条形ປ້າຍໂຄສະນາ - 03

ຜະລິດຕະພັນ

ການພົວພັນ Chromatin Hi-C ໂດຍອີງໃສ່

Hi-C ແມ່ນວິທີການທີ່ຖືກອອກແບບມາເພື່ອຈັບເອົາການຕັ້ງຄ່າ Genomic ໂດຍການປະສົມປະສານກັບການໂຕ້ຕອບທີ່ອີງໃສ່ການສອບສວນແລະການເລື່ອນລອຍສູງ. ວິທີການແມ່ນອີງໃສ່ການຂ້າມຜ່ານ chromaldehyde, ຕິດຕາມດ້ວຍການຍ່ອຍອາຫານແລະການແກ້ໄຂຄືນໃຫມ່ທີ່ມີຄວາມສໍາຄັນໃນການເຊື່ອມໂຍງເຂົ້າກັນຈະເປັນຜະລິດຕະພັນທີ່ມີຄວາມສາມາດແຜ່ລາມ. ໂດຍອີງຕາມຜະລິດຕະພັນທີ່ທັນສະໄຫມເຫຼົ່ານີ້, ມັນເປັນໄປໄດ້ທີ່ຈະສຶກສາການຈັດຕັ້ງ 3D ຂອງ Genome. Hi-C ຊ່ວຍໃຫ້ການສຶກສາສ່ວນປະກອບຂອງ genome ທີ່ຖືກບັນຈຸຫນ້ອຍລົງ, ແລະມີຄວາມຍາວຫຼາຍກວ່າເກົ່າ hi-c ຍັງສາມາດຖືກນໍາໃຊ້ເພື່ອລະບຸຄວາມສໍາພັນດ້ານພູມສັນຖານດ້ານພູມສັນຖານ. ມັກຈະມີຄວາມສໍາຄັນໃນອົງປະກອບທີ່ເປັນລະບຽບ. ບໍລິການທີ່ເຮັດໃຫ້ນັກຄົ້ນຄວ້າ Hi-C ຂອງ BMKGene ໃຫ້ສໍາຫຼວດຂະຫນາດທາງກວ້າງຂອງພື້ນທີ່ຂອງ Genomics, ເປີດເສັ້ນທາງໃຫມ່ສໍາລັບຄວາມສາມາດແລະຜົນສະທ້ອນຂອງມັນໃນດ້ານສຸຂະພາບແລະຄວາມຫມາຍ.


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະພາບ

ຜົນໄດ້ຮັບສາທິດ

ສິ່ງພິມທີ່ໂດດເດັ່ນ

ຄຸນນະສົມບັດການບໍລິການ

●ການຕັ້ງຢູ່ເທິງ Illumina Novaseq ກັບ PE150.

●ການບໍລິການຕ້ອງໃຊ້ຕົວຢ່າງເນື້ອເຍື່ອ, ແທນທີ່ຈະສະກັດອາຊິດ necleic, ເພື່ອເຊື່ອມຕໍ່ກັບການເຊື່ອມໂຍງກັບການເຮັດໃຫ້ທາດໂປຼຕີນຈາກ DNA.

ການທົດລອງ hi-c ມີສ່ວນຮ່ວມໃນການສ້ອມແປງແລະການສ້ອມແປງສິ້ນສຸດລົງດ້ວຍ biotin, ຕິດຕາມດ້ວຍການຫມູນວຽນຂອງຕຸ່ມທີ່ສິ້ນສຸດລົງໃນຂະນະທີ່ຮັກສາການໂຕ້ຕອບ. ຫຼັງຈາກນັ້ນ DNA ແມ່ນດຶງລົງກັບລູກປັດທີ່ຍືດເຍື້ອແລະບໍລິສຸດສໍາລັບການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດຕໍ່ໆໄປ.

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

ການຈໍາກັດທີ່ດີທີ່ສຸດໃນການອອກແບບ enzyme: ເພື່ອຮັບປະກັນປະສິດທິພາບສູງ Hi-C ໃນຊະນິດທີ່ແຕກຕ່າງກັນທີ່ມີຄູ່ໂຕ້ຕອບເຖິງ 93%.

ບັນທຶກການເຜີຍແຜ່ແລະການພິມເຜີຍແຜ່ຢ່າງກວ້າງຂວາງ:BMKGEE ມີປະສົບການທີ່ກ້ວາງຂວາງກັບໂຄງການທີ່ມີປະສົບການທີ່ກວ້າງຂວາງ 2000 ຄົນຈາກ 800 ຊະນິດທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະມີສິດປະຈໍາ. ຫຼາຍກວ່າ 100 ຄະດີທີ່ໄດ້ຮັບການຕີພິມດ້ວຍປັດໃຈຜົນກະທົບສະສົມຂອງຫລາຍກວ່າ 900.

ທີມງານຊີວະພາບທີ່ມີຄວາມຊໍານານສູງ:ດ້ວຍສິດທິບັດພາຍໃນແລະໂປແກຼມໂປຼແກຼມໂປຼແກຼມໂປຼແກຼມສໍາລັບການທົດລອງ Hi-C ແລະການວິເຄາະຂໍ້ມູນແລະຊອບແວຂໍ້ມູນທີ່ພັດທະນາຕົວເອງ.

ການສະຫນັບສະຫນູນຫລັງການຂາຍ:ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍເກີນໄປທີ່ໂຄງການສໍາເລັດດ້ວຍໄລຍະການບໍລິການຫລັງການຂາຍໃນເວລາ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການແກ້ໄຂບັນຫາ, ການຊ່ວຍເຫຼືອ, ແລະ Q & A Sessions ເພື່ອແກ້ໄຂການສອບຖາມທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.

ອະພິຈານ: ພວກເຮົາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນທີ່ຫຼາກຫຼາຍໃນການຈັດຕັ້ງພັນທຸກໍາທີ່ມີການປ່ຽນແປງທີ່ມີການປ່ຽນແປງແລະປະຕິບັດການວິເຄາະການເພີ່ມຂື້ນທີ່ສອດຄ້ອງກັນ, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈໃນໂຄງການຄົ້ນຄ້ວາຫຼາຍໂຄງການ.

ຂໍ້ສະເພາະຂອງການບໍລິການ

ຫໍສະຫມຸດ

ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ

ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນທີ່ແນະນໍາ

ຄວາມລະອຽດສັນຍານ Hi-C

ຫໍສະຫມຸດ Hi-C

Illumina PE150

chromatin loop: 150x

TAD: 50 ເທົ່າ

loop chromatin: 10kb

TAD: 40KB

ຄວາມຕ້ອງການບໍລິການ

ປະເພດຕົວຢ່າງ

ຈໍານວນທີ່ຕ້ອງການ

ເນື້ອເຍື່ອສັດ

≥2g

ເລືອດທັງຫມົດ

≥2ml

ເຊື້ອເຫັດ

≥1g

ພືດ-ເນື້ອເຍື່ອອ່ອນ

1g / aliquot, 2-4 aliquotes ແນະນໍາ

ຈຸລັງວັດທະນະທໍາ

≥1x107


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • 图片 98

    ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:

    ● Data Data qc;

    ●ການວາງແຜນ Mapping ແລະ Hi-C ຫ້ອງສະຫມຸດ QC: ຄູ່ໂຕ້ຕອບຄູ່ແລະການໂຕ້ຕອບທີ່ຖືກຕ້ອງແລະການປະຕິບັດການເສື່ອມໂຊມຂອງລັດຖະບານ (IDEs);

    ripiling ການໂຕ້ຕອບແບບອະນຸຍາດ: ການວິເຄາະ CIS / Trans ແລະ Trans ແລະ Di-C ແຜນທີ່ໂຕ້ຕອບ;

    ●ການວິເຄາະການແຈກຢາຍເອກະສານ A / B.

    ●ການກໍານົດ TADS ແລະ Chromatin Loops;

    ●ການວິເຄາະທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃນອົງປະກອບໂຄງສ້າງທີ່ແຕກຕ່າງກັນ 3D ໃນຕົວຢ່າງແລະຄໍາບັນທຶກທີ່ມີປະໂຫຍດຂອງພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ.

    CIS ແລະການໂອນອັດຕາສ່ວນ

    图片 99

     

    ຄວາມຮ້ອນຂອງການໂຕ້ຕອບຂອງໂຄໂມໂຊມລະຫວ່າງຕົວຢ່າງ

    图片 100

     

    ການແຈກຢາຍ genomee ຂອງຫ້ອງ A / B图片 23

     

    ການແຈກຢາຍ genomee ຂອງ chromatin loops

     

    图片 102

     

    ການເບິ່ງເຫັນຂອງ TADS

    图片 103

     

    ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າໃນການຄົ້ນຄວ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການທີ່ລະບົບ Hi-C ຂອງ BMKGene ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການພິມທີ່ເກັບຮັກສາໄວ້.

     

     

    Meng, T. et al. (2021) 'ການວິເຄາະຫຼາຍ Omics ແບບປະສົມປະສານຕົວລະບຸ CA2 ເປັນເປົ້າຫມາຍນະວະນິຍາຍສໍາລັບ Chordoma',ອຸປະກອນ Oncology, 23 (10), PP. 1709-1722. DOI: 10.1093 / NEUONC / NOB156.

    Xu, L. et al. (2021) 'ການຢຸດເຊົາການລົບລ້າງ 3DEpa prowarmacea sinica b, 11 (10), PP. 3150-3164. DOI: 10.1016 / j.Apsb.2021.03.022.

    ໄດ້ຮັບໃບສະເຫນີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານຢູ່ທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານໄປໃຫ້ພວກເຮົາ: