Produktai

Grybelinis genomas

„Biomarker Technologies“ teikia grybelio genomo tyrimą, smulkų genomą ir visą penės genomą, priklausomai nuo konkretaus tyrimo tikslo.Genomo seką, surinkimą ir funkcines anotacijas galima pasiekti derinant naujos kartos sekos ir trečios kartos sekos nustatymą, kad būtų pasiektas aukšto lygio genomo surinkimas.Hi-C technologija taip pat gali būti naudojama siekiant palengvinti genomo surinkimą chromosomų lygiu.

Platforma:„PacBio“ tęsinys II

Nanopore PromethION P48

„Illumina NovaSeq“ platforma

Susisiekite su mumis

Paslaugos informacija

Demonstraciniai rezultatai

Paslaugos privalumai

● Galimos kelios sekos nustatymo strategijos skirtingiems tyrimo tikslams

● Didelė patirtis grybų genomo surinkimo srityje, surinkta daugiau nei 10 000 penių viso genomo.

● Profesionali techninės pagalbos komanda po pardavimo, tenkinanti konkretesnius tyrimų poreikius.

Paslaugos specifikacijos

Aptarnavimas	Sekos nustatymo strategija	Kokybė garantuota	Numatomas apsisukimo laikas
Gražus grybų žemėlapis	Illumina 50X+Nanopore 100X	Tęsinys N50≥2 Mb	35 darbo dienos
Gražus grybų žemėlapis	PacBio HiFi 30X	Tęsinys N50≥2 Mb	35 darbo dienos
Grybelių pene pilnas žemėlapis	„Illumina 50X“ + „Nanopore 100X“ (Pacbio HiFi 30X) + „Hi-C 100X“	Chromosomų tvirtinimo koeficientas >90 %	45 darbo dienos

Bioinformatinės analizės

● Neapdorotų duomenų kokybės kontrolė

● Genomo surinkimas

● Genomo komponentų analizė

● Genų funkcijos anotacija

● Lyginamoji genomo analizė

Pavyzdžių reikalavimai ir pristatymas

Pavyzdiniai reikalavimai:

DėlDNR ekstraktai:

Mėginio tipas	Suma	Koncentracija	Grynumas
DNR ekstraktai	＞ 1,2 μg	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Audinių mėginiams:

Mėginio tipas

Rekomenduojamas mėginio apdorojimas

Mėginių saugojimas ir siuntimas

Vienaląstis grybelis

Stebėkite mieles mikroskopu ir surinkite jas eksponentinėje fazėje

Perkelkite kultūrą (kuriame yra maždaug 3-4,5e9 ląstelės) į 1,5 arba 2 ml eppendorf.(Laikykite ant ledo)

Centrifuguokite mėgintuvėlį 1 minutę esant 14 000 g, kad surinktumėte bakterijas ir atsargiai pašalintumėte supernatantą

Uždarykite mėgintuvėlį ir užšaldykite bakterijas skystame azote bent 1-3 val.Vamzdelį laikykite -80 ℃ šaldytuve.

Mėginius užšaldykite skystame azote 3-4 valandas ir laikykite skystame azote arba -80 laipsnių temperatūroje iki ilgalaikės rezervacijos.Būtinas pavyzdinis siuntimas su sausu ledu.

Makro grybelis

Rekomenduojamas audinys aktyvaus augimo fazėje.

Nuplaukite audinį vandeniu be endotoksinų, tada 70% etonalo.

Išsaugokite mėginį kriogeniniuose mėgintuvėliuose.