາ:
Hassanyar, AK et al. (2023) 'ການຄົ້ນພົບເຄື່ອງຫມາຍຂອງ Molecular ແລະຜູ້ສະຫມັກທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມຕ້ານທານໄວຣັດ sacbrood ໃນ sacebrood cerana cerana lerevae ໂດຍ sonquencing ທັງຫມົດ',ວາລະສານສາກົນຂອງວິທະຍາສາດໂມເລກຸນ, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) 'ການຄົ້ນພົບຂອງສັດປ່າທໍາມະຊາດ, ພັນທະເລສາມາດສ້າງໂອກາດການອະນຸລັກໃຫມ່,ການຄົ້ນຄວ້າວິທະຍາ, 2022, vol. 43, ອອກ 3, ຫນ້າ: 469-480, 43 (3), PP 469-480. DOI: 10.24272 / J.issn.2095-8137.2022.102.
Han, M. et al. (2022) 'ຮູບແບບການວິວັດທະນາການແລະປະເທດປະຊາກອນປະຈໍາປະເພດຂອງຊົນເຜົ່າອີເລັກໂທຣນິກ L. ໃນເຂດພູພຽງ Qinghai-tibetan,ຊາຍແດນໃນວິທະຍາສາດພືດ, 13, p. 882601. DOI: 10.3389 / FPLLS.2022.882601 / Bibtex.
Wang, J. et al. (20221)ການຄົ້ນຄວ້າສວນດອກໄມ້ສວນ, 9. DOI: 10.1093 / hr / uhac021.
