●ການຕັ້ງຢູ່ເທິງ Illumina Novaseq ກັບ PE150.
●ການບໍລິການຕ້ອງໃຊ້ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອ, ແທນທີ່ຈະສະກັດອາຊິດ necleic, ເພື່ອເຊື່ອມຕໍ່ກັບການເຊື່ອມໂຍງກັບການເຮັດໃຫ້ທາດໂປຼຕີນຈາກ DNA.
ການທົດລອງ hi-c ມີສ່ວນຮ່ວມໃນການສ້ອມແປງແລະການສ້ອມແປງສິ້ນສຸດລົງດ້ວຍ biotin, ຕິດຕາມດ້ວຍການຫມູນວຽນຂອງຕຸ່ມທີ່ສິ້ນສຸດລົງໃນຂະນະທີ່ຮັກສາການໂຕ້ຕອບ. ຫຼັງຈາກນັ້ນ DNA ແມ່ນດຶງລົງກັບລູກປັດທີ່ຍືດເຍື້ອແລະບໍລິສຸດສໍາລັບການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດຕໍ່ໆໄປ.
●ການຈໍາກັດທີ່ດີທີ່ສຸດໃນການອອກແບບ enzyme: ເພື່ອຮັບປະກັນປະສິດທິພາບສູງ Hi-C ໃນຊະນິດທີ່ແຕກຕ່າງກັນທີ່ມີຄູ່ໂຕ້ຕອບເຖິງ 93%.
●ບັນທຶກການເຜີຍແຜ່ແລະການພິມເຜີຍແຜ່ຢ່າງກວ້າງຂວາງ:BMKGEE ມີປະສົບການທີ່ກ້ວາງຂວາງກັບໂຄງການທີ່ມີປະສົບການທີ່ກວ້າງຂວາງ 2000 ຄົນຈາກ 800 ຊະນິດທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະມີສິດປະຈໍາ. ຫຼາຍກວ່າ 100 ຄະດີທີ່ໄດ້ຮັບການຕີພິມດ້ວຍປັດໃຈຜົນກະທົບສະສົມຂອງຫລາຍກວ່າ 900.
●ທີມງານຊີວະພາບທີ່ມີຄວາມຊໍານານສູງ:ດ້ວຍສິດທິບັດພາຍໃນແລະໂປແກຼມໂປຼແກຼມໂປຼແກຼມໂປຼແກຼມສໍາລັບການທົດລອງ Hi-C ແລະການວິເຄາະຂໍ້ມູນແລະຊອບແວຂໍ້ມູນທີ່ພັດທະນາຕົວເອງ.
●ການສະຫນັບສະຫນູນຫລັງການຂາຍ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍເກີນໄປທີ່ໂຄງການສໍາເລັດດ້ວຍໄລຍະການບໍລິການຫລັງການຂາຍໃນເວລາ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການແກ້ໄຂບັນຫາ, ການຊ່ວຍເຫຼືອ, ແລະ Q & A Sessions ເພື່ອແກ້ໄຂການສອບຖາມທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.
●ອະພິຈານ: ພວກເຮົາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນທີ່ຫຼາກຫຼາຍໃນການຈັດຕັ້ງພັນທຸກໍາທີ່ມີການປ່ຽນແປງທີ່ມີການປ່ຽນແປງແລະປະຕິບັດການວິເຄາະການເພີ່ມຂື້ນທີ່ສອດຄ້ອງກັນ, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໃນໂຄງການຄົ້ນຄ້ວາຫຼາຍໂຄງການ.
ຫໍສະຫມຸດ | ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ | ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນທີ່ແນະນໍາ | ຄວາມລະອຽດສັນຍານ Hi-C |
ຫໍສະຫມຸດ Hi-C | Illumina PE150 | chromatin loop: 150x TAD: 50 ເທົ່າ | loop chromatin: 10kb TAD: 40KB |
ປະເພດຕົວຢ່າງ | ຈໍານວນທີ່ຕ້ອງການ |
ເນື້ອເຍື່ອສັດ | ≥2g |
ເລືອດທັງຫມົດ | ≥2ml |
ເຊື້ອເຫັດ | ≥1g |
ພືດ-ເນື້ອເຍື່ອອ່ອນ | 1g / aliquot, 2-4 aliquotes ແນະນໍາ |
ຈຸລັງວັດທະນະທໍາ | ≥1x107 |
ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
● Data Data qc;
●ການວາງແຜນ Mapping ແລະ Hi-C ຫ້ອງສະຫມຸດ QC: ຄູ່ໂຕ້ຕອບຄູ່ແລະການໂຕ້ຕອບທີ່ຖືກຕ້ອງແລະການປະຕິບັດການເສື່ອມໂຊມຂອງລັດຖະບານ (IDEs);
ripiling ການໂຕ້ຕອບແບບອະນຸຍາດ: ການວິເຄາະ CIS / Trans ແລະ Trans ແລະ Di-C ແຜນທີ່ໂຕ້ຕອບ;
●ການວິເຄາະການແຈກຢາຍເອກະສານ A / B.
●ການກໍານົດ TADS ແລະ Chromatin Loops;
●ການວິເຄາະທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃນອົງປະກອບໂຄງສ້າງທີ່ແຕກຕ່າງກັນ 3D ໃນຕົວຢ່າງແລະຄໍາບັນທຶກທີ່ມີປະໂຫຍດຂອງພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ.
CIS ແລະການໂອນອັດຕາສ່ວນ
ຄວາມຮ້ອນຂອງການໂຕ້ຕອບຂອງໂຄໂມໂຊມລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ
ການແຈກຢາຍ genomee ຂອງຫ້ອງ A / B
ການແຈກຢາຍ genomee ຂອງ chromatin loops
ການເບິ່ງເຫັນຂອງ TADS
ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າໃນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການທີ່ລະບົບ Hi-C ຂອງ BMKGene ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການພິມທີ່ເກັບຮັກສາໄວ້.
Meng, T. et al. (2021) 'ການວິເຄາະຫຼາຍ Omics ແບບປະສົມປະສານຕົວລະບຸ CA2 ເປັນເປົ້າຫມາຍນະວະນິຍາຍສໍາລັບ Chordoma',ອຸປະກອນ Oncology, 23 (10), PP. 1709-1722. DOI: 10.1093 / NEUONC / NOB156.
Xu, L. et al. (2021) 'ການຢຸດເຊົາການລົບລ້າງ 3DEpa prowarmacea sinica b, 11 (10), PP. 3150-3164. DOI: 10.1016 / j.Apsb.2021.03.022.