Pabrėžia
Į šį dviejų valandų internetinį seminarą mums didelė garbė pakviesti šešis pasėlių genomikos arenos ekspertus.Mūsų pranešėjai išsamiai interpretuos du Rye genominius tyrimus, kurie neseniai buvo paskelbtiGamtos genetika:
1. Chromosomų masto genomo surinkimas suteikia įžvalgų apie rugių biologiją, evoliuciją ir agronominį potencialą
2. Aukštos kokybės genomo rinkinys išryškina rugių genomines savybes ir agronomiškai svarbius genus
Be to, džiaugiamės, kad Biomarker Technologies vyresnysis MTTP mokslininkas pasidalins savo patirtimi de novo genomo surinkimo srityje.
Dienotvarkė
09:00 CET
Sveikinimo pastabos
Zheng Hong-kun
„Biomarker Technologies“ įkūrėjas ir generalinis direktorius
Deng Xing-wang
Pekino universiteto Aukštųjų žemės ūkio mokslų mokyklos prezidentas
09:15 val
Rugių, kvietrugių ir kviečių gerinimas naudojant aukštos kokybės etaloninę genomo seką
Šiame internetiniame seminare prof. Wang pateikė mums bendrą naujausią informaciją apie dabartinę kvietrugių genominių tyrimų būklę ir pademonstravo dviejų išskirtinių darbų, susijusių su rugių genomo tyrimais, sėkmę ir proveržį, kurie neseniai buvo paskelbti „Nature Genetics“ ir pristato visą tyrimą. grupės, vadovaujančios ir prisidedančios prie darbų.
09:25 val
Grūdų genomika @ IPK Gatersleben
Triticeae genties javų žolės buvo pagrindinis maisto šaltinis vidutinio klimato regionuose, kurie ilgą laiką buvo laikomi pasėlių gerinimo ir veisimo tašku.Tarp visų auginamų rūšių ši gentis garsėja itin sudėtingomis genominėmis ypatybėmis, įskaitant didelius genomo dydžius, didelį TE kiekį, poliploidiją ir kt. Šioje sesijoje prof. Nilsas Steinas bendrai supažindino su IPK Gaterslebenu ir dabartine javų būsena. genomic research@IPK Gatersleben.
09:35 val
Chromosomų masto genomo surinkimas suteikia įžvalgų apie rugių biologiją, evoliuciją ir agronominį potencialą
Dr. M. Timothy Rabanus-Wallace, Leibnizo augalų genetikos ir pasėlių planų tyrimų institutas (IPK)Rugiai (Secale cereale L.) yra išskirtinai atsparūs klimatui javų pasėliai, plačiai naudojami patobulintoms kviečių veislėms auginti introgresyvios hibridizacijos būdu ir turintis visą genų, reikalingų hibridiniam veisimui, repertuarą.Rugiai yra alogamiški ir tik neseniai prijaukinti, todėl auginami rugiai gali patekti į įvairų ir išnaudojamą laukinį genofondą.Siekdami dar labiau padidinti rugių agronominį potencialą, sukūrėme 7,9 Mbp rugių genomo anotuotą chromosomų masto rinkinį ir plačiai patvirtinome jo kokybę naudodami molekulinių genetinių išteklių rinkinį.Mes demonstruojame šio ištekliaus pritaikymą įvairiais tyrimais.Pateikiame išvadas apie auginamų rugių nepilną genetinę izoliaciją nuo laukinių giminaičių, genomo struktūros evoliucijos mechanizmus, atsparumą patogenams, atsparumą žemai temperatūrai, hibridinio veisimo vaisingumo kontrolės sistemas ir rugių ir kviečių introgresijų derliaus naudą.
10:05 val
Aukštos kokybės genomo rinkinys išryškina rugių genomines savybes ir agronomiškai svarbius genus
Rugiai yra vertingas maistinis ir pašarinis augalas, svarbus genetinis kviečių ir kvietrugių gerinimo šaltinis ir nepakeičiama medžiaga veiksmingiems lyginamiesiems žolių genomikos tyrimams.Čia mes sekvenavome Weining rugių, elitinės Kinijos rugių veislės, genomą.Surinkti kontigai (7,74 Gb) sudarė 98,47% apskaičiuoto genomo dydžio (7,86 Gb), o 93,67% kontigų (7,25 Gb) buvo priskirti septynioms chromosomoms.Pasikartojantys elementai sudarė 90,31% surinkto genomo.Palyginti su anksčiau sekvenuotais Triticeae genomais, Daniela, Sumaya ir Sumana retrotransposonai stipriai išaugo rugiuose.Tolesnė Weining surinkimo analizė atskleidė naujos informacijos apie genomo masto genų dubliavimą ir jų poveikį krakmolo biosintezės genams, sudėtingų prolamino lokusų fizines organizacijas, genų ekspresijos ypatybes, kurios yra pagrindinės ankstyvosios galvos savybės, ir numanomus su prijaukinimu susijusius chromosomų regionus ir lokusus rugiuose.Ši genomo seka žada paspartinti rugių ir susijusių javų kultūrų genomiką ir veisimo tyrimus.
10:35 val
Genomo de novo surinkimo iššūkiai, sprendimai ir ateitis
Aukštos kokybės genomas yra genomo tyrimo pagrindas.Nors sparti sekos nustatymo ir algoritmų raida suteikė galimybę daug paprastesniam ir efektyvesniam genomo surinkimui, didėjant tyrimų tikslams, didėja ir surinkimo tikslumo bei išsamumo reikalavimai.Šiame pokalbyje aptarsiu dabartines populiarias genomo surinkimo technologijas su keliais sėkmingais atvejais ir pažvelgsiu į būsimą plėtrą.
Paskelbimo laikas: 2022-08-08