-
Viso ilgio mRNR sekos nustatymas-Nanopore
RNR sekos nustatymas buvo neįkainojama išsamios transkripto analizės priemonė.Be jokios abejonės, tradicinė trumpo skaitymo seka čia pasiekė daug svarbių pokyčių.Nepaisant to, jis dažnai susiduria su viso ilgio izoformų identifikavimo, kiekybinio nustatymo ir PGR šališkumo apribojimais.
Nanoporų sekos nustatymas iš kitų sekos nustatymo platformų išsiskiria tuo, kad nukleotidai nuskaitomi tiesiogiai be DNR sintezės ir sukuria ilgą skaitymą dešimtimis kilobazių.Tai leidžia tiesiogiai nuskaityti viso ilgio nuorašus ir spręsti iššūkius atliekant izoformų lygmens tyrimus.
Platforma：Nanopore PromethION
Biblioteka:cDNR-PGR
-
De novo Viso ilgio transkripto sekos nustatymas - PacBio
De novoviso ilgio transkripto seka, dar žinoma kaipDe novoIso-Seq pasinaudoja PacBio sekvencinio skaitymo ilgio pranašumais, kurie leidžia be jokių pertraukų nustatyti viso ilgio cDNR molekulių seką.Taip visiškai išvengiama klaidų, atsirandančių atliekant transkripcijos surinkimo veiksmus, ir sukuriami vienetiniai rinkiniai su izoformos lygio skiriamąja geba.Šie unigeniniai rinkiniai suteikia galingą genetinę informaciją kaip „atskaitinį genomą“ transkripto lygiu.Be to, derinant su naujos kartos sekos duomenimis, ši paslauga suteikia galimybę tiksliai kiekybiškai įvertinti izoformos lygio išraišką.
Platforma: PacBio Sequel IIBiblioteka: SMRT varpų biblioteka -
Eukariotinės mRNR sekos nustatymas - Illumina
mRNR sekos nustatymas leidžia profiliuoti visas mRNR, transkribuotas iš ląstelių tam tikromis sąlygomis.Tai galinga technologija, atskleidžianti genų ekspresijos profilį, genų struktūras ir tam tikrų biologinių procesų molekulinius mechanizmus.Iki šiol mRNR sekos nustatymas buvo plačiai naudojamas fundamentiniuose tyrimuose, klinikinėje diagnostikoje, vaistų kūrime ir kt.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Nereferencinis mRNR sekos nustatymas-Illumina
iRNR sekos nustatymas naudoja naujos kartos sekos nustatymo techniką (NGS), kad gautų pasiuntinio RNR (mRNR) iš eukarioto tam tikru laikotarpiu, kai aktyvuojamos kai kurios specialios funkcijos.Ilgiausias transkriptas buvo vadinamas „Unigene“ ir buvo naudojamas kaip etaloninė seka tolesnei analizei, kuri yra veiksminga priemonė tirti rūšies molekulinį mechanizmą ir reguliavimo tinklą be nuorodos.
Po transkripto duomenų surinkimo ir unigeninės funkcinės anotacijos
(1) Bus atlikta SNP analizė, SSR analizė, CDS prognozė ir genų struktūra.
(2) Bus atliktas kiekvieno mėginio unigeninės ekspresijos kiekybinis įvertinimas.
(3) Skirtingai išreikšti unigenai tarp mėginių (arba grupių) bus aptikti remiantis unigenine išraiška
(4) Bus atlikta skirtingai išreikštų unigenų klasterizavimas, funkcinė anotacija ir sodrinimo analizė.
-
Ilgas nekoduojantis sekvenavimas-Illumina
Ilgos nekoduojančios RNR (lncRNR) yra RNR molekulių tipas, kurių ilgis viršija 200 nt, kurioms būdingas itin mažas kodavimo potencialas.LncRNR, kaip pagrindinis nekoduojančių RNR narys, daugiausia randamas branduolyje ir plazmoje.Sekvenavimo technologijos ir bioinformtikos plėtra leidžia identifikuoti daugybę naujų lncRNR ir susieti jas su biologinėmis funkcijomis.Kaupiamieji įrodymai rodo, kad lncRNR plačiai dalyvauja epigenetiniame reguliavime, transkripcijos reguliavime ir reguliavime po transkripcijos.
-
Mažos RNR sekos nustatymas-Illumina
Maža RNR reiškia nekoduojančių RNR molekulių, kurios paprastai yra trumpesnės nei 200 nt, klasę, įskaitant mikro RNR (miRNR), mažą interferencinę RNR (siRNR) ir su piwi sąveikaujančią RNR (piRNR).
MikroRNR (miRNR) yra endogeninės mažos RNR, kurios ilgis yra apie 20–24 nt, klasė, kuri atlieka įvairius svarbius reguliavimo vaidmenis ląstelėse.miRNR dalyvauja daugelyje gyvybės procesų, kurie atskleidžia specifinę ir stadijos specifinę audinių ekspresiją ir yra labai konservuoti įvairiose rūšyse.
-
cirRNR sekos nustatymas-Illumina
Visas transkripto sekos nustatymas skirtas visų tipų RNR molekulėms, įskaitant koduojančias (mRNR) ir nekoduojančias RNR (įskaitant lncRNR, cirRNR ir miRNR), kurias tam tikru laiku transkribuoja specifinės ląstelės, profiliuoti.Viso transkripto sekos nustatymas, taip pat žinomas kaip „bendras RNR sekos nustatymas“, skirtas atskleisti išsamius reguliavimo tinklus transkripto lygiu.Naudojant NGS technologiją, ceRNR analizei ir bendrai RNR analizei yra prieinamos visų transkripto produktų sekos, o tai yra pirmasis žingsnis funkcinio charakterizavimo link.Atskleidžiamas cirRNR-miRNR-mRNR pagrįstas ceRNR reguliavimo tinklas.
-
Visa transkripto seka – Illumina
Visas transkripto sekos nustatymas skirtas visų tipų RNR molekulėms, įskaitant koduojančias (mRNR) ir nekoduojančias RNR (įskaitant lncRNR, cirRNR ir miRNR), kurias tam tikru laiku transkribuoja specifinės ląstelės, profiliuoti.Viso transkripto sekos nustatymas, taip pat žinomas kaip „bendras RNR sekos nustatymas“, skirtas atskleisti išsamius reguliavimo tinklus transkripto lygiu.Naudojant NGS technologiją, ceRNR analizei ir bendrai RNR analizei yra prieinamos visų transkripto produktų sekos, o tai yra pirmasis žingsnis funkcinio charakterizavimo link.Atskleidžiamas cirRNR-miRNR-mRNR pagrįstas ceRNR reguliavimo tinklas.
-
Prokariotų RNR sekos nustatymas
Prokariotinės RNR sekos nustatymas naudoja naujos kartos sekos nustatymą (NGS), kad atskleistų RNR buvimą ir kiekį tam tikru momentu, analizuojant kintantį ląstelių transkriptą.Mūsų įmonės prokariotinės RNR sekos nustatymas yra skirtas prokariotams su etaloniniais genomais, suteikiant jums transkripto profiliavimą, genų struktūros analizę ir kt. Jis buvo plačiai taikomas fundamentiniams tyrimams, vaistų tyrimams ir plėtrai ir kt.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranskripto sekvenavimas
Metatranskripto sekos nustatymas identifikuoja mikrobų (tiek eukariotų, tiek prokariotų) genų ekspresiją natūralioje aplinkoje (ty dirvožemyje, vandenyje, jūroje, išmatose ir žarnyne). Konkrečiai, šios paslaugos leidžia gauti visą sudėtingų mikrobų bendruomenių genų ekspresijos profilį, taksonominę analizę. rūšių, skirtingai išreikštų genų funkcinio praturtinimo analizė ir kt.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
