BMKCloud Log in
条形ປ້າຍໂຄສະນາ-03

ຜະລິດຕະພັນ

ການຈັດລໍາດັບ RNA ແກນດຽວ

ຄວາມກ້າວຫນ້າຂອງການຈັບເຊນດຽວແລະເຕັກນິກການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະຫມຸດສ່ວນບຸກຄົນປະສົມປະສານກັບລໍາດັບທີ່ສົ່ງຜ່ານສູງຊ່ວຍໃຫ້ການສຶກສາການສະແດງອອກຂອງ gene ບົນພື້ນຖານຂອງເຊນຕໍ່ເຊນ.ມັນຊ່ວຍໃຫ້ການວິເຄາະລະບົບທີ່ເລິກເຊິ່ງແລະຄົບຖ້ວນກ່ຽວກັບປະຊາກອນຈຸລັງທີ່ສັບສົນ, ເຊິ່ງສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນຫຼີກເວັ້ນການຫນ້າກາກຂອງ heterogeneity ຂອງພວກມັນໂດຍການເອົາຄ່າສະເລ່ຍຂອງຈຸລັງທັງຫມົດ.

ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ບາງຈຸລັງບໍ່ເຫມາະສົມທີ່ຈະສ້າງເປັນ suspension ຈຸລັງດຽວ, ສະນັ້ນວິທີການກະກຽມຕົວຢ່າງອື່ນໆ - ການສະກັດເອົານິວເຄລຍຈາກເນື້ອເຍື່ອ, ນັ້ນແມ່ນ, ນິວເຄລຍໄດ້ຖືກສະກັດໂດຍກົງຈາກເນື້ອເຍື່ອຫຼືຈຸລັງແລະກະກຽມເຂົ້າໄປໃນ suspension ນິວເຄລຍດຽວສໍາລັບການດຽວ. ການຈັດລໍາດັບຈຸລັງ.

BMK ໃຫ້ບໍລິການຈັດລຽງລຳດັບ RNA ເຊລດຽວຕາມ 10× Genomics ChromiumTM.ການບໍລິການນີ້ໄດ້ຖືກນໍາໃຊ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງໃນການສຶກສາກ່ຽວກັບການສຶກສາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບພະຍາດ, ເຊັ່ນ: ຄວາມແຕກຕ່າງຂອງຈຸລັງພູມຕ້ານທານ, ການສ້າງເນື້ອງອກ, ການພັດທະນາເນື້ອເຍື່ອ, ແລະອື່ນໆ.

ຊິບຖອດຂໍ້ຄວາມຂະໜາດກວ້າງໃຫຍ່: 10× Genomics

ເວທີ: Illumina NovaSeq Platform


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະວິທະຍາ

ຜົນການສາທິດ

ຫຼັກການດ້ານວິຊາການ

ການໂດດດ່ຽວຂອງນິວເຄລຍແມ່ນບັນລຸໄດ້ໂດຍ 10 × Genomics ChromiumTM, ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍລະບົບ microfluidics ແປດຊ່ອງທີ່ມີການຂ້າມສອງເທົ່າ.ໃນລະບົບນີ້, ລູກປັດເຈນທີ່ມີບາໂຄດແລະ primer, enzymes ແລະແກນດຽວແມ່ນ encapsulated ໃນການຫຼຸດລົງນ້ໍາມັນຂະຫນາດ nanoliter, ສ້າງ Gel Bead-in-Emulsion (GEM).ເມື່ອ GEM ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນ, lysis ຈຸລັງແລະການປ່ອຍ barcodes ແມ່ນປະຕິບັດໃນແຕ່ລະ GEM.mRNA ຖືກຖອດຖອນຄືນເປັນໂມເລກຸນ cDNA ດ້ວຍ 10× barcodes ແລະ UMI, ເຊິ່ງຂຶ້ນກັບການກໍ່ສ້າງຫ້ອງສະໝຸດຕາມລຳດັບມາດຕະຖານ.

wps_doc_0
wps_doc_1

ເນື້ອເຍື່ອບໍ່ເໝາະສົມສຳລັບການກະກຽມການລະງັບເຊລດຽວ

ຈຸລັງ / ຈຸລັງ

ເຫດ​ຜົນ

ເນື້ອເຍື່ອແຊ່ແຂງທີ່ບໍ່ສົດ

ບໍ່ສາມາດຮັບເອົາອົງການຈັດຕັ້ງທີ່ສົດໆ ຫຼື ປະຢັດມາດົນໄດ້

ຈຸລັງກ້າມເນື້ອ, ເມກາຄາຣີໂອໄຊ, ໄຂມັນ…

ເສັ້ນຜ່າສູນກາງຂອງເຊນໃຫຍ່ເກີນໄປທີ່ຈະເຂົ້າໄປໃນເຄື່ອງມື

ຕັບ…

ອ່ອນເພຍເກີນໄປທີ່ຈະແຕກ, ບໍ່ສາມາດຈໍາແນກຈຸລັງດຽວ

ເຊລ neuron, ສະໝອງ…

ມີຄວາມອ່ອນໄຫວຫຼາຍ, ງ່າຍຕໍ່ຄວາມກົດດັນ, ຈະປ່ຽນແປງຜົນການລໍາດັບ

ຕ່ອມໄທລອຍ...

ອຸດົມສົມບູນໃນ enzymes endogenous, ຜົນກະທົບຕໍ່ການຜະລິດຂອງ suspension ຈຸລັງດຽວ

Single-nucleus vs Single-cell

ແກນດ່ຽວ

ເຊລດຽວ

ເສັ້ນຜ່າສູນກາງຂອງເຊນບໍ່ຈໍາກັດ

ເສັ້ນຜ່າສູນກາງຂອງເຊນ: 10-40 μm

ວັດສະດຸສາມາດເປັນເນື້ອເຍື່ອ frozen

ວັດສະດຸຕ້ອງເປັນເນື້ອເຍື່ອສົດ

ຄວາມກົດດັນຕ່ໍາຂອງຈຸລັງແຊ່ແຂງ

ການປິ່ນປົວດ້ວຍເອນໄຊອາດເຮັດໃຫ້ເກີດປະຕິກິລິຍາຄວາມກົດດັນຂອງເຊນ

ບໍ່ ຈຳ ເປັນຕ້ອງເອົາເມັດເລືອດແດງອອກ

ເມັດເລືອດແດງຈໍາເປັນຕ້ອງຖືກໂຍກຍ້າຍ

ນິວ​ເຄຼຍ​ສະ​ແດງ​ໃຫ້​ເຫັນ​ຂໍ້​ມູນ​ຊີ​ວະ​ພາບ

ຈຸລັງທັງຫມົດສະແດງຂໍ້ມູນຊີວະພາບ

ຂໍ້ມູນຈໍາເພາະການບໍລິການ

ຫໍສະໝຸດ

ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ

ປະລິມານຂໍ້ມູນ

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ

ເນື້ອເຍື່ອ

10× Genomics ຫ້ອງສະໝຸດນິວເຄລຍດຽວ

10x Genomics -Illumina PE150

100,000 ອ່ານ/ເຊລ ປະມານ.100-200 Gb

ຈໍານວນຕາລາງ: >2×105

Cell conc.ຢູ່ທີ່ 700-1,200 cell/μL

≥ 200 ມກ

ສໍາ​ລັບ​ລາຍ​ລະ​ອຽດ​ເພີ່ມ​ເຕີມ​ກ່ຽວ​ກັບ​ການ​ແນະ​ນໍາ​ການ​ກະ​ກຽມ​ຕົວ​ຢ່າງ​ແລະ​ຂະ​ບວນ​ການ​ການ​ບໍ​ລິ​ການ​, ກະ​ລຸ​ນາ​ສົນ​ທະ​ນາ​ກັບ a

ກະແສວຽກບໍລິການ

ຕົວຢ່າງ QC

ການອອກແບບທົດລອງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

nuclear. suspension

ການໂດດດ່ຽວນິວເຄລຍ

ການ​ກະ​ກຽມ​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ​

ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ

ການຈັດລໍາດັບ

ການຈັດລໍາດັບ

ການ​ວິ​ເຄາະ​ຂໍ້​ມູນ

ການ​ວິ​ເຄາະ​ຂໍ້​ມູນ

ບໍລິການຫລັງການຂາຍ

ບໍລິການຫຼັງການຂາຍ


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • wps_doc_9

    1.ການຈັດກຸ່ມຈຸດ

    wps_doc_10

    2.Marker ການສະແດງອອກ abundance clustering heatmap

    wps_doc_113.Maker ການແຜ່ກະຈາຍ gene ໃນກຸ່ມທີ່ແຕກຕ່າງກັນ

    wps_doc_12

    4.ການວິເຄາະເສັ້ນທາງຂອງເຊນ/ເວລາ pseudotime

    wps_doc_13

     

     

    ໄດ້ຮັບໃບສະເໜີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງເຈົ້າຫາພວກເຮົາ: