条形ປ້າຍໂຄສະນາ-03

ຜະລິດຕະພັນ

ການຈັດລໍາດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມທັງໝົດ - Illumina

ການຈັດລຳດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມທັງໝົດສະເໜີວິທີການທີ່ສົມບູນໃນການສ້າງໂມເລກຸນ RNA ທີ່ຫຼາກຫຼາຍ, ການເຂົ້າລະຫັດ (mRNA) ແລະ RNAs ທີ່ບໍ່ແມ່ນລະຫັດ (lncRNA, circRNA, ແລະ miRNA). ເທັກນິກນີ້ບັນທຶກການຖອດຂໍ້ຄວາມທັງໝົດຂອງເຊລສະເພາະໃນເວລາໃດນຶ່ງ, ອະນຸຍາດໃຫ້ມີຄວາມເຂົ້າໃຈທັງໝົດກ່ຽວກັບຂະບວນການຂອງເຊນ. ເຊິ່ງເອີ້ນກັນວ່າ "ການຈັດລໍາດັບ RNA ທັງໝົດ", ມັນມີຈຸດປະສົງເພື່ອເປີດເຜີຍເຄືອຂ່າຍລະບຽບການທີ່ສັບສົນໃນລະດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມ, ຊ່ວຍໃຫ້ການວິເຄາະໃນຄວາມເລິກເຊັ່ນ RNA endogenous (ceRNA) ແລະການວິເຄາະ RNA ຮ່ວມກັນ. ນີ້ຫມາຍເຖິງບາດກ້າວເບື້ອງຕົ້ນໄປສູ່ການກໍານົດລັກສະນະທີ່ເປັນປະໂຫຍດ, ໂດຍສະເພາະໃນການແກ້ໄຂເຄືອຂ່າຍກົດລະບຽບທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການໂຕ້ຕອບ ceRNA ທີ່ອີງໃສ່ circRNA-miRNA-mRNA.


ລາຍລະອຽດການບໍລິການ

ຊີວະວິທະຍາ

ຜົນການສາທິດ

ສິ່ງພິມທີ່ໂດດເດັ່ນ

ຄຸນສົມບັດ

● ຫ້ອງສະໝຸດຄູ່ເພື່ອຈັດລໍາດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມທີ່ສົມບູນ: ການຫຼຸດ rRNA ຕິດຕາມດ້ວຍການກະກຽມຫ້ອງສະໝຸດ PE150 ແລະການຄັດເລືອກຂະໜາດຕາມດ້ວຍການກະກຽມຫ້ອງສະໝຸດ SE50

● ສໍາເລັດການວິເຄາະຊີວະຂໍ້ມູນຂ່າວສານຂອງ mRNA, lncRNA, circRNA, ແລະ miRNA ໃນບົດລາຍງານ bioinformatics ແຍກຕ່າງຫາກ

● ການວິເຄາະຮ່ວມກັນຂອງການສະແດງອອກ RNA ທັງໝົດໃນບົດລາຍງານລວມ, ລວມທັງການວິເຄາະເຄືອຂ່າຍ ceRNA.

ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ

ການວິເຄາະຄວາມເລິກຂອງເຄືອຂ່າຍກົດລະບຽບ: ການວິເຄາະເຄືອຂ່າຍ ceRNA ຖືກເປີດໃຊ້ໂດຍການຈັດລໍາດັບຮ່ວມກັນຂອງ mRNA, lncRNA, circRNA, ແລະ miRNA ແລະໂດຍຂະບວນການເຮັດວຽກທາງຊີວະພາບທີ່ຄົບຖ້ວນ.

ຄໍາບັນຍາຍທີ່ສົມບູນແບບ: ພວກເຮົາໃຊ້ຖານຂໍ້ມູນຫຼາຍອັນເພື່ອເຮັດໜ້າທີ່ອະທິບາຍຄວາມແຕກຕ່າງກັນຂອງ Genes ສະແດງອອກ (DEGs) ແລະປະຕິບັດການວິເຄາະການເສີມສ້າງທີ່ສອດຄ້ອງກັນ, ໃຫ້ຄວາມເຂົ້າໃຈກ່ຽວກັບຂະບວນການຂອງເຊນລູລາ ແລະໂມເລກຸນທີ່ຕິດພັນກັບການຕອບສະໜອງການຖອດຂໍ້ຄວາມ.

ຊ່ຽວຊານຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ດ້ວຍບັນທຶກການຕິດຕາມການປິດຢ່າງສໍາເລັດຜົນຫຼາຍກວ່າ 2100 ໂຄງການ transcriptome ຢູ່ໃນໂດເມນການຄົ້ນຄວ້າຕ່າງໆ, ທີມງານຂອງພວກເຮົານໍາເອົາປະສົບການທີ່ອຸດົມສົມບູນໃຫ້ກັບທຸກໆໂຄງການ.

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຢ່າງເຂັ້ມງວດ: ພວກເຮົາປະຕິບັດຈຸດຄວບຄຸມຫຼັກໃນທົ່ວທຸກຂັ້ນຕອນ, ຈາກການກະກຽມຕົວຢ່າງ ແລະຫ້ອງສະໝຸດ ຈົນເຖິງການຈັດລໍາດັບ ແລະຊີວະຂໍ້ມູນຂ່າວສານ. ການຕິດຕາມຢ່າງລະມັດລະວັງນີ້ຮັບປະກັນການຈັດສົ່ງຜົນໄດ້ຮັບທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງຢ່າງຕໍ່ເນື່ອງ.

