BMKCloud Log in
条形baneris-03

Produktai

DNR/RNR sekvenavimas – nanoporų sekvenavimo įrenginys

ONT sekos nustatymas yra vienos molekulės realaus laiko elektrinių signalų sekos nustatymo technologija, pagrįsta nanoporomis, kiekvienos platformos sekos nustatymo principas yra vienodas.Dvigubos grandinės DNR/RNR prisijungs prie nanoporinio baltymo, įterpto į bioplėvelę ir išsivyniojančio po motorinio baltymo švinu, veikiant įtampos skirtumui iš abiejų bioplėvelės pusių, DNR/RNR grandinės pereina per nanoporinio kanalo baltymą tam tikru momentu. norma.Dėl skirtingų DNR/RNR grandinės bazių cheminių savybių skirtumų, kai viena bazė ar DNR molekulė praeina per nanoporų kanalą, tai sukels skirtingų elektrinių signalų pasikeitimą.Aptikus ir atitinkančius šiuos signalus, galima apskaičiuoti atitinkamus bazinius tipus ir užbaigti sekos aptikimą realiuoju laiku.


Paslaugos informacija

Demo rezultatas

Paslaugos informacija Funkcijos

Platforma

Bibliotekos dydis

Teorinė duomenų išeiga (vienoje ląstelėje)

Vieno pagrindo tikslumas

Programos

Nanoporas

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNR-PGR

70-90 Gb / mobilusis

85–92 proc.

SV iškvietimas, de novo, viso ilgio sekos nustatymas, Iso-Seq, genų anotacija, DNR metilinimo aptikimas

Paslaugos privalumai

● Daugiau nei 5 metų patirtis naudojant PacBio sekos nustatymo platformą su tūkstančiais uždarytų projektų su įvairiomis rūšimis.
● BMKGENE yra oficialus Oxford Nanopore partneris, turintis dvigubos platformos RNR/DNR sertifikatą.
● Yra pagrindinių sekvencerių modelių su visa įranga ir pakankamu sekos pralaidumu.
● Remiantis Nanopore platforma, daugiau nei 10 gyvūnų ir augalų Denovo tyrimų buvo paskelbti tarptautiniu mastu žinomuose žurnaluose.

Pavyzdiniai reikalavimai


Mėginio tipas

Suma

Koncentracija (Qubit®)

Apimtis

Grynumas

Kiti

Genominė DNR

Priklauso nuo duomenų reikalavimų

 ≥20ng/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Skaidri smailė ties 260 nm, nėra užteršimo

Koncentraciją reikia matuoti pagal Qubit ir Qubit/Nanopore ≤ 2

Bendra RNR

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;jokio užteršimo

RIN reikšmė ≥7,5

 

Paslaugos darbo eiga

mėginio paruošimas

Mėginio paruošimas

Bibliotekos paruošimas

Bibliotekos statyba

Sekos nustatymas

Sekos nustatymas

Duomenų analizė

Duomenų analizė

QC pavyzdys

Projekto pristatymas


  • Ankstesnis:
  • Kitas:

  • DNR mėginio duomenų kokybės įvertinimas

    1 lentelė. Švarių duomenų statistika.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    CleanSumBase

    švarusN50Len

    švarusN90Len

    cleanMeanLen

    CleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1 218 239

    26.37 val

    1 121 736

    25.90

    28 014

    15 764

    23 090

    143 181

    9

    RNR mėginio duomenų kokybės įvertinimas

    1 lentelė. Švarių duomenų statistika.

    Failo pavadinimas

    Kliento ID

    Skaitytas skaičius

    Bazinis skaičius

    N50

    Vidutinis Ilgis

    Didžiausias ilgis

    Vidutinis Q balas

    RNA_BMK001

    C2

    8 947 708

    4 047 230 083

    398

    452

    129 227

    Q12

    1 pav. Nuskaitykite ilgio pasiskirstymą

    A3

    2 pav. Švarių duomenų kokybės balo pasiskirstymas

    A4

    3 pav. Švarių duomenų ilgio ir kokybės balų pasiskirstymas

    A5

    gauti citatą

    Parašykite savo žinutę čia ir atsiųskite mums

    Siųskite mums savo žinutę: