Illumina ir BGI
funkcijos
●Platformos:„Illumina NovaSeq 6000“, „NovaSeq“, „HiSeq X Ten“ ir „BGI-DNB-T7“
●Sekos režimai:PE50, PE100, PE150, PE250
●Bibliotekų kokybės kontrolė prieš sekos nustatymą
●Duomenų pateikimo seka ir kokybės užtikrinimas:QC ataskaitos ir neapdorotų duomenų pristatymas fastq formatu po demultipleksavimo ir filtravimo Q30 skaitymai.
Paslaugos privalumai
●Sekvenavimo paslaugų universalumas:klientas gali pasirinkti sekti pagal juostą, srauto langelį arba duomenų kiekį.
●Platformų universalumas:DNB bibliotekos gali būti perkeltos į Illumina platformas
●Didelė patirtis naudojant Illumina sekos platformą:su tūkstančiais uždarytų projektų su įvairiomis rūšimis.
●Sekos kokybės kontrolės ataskaitos pristatymas:su kokybės metrika, duomenų tikslumu ir bendru sekos projekto našumu.
●Brandaus sekos sudarymo procesas:su trumpu apsisukimo laiku.
●Griežta kokybės kontrolė: įgyvendiname griežtus kokybės kontrolės reikalavimus, kad garantuotume nuolat kokybiškų rezultatų pristatymą.
Pavyzdiniai reikalavimai*
Dalinis juostų sekvenavimas
| Duomenų kiekis (X) | Koncentracija (qPCR/nM) | Apimtis |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Viena juosta (Illumina)
| Platforma | Koncentracija (qPCR/nM) | Apimtis |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Be koncentracijos ir bendro kiekio, taip pat reikalingas tinkamas piko modelis.
Susisiekite su mumis, jei jūsų pavyzdžiai neatitinka pradinės medžiagos reikalavimų.
Paslaugos darbo eiga
Bibliotekos kokybės kontrolė
Sekos nustatymas
Duomenų kokybės kontrolė
Projekto pristatymas
Bibliotekos kokybės kontrolės ataskaita
Bibliotekos kokybės ataskaita pateikiama prieš nustatant seką, įvertinant bibliotekos kiekį ir fragmentiškumą.
Sekos kokybės kontrolės ataskaita
1 lentelė. Sekvenavimo duomenų statistika.
| Pavyzdžio ID | BMKID | Neapdoroti skaitiniai | Neapdoroti duomenys (bp) | Švarus skaitymas (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 val |
1 pav. Kokybės pasiskirstymas pagal rodmenis kiekviename pavyzdyje
2 pav. Bazinio turinio paskirstymas
3 pav. Skaitomo turinio pasiskirstymas sekos duomenyse
