●ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ມີການອ້າງອີງ.
● Lambda DNA ຖືກເພີ່ມເຂົ້າໃນການຕິດຕາມປະສິດທິພາບການປ່ຽນໃຈເຫລື້ອມໃສ bisulfite.
●ການຕັ້ງຢູ່ເທິງ Illumina Novaseq.
●ມາດຕະຖານຄໍາສໍາລັບການຄົ້ນຄວ້າ DNA Methylationເຕັກໂນໂລຢີການປຸງແຕ່ງການປ່ຽນແປງຂອງ Methylation ທີ່ແກ່ແລ້ວມີຄວາມຖືກຕ້ອງແລະມີການປ່ຽນແປງທີ່ດີ.
●ການຄຸ້ມຄອງກ້ວາງແລະຄວາມລະອຽດດ້ານຖານສະຖານທີ່:ການຊອກຄົ້ນຫາສະຖານທີ່ methylation ໃນລະດັບທີ່ມີຊີວິດຊີວາ.
●ເວທີສໍາເລັດ:ສະຫນອງການບໍລິການທີ່ດີເລີດຫນຶ່ງດຽວຈາກການປຸງແຕ່ງຕົວຢ່າງ, ການກໍ່ສ້າງຫໍສະມຸດ, ການລໍາລຽງຂອງຫໍສະມຸດ, ລໍາດັບການວິເຄາະດ້ານຊີວະພາບ.
●ຄວາມຊ່ຽວຊານຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ກັບໂຄງການທີ່ມີຄວາມນິຍົມຂອງ WGBS ສໍາເລັດໃນປະເພດຕ່າງໆ, BMKGENE ນໍາເອົາປະສົບການ, ທີມງານວິເຄາະທີ່ມີຄວາມຊໍານິຊໍານານ, ແລະການສະຫນັບສະຫນູນດ້ານຫຼັງທີ່ສົມບູນແບບ.
●ຄວາມເປັນໄປໄດ້ທີ່ຈະເຂົ້າຮ່ວມກັບການວິເຄາະທາງດ້ານການວິເຄາະ: ອະນຸຍາດໃຫ້ມີການວິເຄາະປະສົມປະສານຂອງ WGBS ກັບຂໍ້ມູນ omics ອື່ນໆເຊັ່ນ RNA-SEq.
ຫໍສະຫມຸດ | ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ | ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນທີ່ແນະນໍາ | ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ |
ການປິ່ນປົວ Bisulfite | Illumina PE150 | ຄວາມເລິກ 30x | q30 ≥ 85% ການປ່ຽນໃຈເຫລື້ອມໃສ bisulfite> 99% |
ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ (NG / μL) | ຈໍານວນທັງຫມົດ (μg) | ຄວາມຕ້ອງການເພີ່ມເຕີມ | |
DNA Genomic | ≥ 5 | ≥ 400 ng | ຈໍາກັດການເຊື່ອມໂຊມຫຼືການປົນເປື້ອນ |
ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
●ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບດິບ;
●ການວາງແຜນແຜນທີ່ເພື່ອອ້າງອີງເຖິງການອ້າງອີງ;
●ກວດພົບຖານນ້ໍາ methylated 5mc;
●ການວິເຄາະການແຈກຍາຍ methylation ແລະການບັນຍາຍ;
●ການວິເຄາະເຂດທີ່ບໍ່ມີປະໂຫຍດແຕກຕ່າງກັນ (DMRS);
ancancy ຄໍາບັນທຶກການທີ່ເປັນປະໂຫຍດຂອງພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບ DMRS.
ການຊອກຄົ້ນຫາ methylation 5mc: ປະເພດຂອງສະຖານທີ່ methylated
ແຜນທີ່ methylation. 5mc methylation-genome paidom
ຄໍາບັນທຶກຂອງເຂດທີ່ມີຄວາມຫນາວສູງ
ພາກພື້ນ methylated ທີ່ແຕກຕ່າງກັນ: ພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ
ບັນດາຂົງເຂດທີ່ມີຄວາມສຸກທີ່ແຕກຕ່າງກັນ: ການບັນຍາຍຂອງພັນທຸກໍາທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ (Genterology (Genology)
ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າໃນການຄົ້ນຄ້ວາທີ່ກໍາລັງອໍານວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການທີ່ມີເພດສໍາພັນທີ່ມີເພດສໍາພັນທີ່ມີເພດສໍາພັນໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນການເກັບກ່ຽວ.
ພັດລົມ, y. et al. (2020) 'ການວິເຄາະຂອງ DNA Methylation Profiles ໃນໄລຍະການພັດທະນາກ້າມເນື້ອກະດູກ Sheet Partletal ໂດຍໃຊ້ລໍາດັບ bisulfite ທັງຫມົດBMC Genomics, 21 (1), PP. 1-15. DOI: 10.118186 / S12864-020-6751-6.
Zhao, X. et al. (2022) 'ອະທິບາຍກ່ຽວກັບຄວາມລຶກລັບຂອງອະທິບາຍກ່ຽວກັບຄວາມລຶກລັບໃນການ perturbຄວາມເປັນພິດແລະສຸຂະພາບອຸດສາຫະກໍາ, 38 (7), PP. 377-388. DOI: 10.111777 / 074823373221098900
, Zuo, J. et al. (2020) 'ຄວາມສໍາພັນລະຫວ່າງ methylation genome, ລະດັບຂອງ rnas ທີ່ບໍ່ແມ່ນ coding, mrenas ແລະ metabolites ໃນຫມາກໄມ້ຫມາກເລັ່ນສຸກ',ວາລະສານຕົ້ນໄມ້, 103 (3), PP. 980-994. DOI: 10.11111 / tpj.14778.