ສະຫນັບສະຫນູນການຂາຍຫລັງ: ຄໍາຫມັ້ນສັນຍາຂອງພວກເຮົາຂະຫຍາຍອອກໄປນອກເຫນືອຈາກການສໍາເລັດໂຄງການທີ່ມີໄລຍະເວລາການບໍລິການຫລັງການຂາຍ 3 ເດືອນ. ໃນລະຫວ່າງເວລານີ້, ພວກເຮົາສະເຫນີການຕິດຕາມໂຄງການ, ການຊ່ວຍເຫຼືອການແກ້ໄຂບັນຫາ, ແລະກອງປະຊຸມ Q&A ເພື່ອແກ້ໄຂຄໍາຖາມໃດໆທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຜົນໄດ້ຮັບ.

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງແລະການຈັດສົ່ງ

ຫໍສະໝຸດ

ຍຸດທະສາດການຈັດລໍາດັບ

ຂໍ້​ມູນ​ແນະ​ນໍາ​

ການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ

rRNA ໝົດ

Illumina PE150

16 Gb

Q30≥85%

ເລືອກຂະໜາດແລ້ວ

Illumina SE50

10-20M ອ່ານ

ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

ປະລິມານ (μg)

ຄວາມບໍລິສຸດ

ຄວາມຊື່ສັດ

≥ 80

≥ 1.6

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

ຈໍາກັດຫຼືບໍ່ມີການປົນເປື້ອນທາດໂປຼຕີນຫຼື DNA ທີ່ສະແດງຢູ່ໃນເຈນ.

RIN≥6.0

5.0≥28S/18S≥1.0;

ຂອບເຂດຈໍາກັດ ຫຼືບໍ່ມີລະດັບຄວາມສູງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງທີ່ແນະນໍາ

ບັນຈຸ: ທໍ່ centrifuge 2 ມລ (ບໍ່ແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ຟອຍກົ່ວ)

ການຕິດສະຫຼາກຕົວຢ່າງ: Group+replicate ເຊັ່ນ: A1, A2, A3; B1, B2, B3.

ການຂົນສົ່ງ:

1. ນ້ຳກ້ອນແຫ້ງ: ຕົວຢ່າງຕ້ອງຖືກບັນຈຸໃສ່ຖົງ ແລະຝັງໄວ້ໃນນ້ຳກ້ອນແຫ້ງ.

2. ທໍ່ RNAstable: ຕົວຢ່າງ RNA ສາມາດຕາກແຫ້ງໃນທໍ່ສະຖຽນລະພາບ RNA (ເຊັ່ນ: RNAstable®) ແລະສົ່ງທີ່ອຸນຫະພູມຫ້ອງ.

ກະແສວຽກບໍລິການ

ຕົວຢ່າງ QC

ການອອກແບບທົດລອງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ

ການທົດລອງທົດລອງ

ການສະກັດເອົາ RNA

ການ​ກະ​ກຽມ​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ​

ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ

ການຈັດລໍາດັບ

ການຈັດລໍາດັບ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ

ບໍລິການຫຼັງການຂາຍ

ບໍລິການຫຼັງການຂາຍ


  • ທີ່ຜ່ານມາ:
  • ຕໍ່ໄປ:

  • ຊີວະວິທະຍາ

    wps_doc_16

    ພາບລວມການສະແດງອອກ RNA

     

     图片41

    genes ສະແດງອອກທີ່ແຕກຕ່າງກັນ

     

    图片42

     

     

    ການວິເຄາະ ceRNA

    图片43          miRNAs ສະແດງອອກທີ່ແຕກຕ່າງກັນແລະ RNAs ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ

    图片44 

     ສຳຫຼວດຄວາມກ້າວໜ້າຂອງການຄົ້ນຄວ້າທີ່ອຳນວຍຄວາມສະດວກໂດຍການບໍລິການຈັດລຳດັບການຖອດຂໍ້ຄວາມທັງໝົດຂອງ BMKGene ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາສິ່ງພິມທີ່ຄັດສັນມາ.

     

    Dai, Y. et al. (2022) 'ການສະແດງອອກທີ່ສົມບູນຂອງ mRNAs, lncRNAs ແລະ miRNAs ໃນພະຍາດ Kashin-Beck ທີ່ລະບຸໂດຍ RNA-sequencing', Molecular Omics, 18(2), ໜ້າ 154–166. doi: 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan et al. (2022) 'ການວິເຄາະການຖອດຂໍ້ຄວາມແບບເຕັມຄວາມຍາວຂອງຄວາມຕ້ານທານຄວາມໜາວຂອງ Apis cerana ໃນພູເຂົາຊາງໄບໃນຊ່ວງລະດູໜາວ.', Gene, 830, ໜ້າ 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization of Competing Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xu, P. et al. (2022) 'ການວິເຄາະແບບປະສົມປະສານຂອງໂປຣໄຟລ໌ການສະແດງອອກ lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA ເປີດເຜີຍຄວາມເຂົ້າໃຈໃໝ່ກ່ຽວກັບກົນໄກທີ່ມີທ່າແຮງໃນການຕອບສະໜອງຕໍ່ຮາກເຫງົ້າໃນຖົ່ວດິນ', BMC Genomics, 23(1), ໜ້າ 1-12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

    Yan, Z. et al. (2022) 'ການຈັດລຽງລຳດັບ RNA ທັງໝົດຊີ້ໃຫ້ເຫັນກົນໄກໂມເລກຸນທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການຮັກສາຄຸນນະພາບຫຼັງການເກັບກ່ຽວໃນຜັກກາດນາດ້ວຍການສາຍແສງ LED ສີແດງ', Postharvest Biology and Technology, 188, p. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    ໄດ້ຮັບໃບສະເໜີລາຄາ

    ຂຽນຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານທີ່ນີ້ແລະສົ່ງໃຫ້ພວກເຮົາ

    ສົ່ງຂໍ້ຄວາມຂອງທ່ານໄປຫາພວກເຮົາ: