BMKCloud Log in
条形baneris-03

Produktai

Vieno branduolio RNR sekos nustatymas

Vienos ląstelės fiksavimo ir individualios bibliotekos kūrimo technikos pažanga, derinant su didelio našumo sekos nustatymu, leidžia atlikti genų ekspresijos tyrimus kiekvienoje ląstelėje.Tai leidžia atlikti gilesnę ir išsamesnę sudėtingų ląstelių populiacijų sistemos analizę, kurioje iš esmės išvengiama jų heterogeniškumo maskavimo, atsižvelgiant į visų ląstelių vidurkį.

Tačiau kai kurios ląstelės nėra tinkamos gaminti vienaląstę suspensiją, todėl reikalingi kiti mėginio paruošimo būdai – branduolio ekstrahavimas iš audinių, tai yra, branduolys yra tiesiogiai ekstrahuojamas iš audinių ar ląstelės ir ruošiamas į vieno branduolio suspensiją, skirtą vienaląstelei. ląstelių sekos nustatymas.

BMK teikia 10× Genomics ChromiumTM pagrįstą vienos ląstelės RNR sekos nustatymo paslaugą.Ši paslauga buvo plačiai naudojama tiriant su ligomis susijusius tyrimus, tokius kaip imuninių ląstelių diferenciacija, naviko heterogeniškumas, audinių vystymasis ir kt.

Erdvinis transkripto lustas: 10 × genomika

Platforma: „Illumina NovaSeq“ platforma


Paslaugos informacija

Bioinformatika

Demonstraciniai rezultatai

Techninis principas

Branduolius izoliuoja 10× Genomics ChromiumTM, susidedanti iš aštuonių kanalų mikroskysčių sistemos su dvigubomis kryžmėmis.Šioje sistemoje gelio granulės su brūkšniniais kodais ir gruntu, fermentais ir vienu branduoliu yra įdėtos į nanolitro dydžio aliejaus lašą, sukuriant gelio granules emulsijoje (GEM).Kai susidaro GEM, kiekviename GEM atliekama ląstelių lizė ir brūkšninių kodų išleidimas.mRNR yra atvirkštinis transkribavimas į cDNR molekules su 10 × brūkšniniais kodais ir UMI, kurioms toliau taikoma standartinė sekos bibliotekos konstrukcija.

wps_doc_0
wps_doc_1

Audinys netinka vienos ląstelės suspensijai ruošti

Ląstelė / audinys

Priežastis

Nešvieži šaldyti audiniai

Nepavyko gauti naujų arba ilgai išsaugotų organizacijų

Raumenų ląstelė, megakariocitai, riebalai…

Ląstelės skersmuo per didelis, kad būtų galima patekti į instrumentą

Kepenys…

Per trapus, kad sulaužytų, negali atskirti pavienių ląstelių

Neuroninė ląstelė, smegenys…

Jautresnis, lengvai įtempiamas, pakeis sekos rezultatus

Kasa, skydliaukė…

Gausu endogeninių fermentų, turinčių įtakos vienos ląstelės suspensijos gamybai

Vieno branduolio vs vienaląstė

Vienbranduolis

Vienaląstė

Neribotas ląstelės skersmuo

Ląstelės skersmuo: 10-40 μm

Medžiaga gali būti užšaldytas audinys

Medžiaga turi būti šviežių audinių

Mažas šaldytų ląstelių stresas

Gydymas fermentais gali sukelti ląstelių streso reakciją

Nereikia pašalinti raudonųjų kraujo kūnelių

Raudonieji kraujo kūneliai turi būti pašalinti

Branduolinė išreiškia bioinformaciją

Visa ląstelė išreiškia bioinformaciją

Paslaugos specifikacijos

biblioteka

Sekos nustatymo strategija

Duomenų apimtis

Pavyzdiniai reikalavimai

Audinys

10 × Genomics vieno branduolio biblioteka

10x Genomics -Illumina PE150

Apytiksliai 100 000 nuskaitymų per langelį.100-200 Gb

Ląstelių skaičius: >2×105

Ląstelės konc.esant 700-1200 ląstelių/μL

≥ 200 mg

Norėdami gauti daugiau informacijos apie pavyzdžių paruošimo gaires ir aptarnavimo darbo eigą, nedvejodami kreipkitės į a

Aptarnavimo darbų eiga

QC pavyzdys

Eksperimento dizainas

pavyzdžio pristatymas

Mėginio pristatymas

branduolinis.pakaba

Branduolio izoliacija

Bibliotekos paruošimas

Bibliotekos statyba

Sekos nustatymas

Sekos nustatymas

Duomenų analizė

Duomenų analizė

Paslaugos po pardavimo

Paslaugos po pardavimo


  • Ankstesnis:
  • Kitas:

  • wps_doc_9

    1.Taškų grupavimas

    wps_doc_10

    2. Žymeklio išraiškos gausos klasterizacijos šilumos žemėlapis

    wps_doc_113.Maker genų pasiskirstymas skirtinguose klasteriuose

    wps_doc_12

    4.Ląstelės trajektorijos analizė/pseudolaikas

    wps_doc_13

     

     

    gauti citatą

    Parašykite savo žinutę čia ir atsiųskite mums

    Siųskite mums savo žinutę: