ການຖອດລະຫັດ Pacbio ຢ່າງເຕັມທີ່

ການຈັດລຳດັບ Transcriptome ແບບເຕັມຄວາມຍາວຂອງ PacBio, Isoseq, ຊ່ວຍໃຫ້ສາມາດລະບຸຮູບແບບການຖອດລະຫັດໄດ້ຢ່າງຖືກຕ້ອງ, ເຮັດໃຫ້ເຂົ້າໃຈເຖິງ polyadenylation ແລະ splicing ທາງເລືອກ, ແລະ ນຳໄປສູ່ການວິເຄາະການສະແດງອອກຂອງ gene ທີ່ຖືກຕ້ອງຫຼາຍຂຶ້ນ. ທໍ່ສົ່ງ BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome ຖືກອອກແບບມາເພື່ອວິເຄາະຫ້ອງສະໝຸດ cDNA ທີ່ຖືກຈັດລຳດັບໃນຮູບແບບ Circular Consensus Sequencing (CCS) ແລະ ລະບຸລຳດັບ Full-Length Non-Chimeric (FLNC), ເຊິ່ງຫຼັງຈາກນັ້ນຈະຖືກລວມເຂົ້າກັນເປັນ transcriptome ທີ່ບໍ່ຊ້ຳກັນ. ການວິເຄາະ BUSCO ຕໍ່ມາປະເມີນຄວາມຄົບຖ້ວນຂອງການປະກອບ transcriptome. ຈາກ transcriptome ທີ່ປະກອບແລ້ວ, ການວິເຄາະຫຼາຍຢ່າງແມ່ນໄດ້ປະຕິບັດ: ການຕໍ່ລຳດັບທາງເລືອກ, ການເຮັດຊ້ຳລຳດັບງ່າຍໆ (SSR), ການຄາດຄະເນຂອງ lncRNA ແລະ genes ເປົ້າໝາຍທີ່ສອດຄ້ອງກັນ, ການຄາດຄະເນຂອງ genes ໃໝ່, ການວິເຄາະຄອບຄົວ gene, ການວິເຄາະປັດໄຈການຖອດລະຫັດ, ແລະ ການໝາຍເຫດການເຮັດວຽກຂອງ transcripts.